From: DBBP: database of binding pairs in protein-nucleic acid interactions
 |  | RNA-protein complex | DNA-protein complex | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
AA | Atom | Acceptor | Donor | #H-bonds | Acceptor | Donor | #H-bonds |
Ala | N | Â | 1,069 | 1,653 | Â | 674 | 808 |
 | O | 567 |  |  | 134 |  |  |
 | OXT | 17 |  |  |  |  |  |
Arg | NH2 | Â | 9,252 | 22,395 | Â | 6,144 | 13,705 |
 | NH1 |  | 7,278 |  |  | 4,665 |  |
 | NE |  | 4,011 |  |  | 2,191 |  |
 | N |  | 1,388 |  |  | 606 |  |
 | O | 455 |  |  | 99 |  |  |
 | OXT | 13 |  |  |  |  |  |
Asn | ND2 | Â | 3,268 | 4,953 | Â | 2349 | 3,119 |
 | OD1 | 934 |  |  | 408 |  |  |
 | N |  | 549 |  |  | 261 |  |
 | O | 202 |  |  | 101 |  |  |
Asp | OD2 | 1,416 | Â | 2,829 | 353 | Â | 735 |
 | OD1 | 1,183 |  |  | 290 |  |  |
 | O | 178 |  |  | 31 |  |  |
 | N |  | 52 |  |  | 61 |  |
Cys | SG | 23 | 76 | 125 | 19 | 120 | 215 |
 | O | 24 |  |  |  |  |  |
 | N |  | 2 |  |  | 76 |  |
Gln | NE2 | 168 | 2496 | 4,468 | 2 | 1,593 | 2,571 |
 | OE1 | 1,108 |  |  | 363 | 521 |  |
 | N |  | 480 |  |  |  |  |
 | O | 216 |  |  | 92 |  |  |
Glu | OE2 | 1,691 | Â | 3,507 | 275 | Â | 737 |
 | OE1 | 1,315 |  |  | 260 |  |  |
 | O | 193 |  |  | 19 |  |  |
 | N |  | 308 |  |  | 183 |  |
Gly | N | Â | 1,518 | 2,699 | Â | 1749 | 1,902 |
 | O | 1,175 |  |  | 153 |  |  |
 | OXT | 6 |  |  |  |  |  |
His | NE2 | 412 | 1,454 | 3,591 | 30 | 768 | 1,254 |
 | ND1 | 536 | 1,014 |  | 15 | 327 |  |
 | N |  | 106 |  |  | 90 |  |
 | O | 69 |  |  | 24 |  |  |
Ile | N | Â | 258 | 309 | Â | 433 | 466 |
 | O | 40 |  |  | 33 |  |  |
 | OXT | 11 |  |  |  |  |  |
Leu | N | Â | 507 | 766 | Â | 362 | 387 |
 | O | 259 |  |  | 25 |  |  |
Lys | NZ | Â | 9,864 | Â | Â | 5,145 | 6,351 |
 | N |  | 852 | 11,436 | 86 | 1,120 |  |
 | O | 717 |  |  |  |  |  |
 | OXT | 3 |  |  |  |  |  |
Met | SD | 105 | Â | 662 | 15 | Â | 147 |
 | O | 276 |  |  | 13 | 119 |  |
 | N |  | 278 |  |  |  |  |
 | OXT | 3 |  |  |  |  |  |
Phe | O | 333 | Â | 539 | 42 | Â | 247 |
 | N |  | 206 |  |  | 205 |  |
Pro | O | 161 | Â | 161 | 28 | Â | 28 |
Ser | OG | 1,179 | 4,675 | 6,997 | 182 | 3,533 | 4,741 |
 | N |  | 683 |  |  | 958 |  |
 | O | 460 |  |  | 68 |  |  |
Thr | OG1 | 1,058 | 4,406 | 7,267 | 158 | 3,017 | 4,252 |
 | O | 750 |  |  | 132 |  |  |
 | N |  | 1,053 |  |  | 945 |  |
Trp | NE1 | Â | 532 | 582 | Â | 358 | 393 |
 | OXT | 16 |  |  |  |  |  |
 | O | 14 |  |  | 10 |  |  |
 | N |  | 20 |  |  | 25 |  |
Tyr | OH | 597 | 1,935 | 2,682 | 133 | 1,800 | 2,511 |
 | O | 93 |  |  | 28 |  |  |
 | N |  | 57 |  |  | 550 |  |
Val | O | 174 | Â | 326 | 36 | Â | 386 |
 | N |  | 151 |  |  | 350 |  |
 | OXT | 1 |  |  |  |  |  |
 |  | 18,151 | 59,796 | 77,947 | 3,657 | 41,298 | 44,955 |