A constrained polynomial regression procedure for estimating the local False Discovery Rate

BMC Bioinformatics

Table 1 Estimated values of b₁ for the five estimators in each independent simulated case.

Case	m	π ₀	Configuration	polfdr	twilight	LocalFDR	pava.fdr	Locfdr
1	500	0.6	(a)	0.032	0.047	0.067	0.133	0.869
2			(b)	0.170	0.149	0.195	0.160	0.836
3			(c)	0.118	0.123	0.155	0.096	0.843
4		0.8	(a)	0.062	0.131	0.041	0.116	0.695
5			(b)	0.071	0.097	0.105	0.061	0.599
6			(c)	0.051	0.156	0.079	0.057	0.555
7		0.9	(a)	0.071	0.268	0.041	0.115	0.312
8			(b)	0.054	0.116	0.052	0.047	0.376
9			(c)	0.050	0.315	0.049	0.095	0.265
10		0.98	(a)	0.073	0.387	0.163	0.139	0.113
11			(b)	0.051	0.105	0.029	0.135	0.098
12			(c)	0.061	0.260	0.120	0.157	0.109
13	5,000	0.6	(a)	0.035	0.038	0.026	0.212	0.869
14			(b)	0.171	0.167	0.165	0.167	0.839
15			(c)	0.118	0.129	0.117	0.065	0.843
16		0.8	(a)	0.056	0.129	0.013	0.092	0.441
17			(b)	0.071	0.110	0.073	0.068	0.502
18			(c)	0.051	0.156	0.053	0.039	0.406
19		0.9	(a)	0.083	0.268	0.039	0.056	0.183
20			(b)	0.033	0.123	0.036	0.032	0.297
21			(c)	0.057	0.316	0.043	0.029	0.184
22		0.98	(a)	0.035	0.427	0.183	0.035	0.052
23			(b)	0.046	0.071	0.035	0.027	0.081
24			(c)	0.034	0.293	0.141	0.035	0.047

ISSN: 1471-2105