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Table 9 Worst predicted functions by HMC-LMLP-Predicted (means of AUPRC over the ten datasets)

From: Reduction strategies for hierarchical multi-label classification in protein function prediction

Function

HMC-LMLP-Predicted

Clus-HMC

 

Function

HMC-LMLP-Predicted

Clus-HMC

01.01.03.01.01

0.0005

0.0008

 

01.05.05

0.0010

0.0137

01.01.03.03

0.0005

0.0032

 

01.05.05.04

0.0003

0.0006

01.01.03.05

0.0066

0.0096

 

01.05.05.07

0.0004

0.0069

01.01.03.05.02

0.0005

0.0009

 

01.20.05

0.0011

0.0015

01.01.05.01.01

0.0005

0.0009

 

01.20.05.09

0.0004

0.0009

01.01.06.01

0.0026

0.0042

 

01.20.17.03

0.0005

0.0009

01.01.06.01.01

0.0004

0.0008

 

01.20.19.05

0.0004

0.0008

01.01.06.01.02

0.0004

0.0008

 

01.20.31

0.0004

0.0007

01.01.06.04

0.0017

0.0039

 

02.01.01

0.0004

0.0009

01.01.06.04.01

0.0004

0.0007

 

02.16.03

0.0004

0.0007

01.01.06.04.02

0.0003

0.0006

 

02.16.11

0.0003

0.0006

01.01.09.01

0.0011

0.0073

 

16.06

0.0004

0.0007

01.01.09.01.02

0.0003

0.0067

 

20.03.02.02

0.0003

0.0031

01.01.09.04.01

0.0005

0.0009

 

20.09.07.29

0.0004

0.0009

01.01.09.05.01

0.0005

0.0009

 

30.05.01.10

0.0004

0.0009

01.01.11.01

0.0004

0.0009

 

32.07.05

0.0004

0.0009

01.01.11.02.02

0.0005

0.0009

 

34.07.02

0.0004

0.0008

01.01.11.03.02

0.0005

0.0009

 

38

0.0857

0.0710

01.01.11.04

0.0041

0.0073

 

38.07

0.0004

0.0008

01.01.11.04.02

0.0005

0.0009

 

40.01.03.01

0.0004

0.0007

01.02.02

0.0036

0.0041

 

40.10.02

0.0012

0.0015

01.02.02.09

0.0036

0.0041

 

40.10.02.02

0.0004

0.0009

01.02.02.09.01

0.0005

0.0009

 

40.10.02.02.01

0.0004

0.0009

01.02.02.09.05

0.0004

0.0009

 

–

–

–

01.02.07

0.0079

0.0158

 

–

–

–

01.02.07.03

0.0004

0.0008

 

–

–

–