BMC Bioinformatics

Table 2 Minimal BER of the four classifiers in the top-100 features on the benchmark data sets

From: AVC: Selecting discriminative features on basis of AUC by maximizing variable complementarity

Classifier	Algorithm	Data sets
		COL	LYM	ALL	CNS	LEK	CAR	BR5	CLL	MLL	LIM	OVA	GLI	BRC
NB	AVC	0.125	0.121	0.097	0.2	0	0.207	0.073	0.186	0.012	0.07	0.009	0.046	0.135
	FAST	0.172	0.395	0.332	0.194	0	0.331	0.144	0.188	0.069	0.161	0.036	0.142	0.187
	ARCO	0.135	0.24	0.159	0.13	0	0.199	0.014	0.189	0.036	0.079	0.031	0.168	0.193
	ReliefF	0.135	0.247	0.159	0.2	0.141	0.212	0.16	0.245	0.012	0.125	0.009	0.089	0.165
SVM	AVC	0.085	0	0.03	0.101	0	0.051	0.006	0.134	0.012	0.085	0	0.054	0.116
	FAST	0.106	0.186	0.132	0.125	0	0.173	0.052	0.079	0.029	.056	0.003	0.104	0.078
	ARCO	0.111	0	0.115	0.044	0.01	0.055	0	0.12	0.042	0.054	0	0.046	x0.196
	ReliefF	0.111	0.086	0.069	0.169	0.057	0.08	0.143	0.194	0.012	0.082	0	0.065	0.132
1-NN	AVC	0.135	0.005	0.036	0.148	0.019	0.089	0.019	0.153	0.031	0.113	0.003	0.046	0.135
	FAST	0.141	0.198	0.201	0.289	0	0.247	0.081	0.139	0.052	0.121	0.003	0.089	0.214
	ARCO	0.107	0.018	0.127	0.149	0	0.098	0.019	0.181	0.056	0.063	0.003	0.073	0.173
	ReliefF	0.124	0.086	0.046	0.142	0.221	0.085	0.074	0.18	0.029	0.075	0.003	0.045	0.145
C4.5	AVC	0.073	0.362	0.167	0.236	0.104	0.289	0.136	0.193	0.107	0.259	0.019	0.065	0.193
	FAST	0.162	0.455	0.332	0.22	0.052	0.395	0.259	0.227	0.069	0.369	0.021	0.142	0.016
	ARCO	0.156	0.44	0.138	0.236	0.092	0.326	0.121	0.21	0.107	0.247	0.014	0.134	0.227
	ReliefF	0.12	0.395	0.268	0.333	0.152	0.265	0.308	0.237	0.06	0.153	0.016	0.13	0.227

Bold data in the table reflect the minimal BER of four classifiers in the top-100 features selected by four compared feature selection methods on the benchmark data sets

Back to article page

ISSN: 1471-2105

Contact us

General enquiries: journalsubmissions@springernature.com