Skip to main content

Table 3 Average classification error rates yielded by Random Forest, k Nearest Neighbors and Support Vector Machine classifiers on ‘GSE24514’ dataset over all the 50 repetitions of 10‐fold cross validation

From: A feature selection method for classification within functional genomics experiments based on the proportional overlapping score

 

RF

kNN

SVM

N. genes

Wil‐RS

mRMR

MP

POS

Wil‐RS

mRMR

MP

POS

Wil‐RS

mRMR

MP

POS

1

0.163

0.352

0.182

0.090

0.125

0.304

0.147

0.096

0.116

0.274

0.141

0.085

2

0.108

0.267

0.143

0.082

0.086

0.249

0.117

0.074

0.085

0.250

0.108

0.080

3

0.098

0.219

0.116

0.068

0.077

0.223

0.093

0.068

0.075

0.215

0.087

0.067

4

0.079

0.186

0.121

0.067

0.078

0.186

0.082

0.065

0.068

0.185

0.077

0.063

5

0.074

0.166

0.103

0.059

0.072

0.166

0.070

0.063

0.062

0.166

0.071

0.062

6

0.067

0.147

0.090

0.058

0.066

0.155

0.068

0.059

0.060

0.149

0.064

0.060

7

0.065

0.137

0.074

0.058

0.059

0.142

0.064

0.060

0.059

0.135

0.061

0.061

8

0.064

0.128

0.068

0.052

0.057

0.133

0.060

0.058

0.056

0.126

0.057

0.054

9

0.063

0.115

0.075

0.055

0.052

0.127

0.061

0.057

0.053

0.113

0.052

0.050

10

0.063

0.104

0.066

0.051

0.048

0.116

0.058

0.058

0.050

0.105

0.047

0.048

20

0.058

0.076

0.047

0.037

0.032

0.088

0.048

0.050

0.044

0.078

0.041

0.039

30

0.057

0.067

0.039

0.034

0.035

0.071

0.041

0.043

0.042

0.070

0.038

0.034

40

0.057

0.073

0.040

0.034

0.037

0.063

0.037

0.042

0.041

0.069

0.037

0.037

50

0.055

0.063

0.038

0.032

0.036

0.041

0.036

0.039

0.041

0.059

0.038

0.036

Avg.

0.077

0.150

0.086

0.055

0.061

0.147

0.070

0.059

0.061

0.142

0.066

0.055

Min.

0.055

0.063

0.038

0.032

0.032

0.041

0.036

0.039

0.041

0.059

0.037

0.034

  1. Boldface numbers indicate the minimum average of classification error rates (the highest accuracy) achieved with the corresponding classifier at each size of selected gene sets, reported in the first column.