Table 3 Putative novel sRNA identified in M. haemolytica PHL213

MHA_0231|-

MHA_0232|lamB

Y(+)

MHA_0300|-

MHA_0301|-

Y(+)

Haemophilus parasuis SH0165

MHA_0307|era

MHA_0308|recO

Y(+)

Mannheimia granulomatis str. P1135/26

MHA_0333|res

MHA_0334|gyrB

Y(+)

MHA_0405|-

MHA_0406|-

Y(+)

Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410

MHA_0568|-

MHA_0569|-

Y(+)

Haemophilus parasuis SH0165

MHA_0694|uppS

MHA_0695|-

Y(+)

MHA_0724|-

MHA_0725|hemL

Y(+)

MHA_0748|dnaA

MHA_0749|ccmA

Y(+)

MHA_0806|-

MHA_0807|rluC

Y(+)

MHA_0843|pstC

MHA_0844|pstS

Y(+)

MHA_0957|-

MHA_0958|-

Y(+)

MHA_1000|crp

MHA_1001|murB

Y(+)

MHA_1003|-

MHA_1004|hxuA

Y(+)

MHA_1103|-

MHA_1104|-

Y(+)

MHA_1167|-

MHA_1168|-

Y(+)

Histophilus somni 2336

MHA_1444|-

MHA_1445|-

Y(+)

MHA_1449|-

MHA_1450|-

Y(+)

MHA_1562|-

MHA_1563|dapA

Y(+)

MHA_1597|-

MHA_1598|rpmE

Y(+)

MHA_1601|-

MHA_1602|lon

Y(+)

MHA_1610|-

MHA_1611|-

Y(+)

MHA_1690|leuA

MHA_1691|-

Y(+)

MHA_1719|-

MHA_1720|uspA

Y(+)

MHA_1796|-

MHA_1797|-

Y(+)

MHA_1864|rpoZ

MHA_1865|-

Y(+)

MHA_1884|-

MHA_1885|-

Y(+)

MHA_1892|-

MHA_1893|-

Y(+)

MHA_1926|aroE

MHA_1927|uvrD

Y(+,-)

MHA_2021|-

MHA_2022|-

Y(+)

MHA_2099|ansB

MHA_2100|-

Y(+)

MHA_2131|-

MHA_2132|-

Y(+)

MHA_2171|mtlD

MHA_2172|-

Y(+)

Haemophilus ducreyi strain 35000 HP

MHA_2185|tolQ

MHA_2186|tolR

Y(+)

MHA_2261|hmbR2

MHA_2262|-

Y(+)

MHA_2272|-

MHA_2273|purM

Y(+)

MHA_2360|-

MHA_2361|gntK

Y(+)

MHA_2487|nagB

MHA_2488|nagA

Y(+)

MHA_2696|dinJ

MHA_2697|-

Y(+)

MHA_2698|miaA

MHA_2699|hfq

Y(+)

MHA_2712|-

MHA_2713|tpx

Y(+)

MHA_2762|ansB

MHA_2763|pyrG

Y(+,-)

MHA_2776|-

MHA_2777|trmU

Y(+)

Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03

MHA_2824|mgsA

MHA_2825|thrC

Y(+)