Skip to main content

Table 3 A comparison of protein structure remodelings.

From: Adjusting protein graphs based on graph entropy

PID

 

1K5N

2CRY

1VCA

2Q3Z

1ZXQ

1A21

2ENG

1UXW

1A2Y

3ARD

1HDM

Old

7.93

23.36

15.68

24.01

13.74

6.54

12.57

7.92

5.75

8.27

 

New

7.75

21.12

13.87

23.67

12.11

5.64

11.03

7.25

5.41

7.79

 

Result

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

1K5N

Old

·

26.58

19.55

26.91

18.02

14.65

17.69

20.44

18.41

25.72

 

New

·

23.70

17.39

21.13

15.99

12.83

15.84

17.17

16.94

23.64

 

Result

·

+

+

+

+

+

+

+

+

+

2CRY

Old

·

·

14.87

12.33

17.13

14.39

15.62

19.33

6.81

18.42

 

New

·

·

12.91

34.10

14.92

12.45

17.54

19.35

5.17

19.63

 

Result

·

·

+

−

+

+

−

=

+

−

1VCA

Old

·

·

·

17.71

5.39

4.83

7.75

11.42

5.45

12.80

 

New

·

·

·

29.68

4.47

3.21

6.82

10.07

4.83

11.67

 

Result

·

·

·

-

+

+

+

+

+

+

2Q3Z

Old New

·

·

·

·

27.57 26.31

29.30 28.35

23.46 21.11

25.45 24.52

38.30 36.72

24.14 23.00

 

Result

·

·

·

·

+

+

+

+

+

+

1ZXQ

Old New

·

·

·

·

·

3.98 3.41

7.96 7.49

10.52 9.67

6.21 6.53

9.14 8.87

 

Result

·

·

·

·

·

+

+

+

−

+

1A21

Old

·

·

·

·

·

·

6.24

12.76

7.37

12.85

 

New

·

·

·

·

·

·

5.41

11.38

6.91

11.06

 

Result

·

·

·

·

·

·

+

+

+

+

2ENG

Old

·

·

·

·

·

·

·

4.65

11.42

14.19

 

New

·

·

·

·

·

·

·

4.17

10.39

13.82

 

Result

·

·

·

·

·

·

·

+

+

+

1UXW

Old

·

·

·

·

·

·

·

·

16.24

5.71

 

New

·

·

·

·

·

·

·

·

15.41

3.45

 

Result

·

·

·

·

·

·

·

·

+

+

1A2Y

Old

·

·

·

·

·

·

·

·

·

12.24

 

New

·

·

·

·

·

·

·

·

·

11.41

 

Result

·

·

·

·

·

·

·

·

·

+