Skip to main content

Table 1 Pair-wise R values calculated using the PD matrix and the first number of SGM for proteins in structure set I.

From: Protein structure similarity from principle component correlation analysis

  

1F16

1G5M

1GJH

1MAZ

1DDB

1MDT

1COL

1A6G

1A4F

2BID

PCC

0.0249

0.0188

0.2185

0.2676

0.0000

0.0093

0.0337

0.2452

0.2835

 

SGM

0.0530

0.3510

0.3510

0.5940

0.0210

0.1810

0.0031

0.4890

0.5420

1F16

PCC

 

0.1630

0.1248

0.1750

0.0000

0.3280

0.0005

0.2915

0.2780

 

SGM

 

0.2980

0.2980

0.5410

0.0320

0.1280

0.0530

0.4360

0.4890

1G5M

PCC

  

0.2077

0.1836

0.0000

0.0013

0.0145

0.2943

0.2624

 

SGM

  

0.0005

0.2430

0.3300

0.1700

0.3510

0.1380

0.1910

1GJH

PCC

   

0.1790

0.0000

0.0109

0.0327

0.2421

0.2899

 

SGM

   

0.2430

0.3300

0.1700

0.3510

0.1380

0.1910

1MAZ

PCC

    

0.0031

0.0092

0.0303

0.0107

0.2537

 

SGM

    

0.5730

0.4130

0.5940

0.1050

0.0520

1DDB

PCC

     

0.0054

0.0293

0.0068

0.2286

 

SGM

     

0.1600

0.0210

0.4680

0.5210

1MDT

PCC

      

0.0112

0.2390

0.2904

 

SGM

      

0.1810

0.3080

0.3610

1COL

PCC

       

0.0081

0.2496

 

SGM

       

0.4890

0.5420

1A6G

PCC

        

0.1950

 

SGM

        

0.0530