TY - JOUR AU - Cross, G. A. M. PY - 1996 DA - 1996// TI - Antigenic variation in trypanosomes - secrets surface slowly JO - Bioessays VL - 18 UR - https://doi.org/10.1002/bies.950180406 DO - 10.1002/bies.950180406 ID - Cross1996 ER - TY - JOUR AU - Ferguson, M. A. J. PY - 1999 DA - 1999// TI - The structure, biosynthesis and functions of glycosylphosphatidylinositol anchors, and the contributions of trypanosome research JO - J Cell Sci VL - 112 ID - Ferguson1999 ER - TY - JOUR AU - Barry, J. D. AU - McCulloch, R. PY - 2001 DA - 2001// TI - Antigenic variation in trypanosomes: Enhanced phenotypic variation in a eukaryotic parasite. JO - Adv Parasitol VL - 49 UR - https://doi.org/10.1016/S0065-308X(01)49037-3 DO - 10.1016/S0065-308X(01)49037-3 ID - Barry2001 ER - TY - JOUR AU - Berriman, M. AU - Ghedin, E. AU - Hertz-Fowler, C. AU - Blandin, G. AU - Renauld, H. AU - Bartholomeu, D. C. AU - Lennard, N. J. AU - Caler, E. AU - Hamlin, N. E. AU - Haas, B. AU - Bohme, U. AU - Hannick, L. AU - Aslett, M. A. AU - Shallom, J. AU - Marcello, L. AU - Hou, L. AU - Wickstead, B. AU - Alsmark, U. C. AU - Arrowsmith, C. AU - Atkin, R. J. AU - Barron, A. J. AU - Bringaud, F. AU - Brooks, K. AU - Carrington, M. AU - Cherevach, I. AU - Chillingworth, T. J. AU - Churcher, C. AU - Clark, L. N. AU - Corton, C. H. AU - Cronin, A. AU - Davies, R. M. AU - Doggett, J. AU - Djikeng, A. AU - Feldblyum, T. AU - Field, M. C. AU - Fraser, A. AU - Goodhead, I. AU - Hance, Z. AU - Harper, D. AU - Harris, B. R. AU - Hauser, H. AU - Hostetler, J. AU - Ivens, A. AU - Jagels, K. AU - Johnson, D. AU - Johnson, J. AU - Jones, K. AU - Kerhornou, A. X. AU - Koo, H. AU - Larke, N. AU - Landfear, S. AU - Larkin, C. AU - Leech, V. AU - Line, A. AU - Lord, A. AU - MacLeod, A. AU - Mooney, P. J. AU - Moule, S. AU - Martin, D. M. AU - Morgan, G. W. AU - Mungall, K. AU - Norbertczak, H. AU - Ormond, D. AU - Pai, G. AU - Peacock, C. S. AU - Peterson, J. AU - Quail, M. A. AU - Rabbinowitsch, E. AU - Rajandream, M. A. AU - Reitter, C. AU - Salzberg, S. L. AU - Sanders, M. AU - Schobel, S. AU - Sharp, S. AU - Simmonds, M. AU - Simpson, A. J. AU - Tallon, L. AU - Turner, C. M. AU - Tait, A. AU - Tivey, A. R. AU - Van Aken, S. AU - Walker, D. AU - Wanless, D. AU - Wang, S. AU - White, B. AU - White, O. AU - Whitehead, S. AU - Woodward, J. AU - Wortman, J. AU - Adams, M. D. AU - Embley, T. M. AU - Gull, K. AU - Ullu, E. AU - Barry, J. D. AU - Fairlamb, A. H. AU - Opperdoes, F. AU - Barrell, B. G. AU - Donelson, J. E. AU - Hall, N. AU - Fraser, C. M. AU - Melville, S. E. AU - El Sayed, N. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - The genome of the African trypanosome Trypanosoma brucei JO - Science VL - 309 UR - https://doi.org/10.1126/science.1112642 DO - 10.1126/science.1112642 ID - Berriman2005 ER - TY - JOUR AU - Carrington, M. AU - Miller, N. AU - Blum, M. AU - Roditi, I. AU - Wiley, D. AU - Turner, M. PY - 1991 DA - 1991// TI - Variant specific glycoprotein of Trypanosoma brucei consists of two domains each having an independently conserved pattern of cysteine residues JO - J Mol Biol VL - 221 UR - https://doi.org/10.1016/0022-2836(91)80178-W DO - 10.1016/0022-2836(91)80178-W ID - Carrington1991 ER - TY - JOUR AU - Blum, M. L. AU - Down, J. A. AU - Gurnett, A. M. AU - Carrington, M. AU - Turner, M. J. AU - Wiley, D. C. PY - 1993 DA - 1993// TI - A structural motif in the variant surface glycoproteins of Trypanosoma brucei JO - Nature VL - 362 UR - https://doi.org/10.1038/362603a0 DO - 10.1038/362603a0 ID - Blum1993 ER - TY - JOUR AU - Allen, G. AU - Gurnett, L. P. PY - 1983 DA - 1983// TI - Locations of the six disulfide bonds in a variant surface glycoprotein (VSG 117) from Trypanosoma brucei JO - Biochem J VL - 209 UR - https://doi.org/10.1042/bj2090481 DO - 10.1042/bj2090481 ID - Allen1983 ER - TY - JOUR AU - Miller, E. N. AU - Allan, L. M. AU - Turner, M. J. PY - 1984 DA - 1984// TI - Topological analysis of antigenic determinants on a variant surface glycoprotein of Trypanosoma brucei JO - Mol Biochem Parasitol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/0166-6851(84)90102-6 DO - 10.1016/0166-6851(84)90102-6 ID - Miller1984 ER - TY - JOUR AU - Miller, E. N. AU - Allan, L. M. AU - Turner, M. J. PY - 1984 DA - 1984// TI - Mapping of antigenic determinants within peptides of a variant surface glycoprotein of Trypanosoma brucei JO - Mol Biochem Parasitol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/0166-6851(84)90122-1 DO - 10.1016/0166-6851(84)90122-1 ID - Miller1984 ER - TY - JOUR AU - Masterson, W. J. AU - Taylor, D. AU - Turner, M. J. PY - 1988 DA - 1988// TI - Topologic analysis of the epitopes of a variant surface glycoprotein of Trypanosoma brucei JO - J Immunol VL - 140 ID - Masterson1988 ER - TY - JOUR AU - Bohme, U. AU - Cross, G. A. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Mutational analysis of the variant surface glycoprotein GPI- anchor signal sequence in Trypanosoma brucei JO - J Cell Sci VL - 115 ID - Bohme2002 ER - TY - JOUR AU - Callejas, S. AU - Leech, V. AU - Reitter, C. AU - Melville, S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Hemizygous subtelomeres of an African trypanosome chromosome may account for over 75% of chromosome length JO - Genome Res VL - 16 UR - https://doi.org/10.1101/gr.5147406 DO - 10.1101/gr.5147406 ID - Callejas2006 ER - TY - JOUR AU - Williams, R. O. AU - Young, J. R. AU - Majiwa, P. A. O. PY - 1982 DA - 1982// TI - Genomic environment of T. brucei VSG genes - presence of a minichromosome JO - Nature VL - 299 UR - https://doi.org/10.1038/299417a0 DO - 10.1038/299417a0 ID - Williams1982 ER - TY - JOUR AU - Alsford, S. AU - Wickstead, B. AU - Ersfeld, K. AU - Gull, K. PY - 2001 DA - 2001// TI - Diversity and dynamics of the minichromosomal karyotype in Trypanosoma brucei JO - Mol Biochem Parasitol VL - 113 UR - https://doi.org/10.1016/S0166-6851(00)00388-1 DO - 10.1016/S0166-6851(00)00388-1 ID - Alsford2001 ER - TY - JOUR AU - Barbet, A. F. AU - Kamper, S. M. PY - 1993 DA - 1993// TI - The importance of mosaic genes to trypanosome survival JO - Parasitol Today VL - 9 UR - https://doi.org/10.1016/0169-4758(93)90039-I DO - 10.1016/0169-4758(93)90039-I ID - Barbet1993 ER - TY - JOUR AU - Linardopoulou, E. V. AU - Williams, E. M. AU - Fan, Y. AU - Friedman, C. AU - Young, J. M. AU - Trask, B. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Human subtelomeres are hot spots of interchromosomal recombination and segmental duplication JO - Nature VL - 437 UR - https://doi.org/10.1038/nature04029 DO - 10.1038/nature04029 ID - Linardopoulou2005 ER - TY - JOUR AU - Barry, J. D. AU - Ginger, M. L. AU - Burton, P. AU - McCulloch, R. PY - 2003 DA - 2003// TI - Why are parasite contingency genes often associated with telomeres? JO - Int J Parasitol VL - 33 UR - https://doi.org/10.1016/S0020-7519(02)00247-3 DO - 10.1016/S0020-7519(02)00247-3 ID - Barry2003 ER - TY - JOUR AU - Ricchetti, M. AU - Dujon, B. AU - Fairhead, C. PY - 2003 DA - 2003// TI - Distance from the chromosome end determines the efficiency of double strand break repair in subtelomeres of haploid yeast JO - J Mol Biol VL - 328 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(03)00315-2 DO - 10.1016/S0022-2836(03)00315-2 ID - Ricchetti2003 ER - TY - STD TI - Artemis: a DNA sequence viewer and annotation tool[http://www.sanger.ac.uk/Software/Artemis/] UR - http://www.sanger.ac.uk/Software/Artemis/ ID - ref19 ER - TY - STD TI - Trypanosoma brucei GeneDB[http://www.genedb.org/genedb/tryp/] UR - http://www.genedb.org/genedb/tryp/ ID - ref20 ER - TY - STD TI - big-PI Predictor[http://mendel.imp.ac.at/gpi/gpi_server.html] UR - http://mendel.imp.ac.at/gpi/gpi_server.html ID - ref21 ER - TY - STD TI - DGPI[http://129.194.185.165/dgpi/index_en.html] UR - http://129.194.185.165/dgpi/index_en.html ID - ref22 ER - TY - STD TI - VSGdb A database of trypanosomal variant surface glycoproteins[http://www.vsgdb.org] UR - http://www.vsgdb.org ID - ref23 ER - TY - STD TI - The EMBL Nucleotide Sequence Database[http://www.ebi.ac.uk/embl/Documentation/] UR - http://www.ebi.ac.uk/embl/Documentation/ ID - ref24 ER - TY - STD TI - BioPerl[http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page] UR - http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page ID - ref25 ER - TY - STD TI - Fasta format description[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/fasta.shtml] UR - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/fasta.shtml ID - ref26 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Gish, W. AU - Miller, W. AU - Myers, E. W. AU - Lipman, D. J. PY - 1990 DA - 1990// TI - Basic local alignment search tool JO - J Mol Biol VL - 215 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(05)80360-2 DO - 10.1016/S0022-2836(05)80360-2 ID - Altschul1990 ER - TY - JOUR AU - Hertz-Fowler, C. AU - Peacock, C. S. AU - Wood, V. AU - Aslett, M. AU - Kerhornou, A. AU - Mooney, P. AU - Tivey, A. AU - Berriman, M. AU - Hall, N. AU - Rutherford, K. AU - Parkhill, J. AU - Ivens, A. C. AU - Rajandream, M. A. AU - Barrell, B. PY - 2004 DA - 2004// TI - GeneDB: a resource for prokaryotic and eukaryotic organisms JO - Nucl Acids Res VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkh007 DO - 10.1093/nar/gkh007 ID - Hertz-Fowler2004 ER -