Skip to main content

Table 3 Comparative performance analysis of different algorithms

From: μHEM for identification of differentially expressed miRNAs using hypercuboid equivalence partition matrix

Microarray Algorithms Apparent error B1 Error Gap estimate B.632+ Error
data sets /Methods Error miRNAs Error miRNAs Error miRNAs Error miRNAs
  Golub et al. 0.000 19 0.194 32 0.258 32 0.146 32
  Lasso 0.056 2 0.266 2 0.125 2 0.229 2
  Boosting 0.000 5 0.113 10 0.090 10 0.094 10
GSE17681 InfoGain 0.000 6 0.154 21 0.290 21 0.111 21
  mRMR 0.000 10 0.175 28 0.267 28 0.129 28
  RSMRMS 0.000 8 0.142 24 0.299 24 0.102 24
  μHEM 0.000 5 0.120 50 0.325 50 0.084 50
  Golub et al. 0.000 6 0.116 48 0.363 48 0.081 48
  Lasso 0.024 3 0.102 3 0.241 2 0.079 3
  Boosting 0.000 4 0.037 9 0.170 9 0.025 9
GSE17846 InfoGain 0.000 7 0.093 37 0.387 37 0.063 37
  mRMR 0.000 3 0.101 48 0.379 48 0.069 48
  RSMRMS 0.000 2 0.093 39 0.386 39 0.064 39
  μHEM 0.000 2 0.087 49 0.392 49 0.059 49
  Golub et al. 0.000 35 0.069 48 0.368 39 0.047 48
  Lasso 0.043 5 0.061 6 0.074 6 0.057 6
  Boosting 0.099 3 0.107 3 0.074 3 0.104 3
GSE21036 InfoGain 0.000 39 0.073 50 0.372 44 0.049 50
  mRMR 0.000 19 0.064 49 0.376 50 0.043 49
  RSMRMS 0.050 5 0.089 5 0.328 5 0.075 5
  μHEM 0.000 42 0.058 47 0.386 47 0.039 47
  Boosting 0.099 8 0.211 8 0.057 8 0.192 8
  InfoGain 0.000 26 0.257 45 0.218 46 0.203 45
GSE24709 mRMR 0.000 24 0.245 50 0.229 50 0.191 50
  RSMRMS 0.141 11 0.402 11 0.123 2 0.366 11
  μHEM 0.000 20 0.234 49 0.241 49 0.180 49
  Golub et al. 0.000 27 0.300 27 0.173 3 0.248 27
  Lasso 0.045 4 0.251 4 0.118 4 0.215 4
  Boosting 0.023 7 0.191 8 0.131 4 0.160 8
GSE28700 InfoGain 0.000 35 0.309 8 0.159 8 0.271 21
  mRMR 0.000 21 0.333 49 0.140 7 0.285 49
  RSMRMS 0.023 34 0.331 19 0.140 15 0.285 19
  μHEM 0.000 25 0.306 4 0.194 4 0.257 4
  Golub et al. 0.000 36 0.073 1 0.364 1 0.069 1
  Lasso 0.061 3 0.072 4 0.184 1 0.068 4
  Boosting 0.081 2 0.087 2 0.085 1 0.085 2
GSE31408 InfoGain 0.007 20 0.090 9 0.331 1 0.077 27
  mRMR 0.000 37 0.094 6 0.331 1 0.074 6
  RSMRMS 0.061 2 0.086 6 0.336 2 0.077 6
  μHEM 0.000 44 0.098 2 0.354 50 0.067 50