TY - JOUR AU - Mercurio, F. AU - Zhu, H. Y. AU - Murray, B. W. AU - Shevchenko, A. AU - Bennett, B. L. AU - Li, J. W. AU - Young, D. B. AU - Barbosa, M. AU - Mann, M. PY - 1997 DA - 1997// TI - IKK-1 and IKK-2: Cytokine-activated I kappa B kinases essential for NF-kappa B activation JO - Science VL - 278 UR - https://doi.org/10.1126/science.278.5339.860 DO - 10.1126/science.278.5339.860 ID - Mercurio1997 ER - TY - JOUR AU - Beg, A. A. AU - Baldwin, A. S. PY - 1993 DA - 1993// TI - The I kappa B proteins: multifunctional regulators of Rel/NF-kappa B transcription factors JO - Genes Dev VL - 7 UR - https://doi.org/10.1101/gad.7.11.2064 DO - 10.1101/gad.7.11.2064 ID - Beg1993 ER - TY - JOUR AU - Scherer, D. C. AU - Brockman, J. A. AU - Chen, Z. J. AU - Maniatis, T. AU - Ballard, D. W. PY - 1995 DA - 1995// TI - Signal-Induced Degradation of I-Kappa-B-Alpha Requires Site-Specific Ubiquitination JO - Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America VL - 92 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.92.24.11259 DO - 10.1073/pnas.92.24.11259 ID - Scherer1995 ER - TY - JOUR AU - Christopher, J. A. AU - Avitabile, B. G. AU - Bamborough, P. AU - Champigny, A. C. AU - Cutler, G. J. AU - Dyos, S. L. AU - Grace, K. G. AU - Kerns, J. K. AU - Kitson, J. D. AU - Mellor, G. W. PY - 2007 DA - 2007// TI - The discovery of 2-amino-3,5-diarylbenzamide inhibitors of IKK-alpha and IKK-beta kinases JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2007.04.088 DO - 10.1016/j.bmcl.2007.04.088 ID - Christopher2007 ER - TY - JOUR AU - Strnad, J. AU - Burke, J. R. PY - 2007 DA - 2007// TI - I kappa B kinase inhibitors for treating autoimmune and inflammatory disorders: potential and challenges JO - Trends in Pharmacological Sciences VL - 28 UR - https://doi.org/10.1016/j.tips.2007.01.005 DO - 10.1016/j.tips.2007.01.005 ID - Strnad2007 ER - TY - JOUR AU - Lawrence, T. AU - Bebien, M. AU - Liu, G. Y. AU - Nizet, V. AU - Karin, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - IKK alpha limits macrophage NF-kappa B activation and contributes to the resolution of inflammation JO - Nature VL - 434 UR - https://doi.org/10.1038/nature03491 DO - 10.1038/nature03491 ID - Lawrence2005 ER - TY - CHAP AU - Nagarajan, S. AU - Ahmed, A. AU - Choo, H. AU - Cho, Y. S. AU - Oh, K. S. AU - Lee, B. H. AU - Shin, K. J. AU - Pae, A. N. PY - 2010 DA - 2010// TI - 3D QSAR pharmacophore model based on diverse IKKβ inhibitors BT - Journal of Molecular Modeling ID - Nagarajan2010 ER - TY - JOUR AU - Lamanna, C. AU - Bellini, M. AU - Padova, A. AU - Westerberg, G. AU - Maccari, L. PY - 2008 DA - 2008// TI - Straightforward recursive partitioning model for discarding insoluble compounds in the drug discovery process JO - Journal of Medicinal Chemistry VL - 51 UR - https://doi.org/10.1021/jm701407x DO - 10.1021/jm701407x ID - Lamanna2008 ER - TY - JOUR AU - Landis, J. R. AU - Koch, G. G. PY - 1977 DA - 1977// TI - The measurement of observer agreement for categorical data JO - Biometrics VL - 33 UR - https://doi.org/10.2307/2529310 DO - 10.2307/2529310 ID - Landis1977 ER - TY - JOUR AU - Murata, T. AU - Shimada, M. AU - Kadono, H. AU - Sakakibara, S. AU - Yoshino, T. AU - Masuda, T. AU - Shimazaki, M. AU - Shintani, T. AU - Fuchikami, K. AU - Bacon, K. B. PY - 2004 DA - 2004// TI - Synthesis and structure-activity relationships of novel IKK-beta inhibitors. Part 2: Improvement of in vitro activity JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters VL - 14 UR - https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2004.05.040 DO - 10.1016/j.bmcl.2004.05.040 ID - Murata2004 ER - TY - CHAP AU - Nagarajan, S. AU - Choo, H. AU - Cho, Y. S. AU - Oh, K. S. AU - Lee, B. H. AU - Shin, K. J. AU - Pae, A. N. PY - 2010 DA - 2010// TI - IKKβ inhibitors Identification Part II: Ligand and Structure Based Virtual Screening BT - Bioorganic & Medicinal Chemistry ID - Nagarajan2010 ER - TY - CHAP AU - Zhuravel, I. A. I. AU - Kovalenko, A. V. AU - Borisov, S. N. AU - Matusovich, A. V. AU - Il'ya, O. k. u. n. AU - Tkachenko, S. E. AU - Chernykh, V. E. PY - 2006 DA - 2006// TI - Substituted pyrido[4',3':5,6]pyrano[2,3-d]pyrimidines and combinatorial library of these derivatives with antitumor activity BT - Book Substituted pyrido[4',3':5,6]pyrano[2,3-d]pyrimidines and combinatorial library of these derivatives with antitumor activity. (Editor ed.^eds.) City ID - Zhuravel2006 ER - TY - JOUR AU - Hideshima, T. AU - Chauhan, D. AU - Richardson, P. AU - Mitsiades, C. AU - Mitsiades, N. AU - Hayashi, T. AU - Munshi, N. AU - Dang, L. AU - Castro, A. AU - Palombella, V. PY - 2002 DA - 2002// TI - NF-kappa B as a therapeutic target in multiple myeloma JO - Journal of Biological Chemistry VL - 277 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M200360200 DO - 10.1074/jbc.M200360200 ID - Hideshima2002 ER - TY - JOUR AU - Baxter, A. AU - Brough, S. AU - Cooper, A. AU - Floettmann, E. AU - Foster, S. AU - Harding, C. AU - Kettle, J. AU - McInally, T. AU - Martin, C. AU - Mobbs, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Hit-to-lead studies: the discovery of potent, orally active, thiophenecarboxamide IKK-2 inhibitors JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters VL - 14 UR - https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2004.03.058 DO - 10.1016/j.bmcl.2004.03.058 ID - Baxter2004 ER - TY - JOUR AU - Beaulieu, F. AU - Ouellet, C. AU - Ruediger, E. H. AU - Belema, M. AU - Qiu, Y. P. AU - Yang, X. J. AU - Banville, J. AU - Burke, J. R. AU - Gregor, K. R. AU - MacMaster, J. F. PY - 2007 DA - 2007// TI - Synthesis and biological evaluation of 4-amino derivatives of benzimidazoquinoxaline, benzimidazoquinoline, and benzopyrazoloquinazoline as potent IKK inhibitors JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2006.12.017 DO - 10.1016/j.bmcl.2006.12.017 ID - Beaulieu2007 ER - TY - JOUR AU - Morwick, T. AU - Berry, A. AU - Brickwood, J. AU - Cardozo, M. AU - Catron, K. AU - DeTuri, M. AU - Emeigh, J. AU - Homon, C. AU - Hrapchak, M. AU - Jacober, S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Evolution of the thienopyridine class of inhibitors of I kappa B kinase-beta: Part I: Hit-to-lead strategies JO - Journal of Medicinal Chemistry VL - 49 UR - https://doi.org/10.1021/jm0510979 DO - 10.1021/jm0510979 ID - Morwick2006 ER - TY - JOUR AU - Sugiyama, H. AU - Yoshida, M. AU - Mori, K. AU - Kawamoto, T. AU - Sogabe, S. AU - Takagi, T. AU - Oki, H. AU - Tanaka, T. AU - Kimura, H. AU - Ikeura, Y. PY - 2007 DA - 2007// TI - Synthesis and structure activity relationship studies of benzothieno[3,2-b]furan derivatives as a novel class of IKK beta inhibitors JO - Chemical & Pharmaceutical Bulletin VL - 55 UR - https://doi.org/10.1248/cpb.55.613 DO - 10.1248/cpb.55.613 ID - Sugiyama2007 ER - TY - JOUR AU - De'ath, G. AU - Fabricius, K. E. PY - 2000 DA - 2000// TI - Classification and regression trees: A powerful yet simple technique for ecological data analysis JO - Ecology VL - 81 UR - https://doi.org/10.1890/0012-9658(2000)081[3178:CARTAP]2.0.CO;2 DO - 10.1890/0012-9658(2000)081[3178:CARTAP]2.0.CO;2 ID - De'ath2000 ER - TY - CHAP AU - Farmen, M. W. L. AU - Rusinko, C. h. r. i. s. t. o. p. h. e. G. e. r. a. r. d. AU - Young, A. n. d. r. e. w. R. AU - Stanley, S. i. d. n. e. y. PY - 2002 DA - 2002// TI - Statistical deconvoluting of mixtures BT - Book Statistical deconvoluting of mixtures. (Editor ed.^eds.), City ID - Farmen2002 ER - TY - JOUR AU - Huang, L. T. AU - Gromiha, M. M. AU - Ho, S. Y. PY - 2007 DA - 2007// TI - iPTREE-STAB: interpretable decision tree based method for predicting protein stability changes upon mutations JO - Bioinformatics VL - 23 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm100 DO - 10.1093/bioinformatics/btm100 ID - Huang2007 ER - TY - CHAP AU - Houseman, E. A. AU - Christensen, B. C. AU - Yeh, R. F. AU - Marsit, C. J. AU - Karagas, M. R. AU - Wrensch, M. AU - Nelson, H. H. AU - Wiemels, J. AU - Zheng, S. AU - Wiencke, J. K. AU - Kelsey, K. T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Model-based clustering of DNA methylation array data: a recursive-partitioning algorithm for high-dimensional data arising as a mixture of beta distributions BT - Bmc Bioinformatics ID - Houseman2008 ER - TY - JOUR AU - Chohan, K. K. AU - Paine, S. W. AU - Mistry, J. AU - Barton, P. AU - Davis, A. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - A rapid computational filter for cytochrome P450 1A2 inhibition potential of compound libraries JO - Journal of Medicinal Chemistry VL - 48 UR - https://doi.org/10.1021/jm048959a DO - 10.1021/jm048959a ID - Chohan2005 ER - TY - JOUR AU - Burton, J. AU - Ijjaali, I. AU - Barberan, O. AU - Petitet, F. AU - Vercauteren, D. P. AU - Michel, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Recursive partitioning for the prediction of cytochromes P450 2D6 and 1A2 inhibition: Importance of the quality of the dataset JO - Journal of Medicinal Chemistry VL - 49 UR - https://doi.org/10.1021/jm060267u DO - 10.1021/jm060267u ID - Burton2006 ER - TY - BOOK PY - 2005 DA - 2005// TI - (version 410), Accelrys, Inc, San Diego, CA, USA ID - ref24 ER - TY - JOUR AU - Murata, T. AU - Shimada, M. AU - Sakakibara, S. AU - Yoshino, T. AU - Masuda, T. AU - Shintani, T. AU - Sato, H. AU - Koriyama, Y. AU - Fukushima, K. AU - Nunami, N. PY - 2004 DA - 2004// TI - Synthesis and structure-activity relationships of novel IKK-beta inhibitors. Part 3: Orally active anti-inflammatory agents JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters VL - 14 UR - https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2004.05.041 DO - 10.1016/j.bmcl.2004.05.041 ID - Murata2004 ER - TY - JOUR AU - Bingham, A. H. AU - Davenport, R. J. AU - Gowers, L. AU - Knight, R. L. AU - Lowe, C. AU - Owen, D. A. AU - Parry, D. M. AU - Pitt, W. R. PY - 2004 DA - 2004// TI - A novel series of potent and selective IKK2 inhibitors JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters VL - 14 UR - https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2003.10.047 DO - 10.1016/j.bmcl.2003.10.047 ID - Bingham2004 ER - TY - JOUR AU - Bonafoux, D. AU - Bonar, S. AU - Christine, L. AU - Clare, M. AU - Donnelly, A. AU - Guzova, J. AU - Kishore, N. AU - Lennon, P. AU - Libby, A. AU - Mathialagan, S. PY - 2005 DA - 2005// TI - Inhibition of IKK-2 by 2-[(aminocarbonyl)amino]-5-acetylenyl-3-thiophenecarboxamides JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters VL - 15 UR - https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2005.03.090 DO - 10.1016/j.bmcl.2005.03.090 ID - Bonafoux2005 ER - TY - JOUR AU - Waelchli, R. AU - Bollbuck, B. AU - Bruns, C. AU - Buhl, T. AU - Eder, J. AU - Felfel, R. AU - Hersperger, R. AU - Janser, P. AU - Revesz, L. AU - Zerwes, H. G. AU - Schlapbach, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Design and preparation of 2-benzamido-pyrimidines as inhibitors of IKK JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters VL - 16 UR - https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2005.09.035 DO - 10.1016/j.bmcl.2005.09.035 ID - Waelchli2006 ER - TY - JOUR AU - Castro, A. C. AU - Dang, L. C. AU - Soucy, F. AU - Grenier, L. AU - Mazdiyasni, H. AU - Hottelet, M. AU - Parent, L. AU - Pien, C. AU - Palombella, V. AU - Adams, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Novel IKK inhibitors: beta-carbolines JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/S0960-894X(03)00408-6 DO - 10.1016/S0960-894X(03)00408-6 ID - Castro2003 ER - TY - JOUR AU - Belema, M. AU - Bunker, A. AU - Nguyen, V. N. AU - Beaulieu, F. AU - Ouellet, C. AU - Qu, Y. P. AU - Zhang, Y. H. AU - Martel, A. AU - Burke, J. R. AU - Mclntyre, K. W. PY - 2007 DA - 2007// TI - Synthesis and structure-activity relationship of imidazo(1,2-a)thieno(3,2-e)pyrazines as IKK-beta inhibitors JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2007.05.031 DO - 10.1016/j.bmcl.2007.05.031 ID - Belema2007 ER - TY - STD TI - Tripos Inc. SL, MO 63144, USA. ID - ref31 ER - TY - JOUR AU - Hindle, S. A. AU - Rarey, M. AU - Buning, C. AU - Lengauer, T. PY - 2002 DA - 2002// TI - Flexible docking under pharmacophore type constraints JO - Journal of Computer-Aided Molecular Design VL - 16 UR - https://doi.org/10.1023/A:1016399411208 DO - 10.1023/A:1016399411208 ID - Hindle2002 ER - TY - JOUR AU - Polgar, T. AU - Keseru, G. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Virtual screening for beta-secretase (BACE1) inhibitors reveals the importance of protonation states at Asp32 and Asp228 JO - Journal of Medicinal Chemistry VL - 48 UR - https://doi.org/10.1021/jm049133b DO - 10.1021/jm049133b ID - Polgar2005 ER - TY - JOUR AU - Polgar, T. AU - Magyar, C. AU - Simon, I. AU - Keseru, G. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Impact of ligand protonation on virtual screening against ss-secretase (BACEI) JO - Journal of Chemical Information and Modeling VL - 47 UR - https://doi.org/10.1021/ci700223p DO - 10.1021/ci700223p ID - Polgar2007 ER - TY - JOUR AU - Polgar, T. AU - Baki, A. AU - Szendrei, G. I. AU - Keseru, G. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Comparative virtual and experimental high-throughput screening for glycogen synthase kinase-3 beta inhibitors JO - Journal of Medicinal Chemistry VL - 48 UR - https://doi.org/10.1021/jm050504d DO - 10.1021/jm050504d ID - Polgar2005 ER - TY - JOUR AU - Virag, I. AU - Polgar, T. AU - Keseru, G. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Functional virtual screening of estrogen receptor alpha modulators by FlexX-Pharm JO - Journal of Molecular Structure-Theochem VL - 725 UR - https://doi.org/10.1016/j.theochem.2005.02.083 DO - 10.1016/j.theochem.2005.02.083 ID - Virag2005 ER - TY - JOUR AU - Aronov, A. M. AU - McClain, B. AU - Moody, C. S. AU - Murcko, M. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Kinase-likeness and kinase-privileged fragments: Toward virtual polypharmacology JO - Journal of Medicinal Chemistry VL - 51 UR - https://doi.org/10.1021/jm701021b DO - 10.1021/jm701021b ID - Aronov2008 ER - TY - JOUR AU - Ghose, A. K. AU - Herbertz, T. AU - Pippin, D. A. AU - Salvino, J. M. AU - Mallamo, J. P. PY - 2008 DA - 2008// TI - Knowledge based prediction of ligand binding modes and rational inhibitor design for kinase drug discovery JO - Journal of Medicinal Chemistry VL - 51 UR - https://doi.org/10.1021/jm800475y DO - 10.1021/jm800475y ID - Ghose2008 ER - TY - JOUR AU - Liao, J. J. L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Molecular recognition of protein kinase binding pockets for design of potent and selective kinase inhibitors JO - Journal of Medicinal Chemistry VL - 50 UR - https://doi.org/10.1021/jm0608107 DO - 10.1021/jm0608107 ID - Liao2007 ER - TY - JOUR AU - Nagarajan, S. AU - Doddareddy, M. R. AU - Choo, H. AU - Cho, Y. S. AU - Oh, K. S. AU - Lee, B. H. AU - Pae, A. N. PY - 2009 DA - 2009// TI - IKK beta inhibitors identification part I: Homology model assisted structure based virtual screening JO - Bioorganic & Medicinal Chemistry VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.bmc.2009.02.041 DO - 10.1016/j.bmc.2009.02.041 ID - Nagarajan2009 ER -