From: Randomization techniques for assessing the significance of gene periodicity results
Dataset | P | R | A | S | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
FDR 0.01, Futschik and Herzel | ||||||||
ALPHA 1C | Â | (0) | Â | (0) | Â | (0) | Â | (0) |
ALPHA 2C | 0.315 | (111) | 0.315 | (127) | Â | (0) | Â | (0) |
CDC 15 | 0.199 | (251) | 0.197 | (259) | 0.400 | (15) | Â | (0) |
CDC 28 | 0.193 | (145) | 0.168 | (202) | Â | (1) | Â | (0) |
ELU | 0.184 | (103) | 0.183 | (104) | Â | (0) | Â | (0) |
FDR 0.01, Benjamini-Hochberg | ||||||||
ALPHA 1C | Â | (0) | Â | (0) | Â | (0) | Â | (0) |
ALPHA 2C | 0.315 | (111) | 0.315 | (127) | Â | (0) | Â | (0) |
CDC 15 | 0.199 | (251) | 0.197 | (259) | 0.429 | (21) | Â | (0) |
CDC 28 | 0.193 | (145) | 0.168 | (202) | Â | (0) | Â | (0) |
ELU | 0.184 | (103) | 0.181 | (105) | Â | (0) | Â | (0) |
FDR 0.05, Futschik and Herzel | ||||||||
ALPHA 1C | 0.080 | (75) | 0.087 | (115) | Â | (0) | Â | (0) |
ALPHA 2C | 0.176 | (296) | 0.166 | (314) | 0.364 | (77) | 0.600 | (10) |
CDC 15 | 0.140 | (450) | 0.136 | (464) | 0.215 | (191) | 0.429 | (21) |
CDC 28 | 0.108 | (435) | 0.102 | (500) | 0.276 | (58) | Â | (2) |
ELU | 0.055 | (1155) | 0.050 | (1327) | Â | (1) | Â | (0) |
FDR 0.05, Benjamini-Hochberg | ||||||||
ALPHA 1C | 0.077 | (78) | 0.087 | (115) | Â | (0) | Â | (0) |
ALPHA 2C | 0.176 | (296) | 0.166 | (314) | 0.372 | (78) | 0.667 | (15) |
CDC 15 | 0.140 | (450) | 0.136 | (463) | 0.218 | (193) | 0.435 | (23) |
CDC 28 | 0.108 | (435) | 0.102 | (500) | 0.276 | (58) | Â | (2) |
ELU | 0.055 | (1155) | 0.050 | (1327) | Â | (1) | Â | (0) |
FDR 0.10, Futschik and Herzel | ||||||||
ALPHA 1C | 0.077 | (338) | 0.067 | (421) | Â | (0) | Â | (0) |
ALPHA 2C | 0.125 | (447) | 0.120 | (476) | 0.251 | (167) | 0.434 | (53) |
CDC 15 | 0.107 | (653) | 0.105 | (668) | 0.188 | (271) | 0.292 | (96) |
CDC 28 | 0.084 | (651) | 0.085 | (685) | 0.205 | (132) | Â | (2) |
ELU | 0.040 | (2058) | 0.039 | (2207) | Â | (2) | Â | (0) |
FDR 0.10, Benjamini-Hochberg | ||||||||
ALPHA 1C | 0.077 | (339) | 0.067 | (432) | Â | (0) | Â | (0) |
ALPHA 2C | 0.125 | (447) | 0.120 | (476) | 0.253 | (170) | 0.434 | (53) |
CDC 15 | 0.107 | (653) | 0.105 | (668) | 0.188 | (271) | 0.280 | (107) |
CDC 28 | 0.084 | (651) | 0.085 | (685) | 0.205 | (132) | Â | (2) |
ELU | 0.040 | (2058) | 0.039 | (2207) | Â | (2) | Â | (0) |