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Table 2 Analysis of phylogenetic lineages containing human Hox cluster genes

From: PhyloPat: phylogenetic pattern analysis of eukaryotic genes

ppid(s)

name

cluster A

cluster B

cluster C

cluster D

first sp.

position

PP053829, PP085049

HOX1

HOXA1

HOXB1

 

HOXD1

T. nigrov.

anterior

PP053847, PP053833

HOX2

HOXA2

HOXB2

  

T. nigrov.

anterior

PP053836, PP053845, PP053834

HOX3

HOXA3

HOXB3

 

HOXD3

T. nigrov.

PG3

PP053853, PP053830, PP024984, PP053839

HOX4

HOXA4

HOXB4

HOXC4

HOXD4

A. gamb.

central

PP053832, PP053844, PP075622

HOX5

HOXA5

HOXB5

HOXC5

 

T. nigrov.

central

PP053849

HOX6

HOXA6

HOXB6

HOXC6

 

T. nigrov.

central

PP070659

HOX7

HOXA7

HOXB7

  

G. acul.

central

PP049478

HOX8

 

HOXB8

HOXC8

HOXD8

C. intest.

central

PP053835, PP053854

HOX9

HOXA9

HOXB9

HOXC9

HOXD9

T. nigrov.

posterior

PP053827, PP084287, PP053846

HOX10

HOXA10

 

HOXC10

HOXD10

T. nigrov.

posterior

PP053858, PP053840, PP053824

HOX11

HOXA11

 

HOXC11

HOXD11

T. nigrov.

posterior

PP053838, PP087941

HOX12

  

HOXC12

HOXD12

T. nigrov.

posterior

PP053842, PP089685, PP053828

HOX13

HOXA13

HOXB13

HOXC13

HOXD13

T. nigrov.

posterior

PP027791

TLX

TLX1

TLX2

TLX3

 

A. gamb.

 

PP022041

MSX

MSX1

MSX2

  

C. eleg.

Â