Skip to main content

Table 1 Empirical FDR from N = 1000 simulations with B = 1000 permutations for each simulation data set

From: Sample size calculation for microarray experiments with blocked one-way design

    n
m 1 q* 10 30 50
40 (1, 0, -1) 0.05 0.1766 0.0921 0.0925
   0.1 0.1819 0.1647 0.1705
   0.2 0.2736 0.2462 0.2506
   0.3 0.3636 0.3478 0.3512
   0.4 0.4546 0.4449 0.4431
   0.5 0.5435 0.5389 0.5399
  (1, -2, 1) 0.05 0.0936 0.0899 0.0915
   0.1 0.1619 0.1663 0.1665
   0.2 0.2402 0.2498 0.2421
   0.3 0.3373 0.3469 0.3461
   0.4 0.4347 0.4481 0.4421
   0.5 0.5318 0.5446 0.5340
200 (1, 0, -1) 0.05 0.0653 0.0573 0.0603
   0.1 0.1120 0.1093 0.1130
   0.2 0.2076 0.2105 0.2146
   0.3 0.3079 0.3086 0.3176
   0.4 0.4070 0.4056 0.4171
   0.5 0.5051 0.5013 0.5162
  (1, -2, 1) 0.05 0.0567 0.0554 0.0591
   0.1 0.1108 0.1079 0.1111
   0.2 0.2142 0.2061 0.2116
   0.3 0.3120 0.3052 0.3113
   0.4 0.4124 0.4049 0.4148
   0.5 0.5141 0.5010 0.5162