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Table 1 Summary of identified PPI resources’ visualization control features

From: Integrated web visualizations for protein-protein interaction databases

Tool ID/

Apid

BioGrid

CPDB

IntAct

I2D

Mentha

Mint

Pinv

String

UniHI

Control Feature

          

Zoom

y

-

y

y

y

y

-

y

y

y

Select neighbors

-

-

y

y

y

y

-

-

-

-

Toggle labels

y

-

y

y

y

y

-

y

-

-

Fix/Unfix

-

-

-

-

y

y

y

y

y

-

Shrink/Grow

-

-

-

-

-

y

y

-

-

-

Toggle node shape

-

-

-

-

y

-

-

-

-

-

Select hubs

y

y

-

y

y

y

y

y

-

y

Select tree

-

y

-

-

-

y

-

-

-

-

Fit to screen

y

-

y

-

-

-

-

-

-

y

Clustering

-

-

y

-

-

-

-

y

y

y

Expand network

y

-

y

y

-

y

y

y

y

-

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BMC Bioinformatics

ISSN: 1471-2105

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