Skip to main content

Table 4 Error Rate in the 5 datasets.

From: A genetic approach for building different alphabets for peptide and protein classification

Error Rate   N = 1, S = 20 N = 2, S = 20 N = 2, S = 8 N = 1, S = 8 N = 2, S = 4 N = 1, S = 4 FUS1 FUS2
HIV1 Baseline 0.133 0.105 0.187 0.295 0.211 0.339 0.153 0.156
  GA(5) HP 0.133 0.105 0.117 0.165 0.117 0.21 0.105 0.100
HIV2 Baseline 0.145 0.054 0.107 0.219 0.179 0.219 0.153 0.157
  GA(5) HP 0.145 0.054 0.137 0.24 0.208 0.24 0.147 0.149
PEP Baseline 0.215 0.17 0.225 0.215 0.215 0.215 0.175 0.175
  GA(5) HP 0.215 0.17 0.120 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15
VAC1 Baseline 0.120 0.12 0.114 0.15 0.14 0.16 0.131 0.129
  GA(5) HP 0.120 0.12 0.108 0.188 0.187 0.188 0.107 0.110
VAC2 Baseline 0.210 0.17 0.173 0.3 0.285 0.311 0.285 0.275
  GA(5) HP 0.210 0.17 0.17 0.31 0.2515 0.310 0.15 0.15