Skip to main content

Table 5 Power and FDR of methods under simulated data of Types 1, 2, and 3 covariance structures when FDR was controlled by 0.05

From: Integrated analysis of the heterogeneous microarray data

Type ρ   Meta analysis Two-stage ANOVA LMe
      M1 M2 M3 M4 M5
1 0 Power 0.2087 0.1983 0.2770 0.2073 0.2610 0.2273 0.2240
   FDR 0.0740 0.0600 0.1150 0.0730 0.0863 0.0746 0.0807
  0.2 Power 0.1863 0.1683 0.3493 0.2570 0.2847 0.2607 0.1903
   FDR 0.0345 0.0307 0.0958 0.0666 0.0707 0.0668 0.0371
  0.4 Power 0.1543 0.1403 0.4783 0.3950 0.4007 0.3953 0.1580
   FDR 0.0170 0.0186 0.0718 0.0558 0.0573 0.0557 0.0104
2 0 Power 0.1453 0.1423 0.3650 0.3067 0.3093 0.3073 0.1570
   FDR 0.0224 0.0251 0.0920 0.0564 0.0569 0.0563 0.0248
  0.2 Power 0.1290 0.1347 0.3373 0.2867 0.2867 0.2867 0.1450
   FDR 0.0203 0.0098 0.0858 0.0591 0.591 0.0591 0.0247
  0.4 Power 0.1490 0.1497 0.3700 0.3150 0.3170 0.3150 0.1503
   FDR 0.0283 0.0323 0.1091 0.0680 0.0676 0.0680 0.0363
3   Power 0.1517 0.0010 1.000 1.0000 1.0000 1.0000 0.0043
   FDR 0.0000 0.0000 0.0712 0.0455 0.0455 0.0455 0.0000