TY - STD TI - Jinek M, Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E. A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity. Science. 2012;337(6096):816–21. doi:10.1126/science.1225829.Epub 2012 Jun 28. ID - ref1 ER - TY - JOUR AU - Ran, F. A. AU - Hsu, P. D. AU - Wright, J. AU - Agarwala, V. AU - Scott, D. A. AU - Zhang, F. PY - 2013 DA - 2013// TI - Genome engineering using the CRISPR-Cas9 system JO - Nat Protoc VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/nprot.2013.143 DO - 10.1038/nprot.2013.143 ID - Ran2013 ER - TY - STD TI - Maruyama T, Dougan SK, Truttmann MC, Bilate AM, Ingram JR, Ploegh HL. Increasing the efficiency of precise genome editing with CRISPR-Cas9 by inhibition of nonhomologous end joining. Nat Biotechnol. 2015;33(5):538–42. doi: 10.1038/nbt.3190. Erratum in: Nat Biotechnol. 2016;34(2):210. PubMed PMID: 25798939; PubMed Central PMCID: PMC4618510. ID - ref3 ER - TY - JOUR AU - Hsu, P. D. AU - Scott, D. A. AU - Weinstein, J. A. AU - Ran, F. A. AU - Konermann, S. AU - Agarwala, V. AU - Li, Y. AU - Fine, E. J. AU - Wu, X. AU - Shalem, O. AU - Cradick, T. J. AU - Marraffini, L. A. AU - Bao, G. AU - Zhang, F. PY - 2013 DA - 2013// TI - DNA targeting specificity of RNA-guided Cas9 nucleases JO - Nat Biotechnol VL - 31 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.2647 DO - 10.1038/nbt.2647 ID - Hsu2013 ER - TY - JOUR AU - Tsai, S. Q. AU - Zheng, Z. AU - Nguyen, N. T. AU - Liebers, M. AU - Topkar, V. V. AU - Thapar, V. AU - Wyvekens, N. AU - Khayter, C. AU - Iafrate, A. J. AU - Le, L. P. AU - Aryee, M. J. AU - Joung, J. K. PY - 2015 DA - 2015// TI - GUIDE-seq enables genome-wide profiling of off-target cleavage by CRISPR-Cas nucleases JO - Nat Biotechnol VL - 33 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.3117 DO - 10.1038/nbt.3117 ID - Tsai2015 ER - TY - JOUR AU - Haeussler, M. AU - Schönig, K. AU - Eckert, H. AU - Eschstruth, A. AU - Mianné, J. AU - Renaud, J. B. AU - Schneider-Maunoury, S. AU - Shkumatava, A. AU - Teboul, L. AU - Kent, J. AU - Joly, J. S. AU - Concordet, J. P. PY - 2016 DA - 2016// TI - Evaluation of off-target and on-target scoring algorithms and integration into the guide RNA selection tool CRISPOR JO - Genome Biol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1186/s13059-016-1012-2 DO - 10.1186/s13059-016-1012-2 ID - Haeussler2016 ER - TY - JOUR AU - Doench, J. G. AU - Hartenian, E. AU - Graham, D. B. AU - Tothova, Z. AU - Hegde, M. AU - Smith, I. AU - Sullender, M. AU - Ebert, B. L. AU - Xavier, R. J. AU - Root, D. E. PY - 2014 DA - 2014// TI - Rational design of highly active sgRNAs for CRISPR-Cas9-mediated gene inactivation JO - Nat Biotechnol VL - 32 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.3026 DO - 10.1038/nbt.3026 ID - Doench2014 ER - TY - JOUR AU - Doench, J. G. AU - Fusi, N. AU - Sullender, M. AU - Hegde, M. AU - Vaimberg, E. W. AU - Donovan, K. F. AU - Smith, I. AU - Tothova, Z. AU - Wilen, C. AU - Orchard, R. AU - Virgin, H. W. AU - Listgarten, J. AU - Root, D. E. PY - 2016 DA - 2016// TI - Optimized sgRNA design to maximize activity and minimize off-target effects of CRISPR-Cas9 JO - Nat Biotechnol VL - 34 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.3437 DO - 10.1038/nbt.3437 ID - Doench2016 ER - TY - JOUR AU - Wang, T. AU - Wei, J. J. AU - Sabatini, D. M. AU - Lander, E. S. PY - 2014 DA - 2014// TI - Genetic screens in human cells using the CRISPR-Cas9 system JO - Science VL - 343 UR - https://doi.org/10.1126/science.1246981 DO - 10.1126/science.1246981 ID - Wang2014 ER - TY - JOUR AU - Gilbert, L. A. AU - Horlbeck, M. A. AU - Adamson, B. AU - Villalta, J. E. AU - Chen, Y. AU - Whitehead, E. H. AU - Guimaraes, C. AU - Panning, B. AU - Ploegh, H. L. AU - Bassik, M. C. AU - Qi, L. S. AU - Kampmann, M. AU - Weissman, J. S. PY - 2014 DA - 2014// TI - Genome-Scale CRISPR-Mediated Control of Gene Repression and Activation JO - Cell VL - 159 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2014.09.029 DO - 10.1016/j.cell.2014.09.029 ID - Gilbert2014 ER - TY - JOUR AU - Popp, M. W. AU - Maquat, L. E. PY - 2016 DA - 2016// TI - Leveraging Rules of Nonsense-Mediated mRNA Decay for Genome Engineering and Personalized Medicine JO - Cell VL - 165 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2016.05.053 DO - 10.1016/j.cell.2016.05.053 ID - Popp2016 ER - TY - JOUR AU - Wu, X. AU - Scott, D. A. AU - Kriz, A. J. AU - Chiu, A. C. AU - Hsu, P. D. AU - Dadon, D. B. AU - Cheng, A. W. AU - Trevino, A. E. AU - Konermann, S. AU - Chen, S. AU - Jaenisch, R. AU - Zhang, F. AU - Sharp, P. A. PY - 2014 DA - 2014// TI - Genome-wide binding of the CRISPR endonuclease Cas9 in mammalian cells JO - Nat Biotechnol VL - 32 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.2889 DO - 10.1038/nbt.2889 ID - Wu2014 ER - TY - JOUR AU - Bae, S. AU - Kweon, J. AU - Kim, H. S. AU - Kim, J. S. PY - 2014 DA - 2014// TI - Microhomology-based choice of Cas9 nuclease target sites JO - Nat Methods VL - 11 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth.3015 DO - 10.1038/nmeth.3015 ID - Bae2014 ER - TY - JOUR AU - Shi, J. AU - Wang, E. AU - Milazzo, J. P. AU - Wang, Z. AU - Kinney, J. B. AU - Vakoc, C. R. PY - 2015 DA - 2015// TI - Discovery of cancer drug targets by CRISPR-Cas9 screening of protein domains JO - Nat Biotechnol VL - 33 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.3235 DO - 10.1038/nbt.3235 ID - Shi2015 ER - TY - JOUR AU - Munoz, D. M. AU - Cassiani, P. J. AU - Li, L. AU - Billy, E. AU - Korn, J. M. AU - Jones, M. D. AU - Golji, J. AU - Ruddy, D. A. AU - Yu, K. AU - McAllister, G. AU - DeWeck, A. AU - Abramowski, D. AU - Wan, J. AU - Shirley, M. D. AU - Neshat, S. Y. AU - Rakiec, D. AU - Beaumont, R. AU - Weber, O. AU - Kauffmann, A. AU - McDonald, E. R. AU - Keen, N. AU - Hofmann, F. AU - Sellers, W. R. AU - Schmelzle, T. AU - Stegmeier, F. AU - Schlabach, M. R. PY - 2016 DA - 2016// TI - CRISPR Screens Provide a Comprehensive Assessment of Cancer Vulnerabilities but Generate False-Positive Hits for Highly Amplified Genomic Regions JO - Cancer Discov VL - 6 UR - https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-16-0178 DO - 10.1158/2159-8290.CD-16-0178 ID - Munoz2016 ER - TY - JOUR AU - Hough, S. H. AU - Ajetunmobi, A. AU - Brody, L. AU - Humphryes-Kirilov, N. AU - Perello, E. PY - 2016 DA - 2016// TI - Desktop Genetics JO - Per Med VL - 13 UR - https://doi.org/10.2217/pme-2016-0068 DO - 10.2217/pme-2016-0068 ID - Hough2016 ER -