TY - JOUR AU - Eisen, H. N. AU - Siskind, G. W. PY - 1964 DA - 1964// TI - Variations in Affinities of Antibodies during the Immune Response JO - Biochemistry VL - 3 UR - https://doi.org/10.1021/bi00895a027 DO - 10.1021/bi00895a027 ID - Eisen1964 ER - TY - JOUR AU - MacLennan, I. C. PY - 1994 DA - 1994// TI - Germinal centers JO - Annu Rev Immunol VL - 12 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.iy.12.040194.001001 DO - 10.1146/annurev.iy.12.040194.001001 ID - MacLennan1994 ER - TY - JOUR AU - Kelsoe, G. PY - 1996 DA - 1996// TI - The germinal center: a crucible for lymphocyte selection JO - Semin Immunol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1006/smim.1996.0022 DO - 10.1006/smim.1996.0022 ID - Kelsoe1996 ER - TY - JOUR AU - Allen, C. D. AU - Okada, T. AU - Cyster, J. G. PY - 2007 DA - 2007// TI - Germinal-center organization and cellular dynamics JO - Immunity VL - 27 UR - https://doi.org/10.1016/j.immuni.2007.07.009 DO - 10.1016/j.immuni.2007.07.009 ID - Allen2007 ER - TY - JOUR AU - Wittenbrink, N. AU - Klein, A. AU - Weiser, A. A. AU - Schuchhardt, J. AU - Or-Guil, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Is There a Typical Germinal Center? A Large-Scale Immunohistological Study on the Cellular Composition of Germinal Centers during the Hapten-Carrier-Driven Primary Immune Response in Mice JO - J Immunol VL - 187 UR - https://doi.org/10.4049/jimmunol.1101440 DO - 10.4049/jimmunol.1101440 ID - Wittenbrink2011 ER - TY - JOUR AU - Manser, T. PY - 2004 DA - 2004// TI - Textbook germinal centers? JO - J Immunol VL - 172 UR - https://doi.org/10.4049/jimmunol.172.6.3369 DO - 10.4049/jimmunol.172.6.3369 ID - Manser2004 ER - TY - JOUR AU - Wollenberg, I. AU - Agua-Doce, A. AU - Hernandez, A. AU - Almeida, C. AU - Oliveira, V. G. AU - Faro, J. AU - Graca, L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Regulation of the germinal center reaction by Foxp3+ follicular regulatory T cells JO - J Immunol VL - 187 UR - https://doi.org/10.4049/jimmunol.1101328 DO - 10.4049/jimmunol.1101328 ID - Wollenberg2011 ER - TY - JOUR AU - Chung, Y. AU - Tanaka, S. AU - Chu, F. AU - Nurieva, R. I. AU - Martinez, G. J. AU - Rawal, S. AU - Wang, Y. H. AU - Lim, H. AU - Reynolds, J. M. AU - Zhou, X. H. AU - Fan, H. M. AU - Liu, Z. M. AU - Neelapu, S. S. AU - Dong, C. PY - 2011 DA - 2011// TI - Follicular regulatory T cells expressing Foxp3 and Bcl-6 suppress germinal center reactions JO - Nat Med VL - 17 UR - https://doi.org/10.1038/nm.2426 DO - 10.1038/nm.2426 ID - Chung2011 ER - TY - JOUR AU - Linterman, M. A. AU - Pierson, W. AU - Lee, S. K. AU - Kallies, A. AU - Kawamoto, S. AU - Rayner, T. F. AU - Srivastava, M. AU - Divekar, D. P. AU - Beaton, L. AU - Hogan, J. J. AU - Fagarasan, S. AU - Liston, A. AU - Smith, K. G. AU - Vinuesa, C. G. PY - 2011 DA - 2011// TI - Foxp3+ follicular regulatory T cells control the germinal center response JO - Nat Med VL - 17 UR - https://doi.org/10.1038/nm.2425 DO - 10.1038/nm.2425 ID - Linterman2011 ER - TY - JOUR AU - Saalfeld, S. AU - Cardona, A. AU - Hartenstein, V. AU - Tomancak, P. PY - 2010 DA - 2010// TI - As rigid as possible mosaicking and serial section registration of larte ssTEM datasets JO - Bioinformatics VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq219 DO - 10.1093/bioinformatics/btq219 ID - Saalfeld2010 ER - TY - JOUR AU - Cardona, A. AU - Saalfeld, S. AU - Preibisch, S. AU - Schmid, B. AU - Cheng, A. AU - Pulokas, J. AU - Tomancak, P. AU - Hartenstein, V. PY - 2010 DA - 2010// TI - An integrated micro- and Macroarchitectural Analysis of the Drosophila Brain by computer-Assisted serial section Electron Microscopy JO - PLoS Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1000502 DO - 10.1371/journal.pbio.1000502 ID - Cardona2010 ER - TY - JOUR AU - Ourselin, S. AU - Roche, A. AU - Subsol, G. AU - Pnnec, X. AU - Ayache, N. PY - 2001 DA - 2001// TI - Reconstructing a 3d structure from serial histological sections JO - Image and Vision Computing VL - 19 UR - https://doi.org/10.1016/S0262-8856(00)00052-4 DO - 10.1016/S0262-8856(00)00052-4 ID - Ourselin2001 ER - TY - JOUR AU - Walter, T. AU - Shattuck, D. W. AU - Baldock, R. AU - Bastin, M. E. AU - Carpenter, A. E. AU - Duce, S. AU - Ellenberg, J. AU - Fraser, A. AU - Hamilton, N. AU - Pieper, S. AU - Ragan, M. A. AU - Schneider, J. E. AU - Tomancak, P. AU - Heriche, J. K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Visualization of image data from cells to organisms JO - Nat Methods VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth.1431 DO - 10.1038/nmeth.1431 ID - Walter2010 ER - TY - JOUR AU - Swedlow, J. AU - Goldberg, I. AU - Eliceiri, K. PY - 2009 DA - 2009// TI - Bioimage Informatics for Experimental Biology JO - Annu Rev Biophys VL - 38 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.biophys.050708.133641 DO - 10.1146/annurev.biophys.050708.133641 ID - Swedlow2009 ER - TY - JOUR AU - Preibisch, S. AU - Saalfeld, S. AU - Tomancak, P. PY - 2009 DA - 2009// TI - Globally optimal stitching of tiled 3D microscopic image acquisitions JO - Bioinformatics VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp184 DO - 10.1093/bioinformatics/btp184 ID - Preibisch2009 ER - TY - JOUR AU - I Arganda-Carreras, I. AU - Sorzano, C. AU - Marabini, R. AU - Carazo, J. AU - Ortiz de Solorzano, C. AU - Kybic, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Consistent and Elastic Registration of Histologic sections using vector spline regularization JO - Lecture Notes in Computer Science, Springer, CVAMIA VL - 4241 UR - https://doi.org/10.1007/11889762_8 DO - 10.1007/11889762_8 ID - I Arganda-Carreras2006 ER - TY - JOUR AU - Zitová, B. AU - Flusser, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Image registration methods: a survey JO - Image and Vision Computing VL - 21 UR - https://doi.org/10.1016/S0262-8856(03)00137-9 DO - 10.1016/S0262-8856(03)00137-9 ID - Zitová2003 ER - TY - CHAP AU - Bagci, U. AU - Bai, L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Registration of standardized histological images in feature space BT - Proceedings of SPIE, Volume 6914 ID - Bagci2009 ER - TY - JOUR AU - McInerney, I. AU - Terzopoulus, T. PY - 1996 DA - 1996// TI - Deformable Model sin Medical Image Analysis: A Survey JO - Medical Image Analysis VL - 1 UR - https://doi.org/10.1016/S1361-8415(96)80007-7 DO - 10.1016/S1361-8415(96)80007-7 ID - McInerney1996 ER - TY - JOUR AU - Laasmaa, M. AU - Vendelin, M. AU - Peterson, P. PY - 2011 DA - 2011// TI - Application of regularized Richardson-Lucy algorithm for deconvolution of confocal microscopy images JO - J Microsc VL - 243 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2818.2011.03486.x DO - 10.1111/j.1365-2818.2011.03486.x ID - Laasmaa2011 ER - TY - JOUR AU - Kankaanpää, P. AU - Pahajoki, K. AU - Marjomäki, V. AU - Heino, J. AU - White, D. PY - 2006 DA - 2006// TI - BioImageXD - New Open Source Free Software for the Processing, Analysis and Visualization of Multidimensional Microscopic Images JO - Microscopy Today VL - 14 ID - Kankaanpää2006 ER - TY - JOUR AU - Schiffmann, D. AU - Dikovskaya, D. AU - Appleton, P. AU - Newton, I. AU - Creager, D. AU - Allan, C. AU - Nathke, I. AU - Goldberg, I. PY - 2006 DA - 2006// TI - Open Microscopy Environment and FindSpots: integrating image informatics with quantitative multidimensional image analysis JO - BioTechniques VL - 41 UR - https://doi.org/10.2144/000112224 DO - 10.2144/000112224 ID - Schiffmann2006 ER - TY - JOUR AU - Amenta, N. AU - Choi, S. AU - Kolluri, R. PY - 2001 DA - 2001// TI - The power crust, unions of balls, and the medial axis transform JO - Computational Geometry: Theory and Applications VL - 19 UR - https://doi.org/10.1016/S0925-7721(01)00017-7 DO - 10.1016/S0925-7721(01)00017-7 ID - Amenta2001 ER - TY - JOUR AU - Linkertm, M. AU - Rueden, C. AU - Allan, C. AU - Burel, J. AU - Moore, W. AU - Patterson, A. AU - Loranger, B. AU - Moore, J. AU - Neves, C. AU - Macdonald, D. AU - Tarkowska, A. AU - Sticco, C. AU - Hill, E. AU - Rossner, M. AU - Eliceiri, K. AU - Swedlow, J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Metadata matters: access to image data in the real world JO - J Cell Biol VL - 189 UR - https://doi.org/10.1083/jcb.201004104 DO - 10.1083/jcb.201004104 ID - Linkertm2010 ER - TY - BOOK AU - Shapiro, L. G. AU - Stockman, G. C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Computer vision PB - Prentice Hall CY - Upper Saddle River, NJ ID - Shapiro2001 ER - TY - BOOK AU - Szeliski, R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Computer Vision: Algorithms and Applications PB - Springer CY - Berlin, Germany UR - https://doi.org/10.1007/978-1-84882-935-0 DO - 10.1007/978-1-84882-935-0 ID - Szeliski2011 ER - TY - JOUR AU - Bagci, U. AU - Chen, X. AU - Udupa, J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Hierarchical Scale-Based Multiobject Recognition of 3-D Anatomical Structures JO - IEEE Trans Med Imaging VL - 31 UR - https://doi.org/10.1109/TMI.2011.2180920 DO - 10.1109/TMI.2011.2180920 ID - Bagci2012 ER - TY - JOUR AU - Amenta, N. AU - Bern, M. AU - Eppstein, D. PY - 1998 DA - 1998// TI - The Crust and the Beta-Skeleton: Combinatorial Curve Reconstruction JO - Graphical Models and Image Processing VL - 60 UR - https://doi.org/10.1006/gmip.1998.0465 DO - 10.1006/gmip.1998.0465 ID - Amenta1998 ER - TY - CHAP AU - Amenta, N. AU - Choi, S. AU - Kolluri, R. PY - 2001 DA - 2001// TI - The power crust BT - Proceedings of the sixth ACM symposium on Solid modeling and applications PB - ACM CY - SMA '01, New York, NY, USA UR - https://doi.org/10.1145/376957.376986 DO - 10.1145/376957.376986 ID - Amenta2001 ER - TY - JOUR AU - Amenta, N. AU - Bern, M. PY - 1999 DA - 1999// TI - Surface Reconstruction by Voronoi Filtering JO - Discrete and Computational Geometry VL - 22 UR - https://doi.org/10.1007/PL00009475 DO - 10.1007/PL00009475 ID - Amenta1999 ER -