TY - JOUR AU - Lagos-Quintana, M. AU - Rauhut, R. AU - Yalcin, A. AU - Meyer, J. AU - Lendeckel, W. AU - Tuschl, T. PY - 2002 DA - 2002// TI - Identification of tissue-specific microRNAs from mouse JO - Curr Biol VL - 12 UR - https://doi.org/10.1016/S0960-9822(02)00809-6 DO - 10.1016/S0960-9822(02)00809-6 ID - Lagos-Quintana2002 ER - TY - JOUR AU - Lau, N. C. AU - Lim, L. AU - Weinstein, E. AU - Bartel, D. PY - 2001 DA - 2001// TI - An abundant class of tiny RNAs with probable regulatory roles in Caenorhabditis elegans JO - Science VL - 294 UR - https://doi.org/10.1126/science.1065062 DO - 10.1126/science.1065062 ID - Lau2001 ER - TY - JOUR AU - Lee, R. AU - Ambros, V. PY - 2001 DA - 2001// TI - An extensive class of small RNAs in Caenorhabditis elegans JO - Science VL - 94 UR - https://doi.org/10.1126/science.1065329 DO - 10.1126/science.1065329 ID - Lee2001 ER - TY - JOUR AU - Bartel, D. AU - Chen, C. PY - 2004 DA - 2004// TI - Micromanagers of gene expression: the potentially widespread influence of metazoan microRNAs JO - Nat Rev Genet VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/nrg1328 DO - 10.1038/nrg1328 ID - Bartel2004 ER - TY - JOUR AU - Harfe, B. PY - 2005 DA - 2005// TI - MicroRNAs in vertebrate development JO - Curr Opin Genet Dev VL - 15 UR - https://doi.org/10.1016/j.gde.2005.06.012 DO - 10.1016/j.gde.2005.06.012 ID - Harfe2005 ER - TY - JOUR AU - Reinhart, B. AU - Slack, F. AU - Basson, M. AU - Pasquinelli, A. AU - Bettinger, J. AU - Rougvie, A. AU - Horvitz, H. AU - Ruvkun, G. PY - 2000 DA - 2000// TI - The 21-nucleotide let-7 RNA regulates developmental timing in Caenorhabditis elegans JO - Nature VL - 403 UR - https://doi.org/10.1038/35002607 DO - 10.1038/35002607 ID - Reinhart2000 ER - TY - JOUR AU - Pasquinelli, A. AU - Reinhart, B. AU - Slack, F. AU - Martindale, M. AU - Kuroda, M. AU - Maller, B. AU - Hayward, D. AU - Ball, E. AU - Degnan, B. AU - Muller, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - Conservation of the sequence and temporal expression of let-7 heterochronic regulatory RNA JO - Nature VL - 408 UR - https://doi.org/10.1038/35040556 DO - 10.1038/35040556 ID - Pasquinelli2000 ER - TY - JOUR AU - Lagos-Quintana, M. AU - Rauhut, R. AU - Lendeckel, W. AU - Tuschl, T. PY - 2001 DA - 2001// TI - Identification of novel genes coding for small expressed RNAs JO - Science VL - 294 UR - https://doi.org/10.1126/science.1064921 DO - 10.1126/science.1064921 ID - Lagos-Quintana2001 ER - TY - JOUR AU - Lu, J. AU - Getz, G. AU - Miska, E. AU - Alvarez-Saavedra, E. AU - Lamb, L. AU - Peck, D. AU - Cordero, A. S. AU - Ebert, B. AU - Mak, R. AU - Ferrando, A. PY - 2005 DA - 2005// TI - MicroRNA expression profiles classify human cancers JO - Nature VL - 435 UR - https://doi.org/10.1038/nature03702 DO - 10.1038/nature03702 ID - Lu2005 ER - TY - JOUR AU - Calin, G. AU - Ferracin, M. AU - Cimmino, A. PY - 2005 DA - 2005// TI - A microRNA signature associated with prognosis and progression in chronic lymphocytic leukemia JO - N Engl J Med VL - 353 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa050995 DO - 10.1056/NEJMoa050995 ID - Calin2005 ER - TY - JOUR AU - Volinia, S. AU - Calin, G. A. AU - Liu, C. AU - Ambs, S. AU - Cimmino, A. AU - Petrocca, F. AU - Visone, R. AU - Iorio, M. AU - Roldo, C. AU - Ferracin, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - A microRNA expression signature of human solid tumors defines cancer gene targets JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0510565103 DO - 10.1073/pnas.0510565103 ID - Volinia2006 ER - TY - JOUR AU - Iorio, M. V. AU - Ferracin, M. AU - Liu, C. AU - Veronese, A. AU - Spizzo, R. AU - Sabbioni, S. AU - Magri, E. AU - Pedriali, M. AU - Fabbri, M. AU - Campiglio, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - MicroRNA Gene Expression Deregulation in Human Breast Cancer JO - Cancer Research VL - 65 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-05-1783 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-05-1783 ID - Iorio2005 ER - TY - JOUR AU - Calin, G. AU - Sevignani, C. AU - Dumitru, C. AU - Hyslop, T. AU - Noch, E. AU - Yendamuri, S. AU - Shimizu, M. AU - Rattan, S. AU - Bullrich, F. AU - Negrini, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Human microRNA genes are frequently located at fragile sites and genomic regions involved in cancers JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 101 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0307323101 DO - 10.1073/pnas.0307323101 ID - Calin2004 ER - TY - JOUR AU - Chou, J. AU - Zhou, T. AU - Kaufmann, W. AU - Paules, R. AU - Bushel, P. R. PY - 2007 DA - 2007// TI - Extracting gene expression patterns and identifying co-expressed genes from microarray data reveals biologically responsive processes JO - BMC Bioinformatics VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-8-427 DO - 10.1186/1471-2105-8-427 ID - Chou2007 ER - TY - JOUR AU - Tanay, A. AU - Sharan, R. AU - Shamir, R. PY - 2002 DA - 2002// TI - Discovering Statistically Significant Biclusters in Gene Expression Data JO - Bioinformatics VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/18.suppl_1.S136 DO - 10.1093/bioinformatics/18.suppl_1.S136 ID - Tanay2002 ER - TY - JOUR AU - Madiera, S. C. AU - Oliviera, A. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - Biclustering algorithms for biologic-al data analysis: a survey JO - IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform VL - 1 UR - https://doi.org/10.1109/TCBB.2004.2 DO - 10.1109/TCBB.2004.2 ID - Madiera2004 ER - TY - STD TI - Bandyopadhyay S, Mitra R, Maulik U, Zhang MQ: Development of the Human Cancer MicroRNA Network. BMC Silence (accepted) ID - ref17 ER - TY - JOUR AU - Blower, P. AU - Verducci, J. AU - Lin, S. AU - Zhou, J. AU - Chung, J. AU - Dai, Z. AU - Liu, C. AU - Reinhold, W. AU - Lorenzi, P. AU - Kaldjian, E. PY - 2007 DA - 2007// TI - MicroRNA expression profiles for the NCI-60 cancer cell panel JO - Mol Cancer Ther VL - 6 UR - https://doi.org/10.1158/1535-7163.MCT-07-0009 DO - 10.1158/1535-7163.MCT-07-0009 ID - Blower2007 ER - TY - CHAP AU - Wang, Y. AU - Dunham, M. H. AU - Waddle, J. A. AU - McGee, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Classifier Fusion for Poorly-Differentiated Tumor Classification using Both Messenger RNA and MicroRNA Expression Profiles BT - Proceedings of the 2006 Computational Systems Bioinformatics Conference (CSB 2006), Stanford, California ID - Wang2006 ER - TY - CHAP AU - Kononenko, I. PY - 1994 DA - 1994// TI - Estimating attributes: analysis and extensions of relief BT - Proceedings of the European conference on machine learning ID - Kononenko1994 ER - TY - JOUR AU - Zheng, Y. AU - Kwoh, C. K. PY - 2006 DA - 2006// TI - Cancer classification with microRNA expression patterns found by an information theory approach JO - Journal of computers VL - 1 UR - https://doi.org/10.4304/jcp.1.5.30-39 DO - 10.4304/jcp.1.5.30-39 ID - Zheng2006 ER - TY - JOUR AU - Shankavaram, U. AU - Reinhold, W. AU - Nishizuka, S. AU - Major, S. AU - Morita, D. AU - Chary, K. AU - Reimers, M. AU - Scherf, U. AU - Kahn, A. AU - Dolginow, D. PY - 2007 DA - 2007// TI - Transcript and protein expression profiles of the NCI-60 cancer cell panel: an integromic microarray study JO - Mol Cancer Ther VL - 6 UR - https://doi.org/10.1158/1535-7163.MCT-06-0650 DO - 10.1158/1535-7163.MCT-06-0650 ID - Shankavaram2007 ER - TY - JOUR AU - Yeung, K. Y. AU - Bumgarner, R. E. PY - 2003 DA - 2003// TI - Multiclass classification of microarray data with repeated measurements: application to cancer JO - Genome Biol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2003-4-12-r83 DO - 10.1186/gb-2003-4-12-r83 ID - Yeung2003 ER - TY - JOUR AU - Tibshirani, R. AU - Hastie, T. AU - Narasimhan, B. AU - Chu, G. PY - 2002 DA - 2002// TI - Diagnosis of multiple cancer types by shrunken centroids of gene expression JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 99 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.082099299 DO - 10.1073/pnas.082099299 ID - Tibshirani2002 ER - TY - JOUR AU - Saeed, A. I. AU - Sharov, V. AU - White, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - TM4: a free, open-source system for microarray data management and analysis JO - Biotechniques VL - 34 ID - Saeed2003 ER -