TY - JOUR AU - Mallal, S. AU - Nolan, D. AU - Witt, C. AU - Masel, G. AU - Martin, A. AU - Moore, C. AU - Sayer, D. AU - Castley, A. AU - Mamotte, C. AU - Maxwell, D. AU - James, I. AU - Christiansen, F. T. PY - 2002 DA - 2002// TI - Association between presence of HLA-B* 5701, HLA-DR7, and HLA-DQ3 and hypersensitivity to HIV-1 reverse-transcriptase inhibitor abacavir JO - The Lancet VL - 359 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(02)07873-X DO - 10.1016/S0140-6736(02)07873-X ID - Mallal2002 ER - TY - JOUR AU - Lie, B. A. AU - Thorsby, E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Several genes in the extended human MHC contribute to predisposition to autoimmune diseases JO - Curr Opin Immunol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.coi.2005.07.001 DO - 10.1016/j.coi.2005.07.001 ID - Lie2005 ER - TY - JOUR AU - Tiercy, J. -. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Molecular basis of HLA polymorphism: implications in clinical transplantation JO - Transpl Immunol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1016/S0966-3274(02)00007-2 DO - 10.1016/S0966-3274(02)00007-2 ID - Tiercy2002 ER - TY - JOUR AU - Tait, B. D. PY - 2011 DA - 2011// TI - The ever-expanding list of HLA alleles: changing HLA nomenclature and its relevance to clinical transplantation JO - Transplant Rev VL - 25 UR - https://doi.org/10.1016/j.trre.2010.08.001 DO - 10.1016/j.trre.2010.08.001 ID - Tait2011 ER - TY - JOUR AU - Gao, X. AU - Bashirova, A. AU - Iversen, A. K. AU - Phair, J. AU - Goedert, J. J. AU - Buchbinder, S. AU - Hoots, K. AU - Vlahov, D. AU - Altfeld, M. AU - O’Brien, S. J. AU - Carrington, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - AIDS restriction HLA allotypes target distinct intervals of HIV-1 pathogenesis JO - Nat Med VL - 11 UR - https://doi.org/10.1038/nm1333 DO - 10.1038/nm1333 ID - Gao2005 ER - TY - JOUR AU - Robinson, J. AU - Halliwell, J. A. AU - McWilliam, H. AU - Lopez, R. AU - Parham, P. AU - Marsh, S. G. PY - 2013 DA - 2013// TI - The IMGT/HLA database JO - Nucleic Acids Res VL - 41 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gks949 DO - 10.1093/nar/gks949 ID - Robinson2013 ER - TY - JOUR AU - Erlich, H. AU - Opelz, G. AU - Hansen, J. PY - 2001 DA - 2001// TI - HLA DNA typing and transplantation JO - Immunity VL - 14 UR - https://doi.org/10.1016/S1074-7613(01)00115-7 DO - 10.1016/S1074-7613(01)00115-7 ID - Erlich2001 ER - TY - JOUR AU - Lee, S. J. AU - Klein, J. AU - Haagenson, M. AU - Baxter-Lowe, L. A. AU - Confer, D. L. AU - Eapen, M. AU - Fernandez-Vina, M. AU - Flomenberg, N. AU - Horowitz, M. AU - Hurley, C. K. AU - Noreen, H. AU - Oudshoorn, M. AU - Petersdorf, E. AU - Setterholm, M. AU - Spellman, S. AU - Weisdorf, D. AU - Williams, T. M. AU - Anasetti, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - High-resolution donor-recipient HLA matching contributes to the success of unrelated donor marrow transplantation JO - Blood VL - 110 UR - https://doi.org/10.1182/blood-2007-06-097386 DO - 10.1182/blood-2007-06-097386 ID - Lee2007 ER - TY - JOUR AU - Middleton, D. PY - 1998 DA - 1998// TI - History of DNA typing for the human MHC JO - Rev Immunogenet VL - 1 ID - Middleton1998 ER - TY - JOUR AU - De Santis, D. AU - Dinauer, D. AU - Duke, J. AU - Erlich, H. AU - Holcomb, C. AU - Lind, C. AU - Mackiewicz, K. AU - Monos, D. AU - Moudgil, A. AU - Norman, P. AU - Parham, P. AU - Sasson, A. PY - 2013 DA - 2013// TI - Allcock RJ: 16th ihiw: Review of hla typing by ngs JO - Int J Immunogenet VL - 40 UR - https://doi.org/10.1111/iji.12024 DO - 10.1111/iji.12024 ID - De Santis2013 ER - TY - STD TI - PacBio: Multiplexing Targeted Sequencing using Barcodes. Technical Note PN 100-114-500-01, Pacific Biosciences 2012, [http://www.pacificbiosciences.com/pdf/TN_Multiplexing_Targeted_Sequencing_Using_Barcodes.pdf], UR - http://www.pacificbiosciences.com/pdf/TN_Multiplexing_Targeted_Sequencing_Using_Barcodes.pdf ID - ref11 ER - TY - JOUR AU - Adams, S. D. AU - Barracchini, K. C. AU - Chen, D. AU - Robbins, F. AU - Wang, L. AU - Larsen, P. AU - Luhm, R. AU - Stroncek, D. F. PY - 2004 DA - 2004// TI - Ambiguous allele combinations in HLA Class I and Class II sequence-based typing: when precise nucleotide sequencing leads to imprecise allele identification JO - J Transl Med VL - 2 UR - https://doi.org/10.1186/1479-5876-2-30 DO - 10.1186/1479-5876-2-30 ID - Adams2004 ER - TY - JOUR AU - Roberts, R. J. AU - Carneiro, M. O. AU - Schatz, M. C. PY - 2013 DA - 2013// TI - The advantages of SMRT sequencing JO - Genome Biol VL - 14 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2013-14-6-405 DO - 10.1186/gb-2013-14-6-405 ID - Roberts2013 ER - TY - STD TI - PacBio: Targeted Sequencing – SNP Detection and Validation. Technical Note PN 100-092-600-03, Pacific Biosciences 2012, [], ID - ref14 ER - TY - JOUR AU - Huang, X. AU - Madan, A. PY - 1999 DA - 1999// TI - CAP3: A DNA sequence assembly program JO - Genome Res VL - 9 UR - https://doi.org/10.1101/gr.9.9.868 DO - 10.1101/gr.9.9.868 ID - Huang1999 ER - TY - JOUR AU - Huang, X. AU - Wang, J. AU - Aluru, S. AU - Yang, S. -. P. AU - Hillier, L. PY - 2003 DA - 2003// TI - PCAP: a whole-genome assembly program JO - Genome Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1101/gr.1390403 DO - 10.1101/gr.1390403 ID - Huang2003 ER - TY - JOUR AU - Shaw, C. K. AU - Chen, L. L. AU - Lee, A. AU - Lee, T. D. PY - 1999 DA - 1999// TI - Distribution of HLA gene and haplotype frequencies in Taiwan: a comparative study among Min-nan, Hakka, Aborigines and mainland Chinese JO - Tissue Antigens VL - 53 UR - https://doi.org/10.1034/j.1399-0039.1999.530106.x DO - 10.1034/j.1399-0039.1999.530106.x ID - Shaw1999 ER - TY - STD TI - The Allele Frequency Net Database. [http://www.allelefrequencies.net], UR - http://www.allelefrequencies.net ID - ref18 ER - TY - JOUR AU - Gonzalez-Galarza, F. F. AU - Christmas, S. AU - Middleton, D. AU - Jones, A. R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Allele frequency net: a database and online repository for immune gene frequencies in worldwide populations JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkq1128 DO - 10.1093/nar/gkq1128 ID - Gonzalez-Galarza2011 ER - TY - STD TI - IGMT/HLA Database. [http://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/], UR - http://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/ ID - ref20 ER - TY - JOUR AU - Ono, Y. AU - Asai, K. AU - Hamada, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - PBSIM: PacBio reads simulator–toward accurate genome assembly JO - Bioinformatics VL - 29 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts649 DO - 10.1093/bioinformatics/bts649 ID - Ono2013 ER - TY - STD TI - Harris RS: Improved pairwise alignment of genomic dna. PhD thesis. The Pennsylvania State University; 2007, ID - ref22 ER - TY - BOOK AU - Agresti, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Categorical Data Analysis, vol 359 PB - Sons CY - Gainesvilla, Florida UR - https://doi.org/10.1002/0471249688 DO - 10.1002/0471249688 ID - Agresti2002 ER -