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Table 3 Sample pathway activity. The individual sample pathway activity p-values and sign for each pathway and six of the van 't Veer breast cancer samples. Bold face indicates significant (i.e. p-value ≤ 0.05) pathway activity in the sample. ER notation as in Table 1.

From: Signal transduction pathway profiling of individual tumor samples

 

1

2

3

4

5

6

ER-induced

0.7066(-)

0.0000(+)

0.4822(+)

0.1648(+)

0.4106(+)

0.0072(+)

EDAR

0.0052(-)

0.1514(-)

0.1294(-)

0.8566(+)

0.0010(-)

0.0008(-)

IL-1

0.0074(-)

0.0416(-)

0.0158(-)

0.3848(+)

0.0088(-)

0.0002(-)

RANK

0.0058(-)

0.1506(-)

0.1340(-)

0.8598(+)

0.0022(-)

0.0008(-)

TNF-α

0.0014(-)

0.1744(-)

0.2596(-)

0.4044(+)

0.0030(-)

0.0006(-)

EGF network

0.2868(-)

0.3030(-)

0.4522(-)

0.9360(-)

0.2138(-)

0.0000(-)

ER

0.9994(-)

0.0002(+)

0.3074(+)

0.7624(+)

0.7886(-)

0.0002(+)

ER-induced (v)

0.4940(-)

0.0136(+)

0.1670(+)

0.3060(+)

0.3310(+)

0.3750(+)

TLR4

0.1584(-)

0.2572(-)

0.2624(-)

0.7778(+)

0.1856(-)

0.0000(-)

fMLP

0.0122(-)

0.0432(-)

0.0004(-)

0.7188(+)

0.0362(-)

0.0268(-)

Insulin

0.9274(-)

0.0182(-)

0.3926(-)

0.6116(+)

0.7898(+)

0.0172(-)

ER (v)

0.9382(-)

0.0084(+)

0.0680(+)

0.0806(+)

0.3266(-)

0.0802(+)

TGFβ network

0.1102(+)

0.7054(+)

0.8274(-)

0.3528(-)

0.7902(-)

0.2550(-)

c-Kit

0.2892(-)

0.0282(-)

0.3000(-)

0.7884(-)

0.0470(-)

0.2398(-)

ER-repressed (v)

0.3518(+)

0.0566(+)

0.0588(+)

0.0426(+)

0.0034(-)

0.0536(+)

VEGF

0.6526(-)

0.3174(+)

0.4388(-)

0.9372(-)

0.8526(-)

0.8608(-)

IL-10

0.3984(-)

0.5984(+)

0.8164(-)

0.8188(+)

0.2442(-)

0.7698(+)

IFN

0.3934(-)

0.7678(+)

0.4792(-)

0.7824(+)

0.5702(-)

0.7430(-)

PRL

0.3984(-)

0.7726(+)

0.4794(-)

0.7840(+)

0.5782(-)

0.7344(-)

TPO

0.3852(-)

0.7500(+)

0.4736(-)

0.8056(+)

0.5588(-)

0.7388(-)

PDGF

0.9488(+)

0.4568(-)

0.6370(-)

0.5418(-)

0.6680(+)

0.4060(-)

Oncostatin M

0.2746(-)

0.2986(-)

0.1848(-)

0.1428(+)

0.7450(+)

0.0046(-)

T-cell antigen receptor

0.2092(-)

0.1006(-)

0.0094(-)

0.9426(+)

0.6404(-)

0.3304(+)

B-cell antigen receptor

0.1978(-)

0.1040(-)

0.0142(-)

0.9484(+)

0.6508(-)

0.3222(+)

IL-12 – STAT4

0.3458(+)

0.4402(+)

0.8902(+)

0.6424(+)

0.1982(-)

0.9878(-)

ER-repressed

0.5724(+)

0.4596(+)

0.3936(+)

0.1784(-)

0.0830(-)

0.0158(+)

IL-2 – STAT5

0.1816(-)

0.8828(-)

0.4774(-)

0.7768(-)

0.3486(+)

0.0376(-)

IL-4 – STAT6

0.8268(-)

0.1670(-)

0.9212(-)

0.3412(-)

0.1430(+)

0.1510(-)

Wnt

0.8484(-)

0.1054(-)

0.0878(-)

0.5868(-)

0.3756(-)

0.5084(-)