TY - JOUR AU - Gentleman, R. C. AU - Carey, V. J. AU - Bates, D. M. AU - Bolstad, B. AU - Dettling, M. AU - Dudoit, S. AU - Ellis, B. AU - Gautier, L. AU - Ge, Y. AU - Gentry, J. AU - Hornik, K. AU - Hothorn, T. AU - Huber, W. AU - Iacus, S. AU - Irizarry, R. AU - Leisch, F. AU - Li, C. AU - Maechler, M. AU - Rossini, A. J. AU - Sawitzki, G. AU - Smith, C. AU - Smyth, G. AU - Tierney, L. AU - Yang, J. Y. AU - Zhang, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Bioconductor: open software development for computational biology and bioinformatics JO - Genome Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2004-5-10-r80 DO - 10.1186/gb-2004-5-10-r80 ID - Gentleman2004 ER - TY - JOUR AU - Li, C. AU - Wong, W. H. PY - 2001 DA - 2001// TI - Model-based analysis of oligonucleotide arrays: expression index computation and outlier detection JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 98 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.98.1.31 DO - 10.1073/pnas.98.1.31 ID - Li2001 ER - TY - JOUR AU - Lin, M. AU - Wei, L. J. AU - Sellers, W. R. AU - Lieberfarb, M. AU - Wong, W. H. AU - Li, C. PY - 2004 DA - 2004// TI - dChipSNP: significance curve and clustering of SNP-array-based loss-of-heterozygosity data JO - Bioinformatics VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bth069 DO - 10.1093/bioinformatics/bth069 ID - Lin2004 ER - TY - JOUR AU - Oinn, T. AU - Greenwood, M. AU - Addis, M. AU - Alpdemir, M. N. AU - Ferris, J. AU - Glover, K. AU - Goble, C. AU - Goderis, A. AU - Hull, D. AU - Marvin, D. AU - Li, P. AU - Lord, P. AU - Pocock, M. R. AU - Senger, M. AU - Stevens, R. AU - Wipat, A. AU - Wroe, C. PY - 2005 DA - 2005// TI - Taverna: Lessons in creating a workflow environment for the life sciences in Concurrency and Computation: Practice and Experience JO - Grid Workflow Special Issue VL - 18 ID - Oinn2005 ER - TY - CHAP AU - Gentleman, R. AU - Temple Lang, D. PY - 2004 DA - 2004// TI - Statistical Analyses and Reproducible Research BT - Bioconductor Project Working Papers ID - Gentleman2004 ER - TY - JOUR AU - Zhao, X. AU - Li, C. AU - Paez, J. G. AU - Chin, K. AU - Janne, P. A. AU - Chen, T. H. AU - Girard, L. AU - Minna, J. AU - Christiani, D. AU - Leo, C. AU - Gray, J. W. AU - Sellers, W. R. AU - Meyerson, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - An integrated view of copy number and allelic alterations in the cancer genome using single nucleotide polymorphism arrays JO - Cancer Res VL - 64 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-03-3308 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-03-3308 ID - Zhao2004 ER - TY - CHAP AU - Buckheit, J. AU - Donoho, D. PY - 1995 DA - 1995// BT - WaveLab and Reproducible Research UR - https://doi.org/10.1007/978-1-4612-2544-7_5 DO - 10.1007/978-1-4612-2544-7_5 ID - Buckheit1995 ER - TY - JOUR AU - Gentleman, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Reproducible research: a bioinformatics case study JO - Stat Appl Genet Mol Biol VL - 4 ID - Gentleman2005 ER -