Skip to main content

Table 1 Pair-wise R values calculated using the PD matrix and the first number of SGM for proteins in structure set I.

From: Protein structure similarity from principle component correlation analysis

   1F16 1G5M 1GJH 1MAZ 1DDB 1MDT 1COL 1A6G 1A4F
2BID PCC 0.0249 0.0188 0.2185 0.2676 0.0000 0.0093 0.0337 0.2452 0.2835
  SGM 0.0530 0.3510 0.3510 0.5940 0.0210 0.1810 0.0031 0.4890 0.5420
1F16 PCC   0.1630 0.1248 0.1750 0.0000 0.3280 0.0005 0.2915 0.2780
  SGM   0.2980 0.2980 0.5410 0.0320 0.1280 0.0530 0.4360 0.4890
1G5M PCC    0.2077 0.1836 0.0000 0.0013 0.0145 0.2943 0.2624
  SGM    0.0005 0.2430 0.3300 0.1700 0.3510 0.1380 0.1910
1GJH PCC     0.1790 0.0000 0.0109 0.0327 0.2421 0.2899
  SGM     0.2430 0.3300 0.1700 0.3510 0.1380 0.1910
1MAZ PCC      0.0031 0.0092 0.0303 0.0107 0.2537
  SGM      0.5730 0.4130 0.5940 0.1050 0.0520
1DDB PCC       0.0054 0.0293 0.0068 0.2286
  SGM       0.1600 0.0210 0.4680 0.5210
1MDT PCC        0.0112 0.2390 0.2904
  SGM        0.1810 0.3080 0.3610
1COL PCC         0.0081 0.2496
  SGM         0.4890 0.5420
1A6G PCC          0.1950
  SGM          0.0530