Skip to main content

Table 2 Genomes used for the core genome computation

From: Finishing bacterial genome assemblies with Mix

M. gallisepticum R High M. gallisepticum R Low M. gallisepticum F
M. genitalium G37 M. pneumoniae M129 M. penetrans HF-2
U. parvum 21815 U. urealyticum 33699 U. parvum 700970
M. agalactiae 5632 M. agalactiae PG2 M. bovis PG45
M. bovis Hubei M. fermentans JER M. synoviae 53
M. pulmonis UABCTIP M. hyopneumoniae 232 M. hyopneumoniae J
M. hyopneumoniae 7448 M. hyorhinis HUB-1 M. mobile 163K
M. mycoides subsp. capri GM12 M. arthitidis 158L3-1 Mesoplasma florum L1
M. mycoides subsp. capri 95010 M. hominis PG21 M. leachii 99
M. mycoides subsp. mycoides PG1 M. mycoides subsp. mycoides Gladysdale M. leachii PG50
M. capricolum subsp. capricolum 27343   
  1. The core genome is defined as the set of orthologous genes present in all strains.