Softwarea | True InDels (%) | Size-correct InDels with wrong bases (%) | Missed InDels (%) | False positive InDels (%) |
---|---|---|---|---|
DiSNPindel | 43(53.1Â %) | 20 (24.7Â %) | 18 (22.2Â %) | 0 (0.0Â %) |
novoSNP | 6 (7.4Â %) | 7 (8.6Â %) | 68 (84.0Â %) | 34 (72.3Â %) |
Mutation surveyor | 7 (8.6Â %) | 7 (8.6Â %) | 67 (82.8Â %) | 26 (65.0Â %) |
PrimeIndel | 15 (18.5Â %) | 10 (12.3Â %) | 56 (69.1Â %) | 0 (0.0Â %) |