From: HoxPred: automated classification of Hox proteins using combinations of generalised profiles
PG | classification | nb variable | variable name and order |
---|---|---|---|
PG classification | |||
- | all-groups | 14 | PG7 PG9 PG1 PG2 PG6 PG13 PG11 PG10 PG3 PG12 PG14 PG4 PG8 PG5 |
OG classification | |||
PG1 | anterior | 18 | C6 B2 D4 C3 B6 D1 B7 A7 C4 B4 A5 C1 A2 A4 C8 D8 B5 A6 |
PG2 | 2-groups | A2 : 10 | A2 A3 B2 A5 A4 A6 A7 B4 B6 C4 |
B2 : 8 | B2 A2 A5 A6 A7 B7 B8 C6 | ||
PG3 | anterior | 18 | same as PG1 |
PG4 | all-groups | 20 | C6 D9 D13 D1 C13 C4 B3 A11 B1 A7 A9 C3 B4 C1 A6 A1 A4 D11 C5 B9 |
PG5 | anterior | 18 | same as PG1 |
PG6 | anterior | 18 | same as PG1 |
PG7 | 2-groups | A7 : 19 | A7 B6 A5 B5 A1 A2 A3 A6 B1 B2 A4 B3 B4 C1 C3 C4 D1 C5 D4 |
B7 : 24 | B7 A7 A1 B6 D8 A4 A2 A3 A5 B1 B2 B3 B5 A6 B8 C3 D1 C1 C4 C5 D3 B4 C8 D4 | ||
PG8 | anterior | 18 | same as PG1 |
PG9 | PG-groups | 4 | A9 B9 C9 D9 |
PG10 | posterior | 14 | B9 D13 A9 A13 A10 D9 C10 C9 C13 A11 B13 C12 D11 D12 |
PG11 | posterior | 14 | same as PG10 |
PG12 | posterior | 14 | same as PG10 |
PG13 | posterior | 14 | same as PG10 |