Table 2 Univariate results by logistic regression, training and test sets combined.

β

P

β

P

β

P

Height

3.95E - 01

1.16E - 20

4.88E - 01

7.93E - 27

8.88E - 01

6.47E - 117

Relative height

7.14E - 02

3.36E - 17

9.34E - 02

9.75E - 26

1.64E - 01

7.79E - 102

Break

-3.43E - 01

1.06E - 24

-3.39E - 01

2.47E - 26

-3.42E - 01

3.33E - 36

Close to other candidates

-1.19E + 00

2.17E - 32

-8.06E - 01

6.78E - 17

-1.17E + 00

1.19E - 37

Overlap with CNAs

-7.10E - 02

1.24E - 26

-6.67E - 02

6.88E - 25

-5.07E - 02

9.44E - 22

Database score

3.06E - 01

4.08E - 306

3.06E - 01

1.98E - 323

2.27E - 01

8.60E - 186

Database score II

9.79E - 03

3.19E - 159

9.35E - 03

2.16E - 167

5.90E - 03

5.25E - 74

Overlap w. other pts: %

8.89E + 00

4.98E - 254

8.02E + 00

8.64E - 276

5.45E + 00

1.71E - 158

Matching bkpt in other: %

17.31

2.58E - 276

13.13

1.11E - 246

9.14

3.62E - 178

Overlap w. other pts - GG

3.42E - 01

3.63E - 199

3.37E - 01

1.04E - 208

-1.70E - 01

6.08E - 258

LG

2.85E + 00

2.85E + 00

2.29E + 00

LL

1.68E + 00

1.73E + 00

2.13E + 00

Closeness to centromere

8.41E - 01

2.55E - 09

7.98E - 01

2.72E - 09

7.15E - 02

5.95E - 01

Closeness to telomere

4.24E - 01

2.15E - 04

5.78E - 01

2.46E - 07

-1.55E - 01

1.27E - 01

Length

-2.46E - 06

2.14E - 130

-1.78E - 06

9.65E - 94

-2.65E - 06

1.27E - 183

Dat. score of other cand.

5.98E - 02

6.69E - 17

5.45E - 02

9.41E - 14

5.17E - 02

9.02E - 11

Percent of Normal

3.40E + 00

5.29E - 59

2.70E + 00

3.35E - 50

2.78E + 00

1.72E - 60

Segmental duplication

6.81E - 01

5.71E - 11

7.16E - 01

1.51E - 13

1.79E - 01

5.85E - 02

Sign

-2.74E - 01

5.10E - 14

-2.62E - 01

2.73E - 13

-7.05E - 01

2.06E - 107

Surrounded by Normals

1.30E + 00

2.28E - 23

1.07E + 00

5.02E - 23

1.31E + 00

7.06E - 32