TY - JOUR AU - Liao, Y. AU - Smyth, G. K. AU - Shi, W. PY - 2014 DA - 2014// TI - featureCounts: an efficient general purpose program for assigning sequence reads to genomic features JO - Bionformatics VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btt656 DO - 10.1093/bioinformatics/btt656 ID - Liao2014 ER - TY - JOUR AU - Robert, C. AU - Watson, M. PY - 2015 DA - 2015// TI - Errors in RNA-Seq quantification affect genes of relevance to human disease JO - Genome Biol VL - 16 UR - https://doi.org/10.1186/s13059-015-0734-x DO - 10.1186/s13059-015-0734-x ID - Robert2015 ER - TY - JOUR AU - Anders, S. AU - Pyl, P. T. AU - Huber, W. PY - 2015 DA - 2015// TI - HTSeq–a Python framework to work with high-throughput sequencing data JO - Bionformatics VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu638 DO - 10.1093/bioinformatics/btu638 ID - Anders2015 ER - TY - JOUR AU - Akula, N. AU - Barb, J. AU - Jiang, X. AU - Wendland, J. R. AU - Choi, K. H. AU - Sen, S. K. AU - Hou, L. AU - Chen, D. T. W. AU - Laje, G. AU - Johnson, K. AU - Lipska, B. K. AU - Kleinman, J. E. AU - Corrada-Bravo, H. AU - Detera-Wadleigh, S. AU - Munson, P. J. AU - McMahon, F. J. PY - 2014 DA - 2014// TI - RNA-sequencing of the brain transcriptome implicates dysregulation of neuroplasticity, circadian rhythms and GTPase binding in bipolar disorder JO - Mol Psychiatry VL - 19 UR - https://doi.org/10.1038/mp.2013.170 DO - 10.1038/mp.2013.170 ID - Akula2014 ER - TY - JOUR AU - Geschwind, D. H. AU - Konopka, G. PY - 2012 DA - 2012// TI - Neuroscience: Genes and human brain evolution JO - Nature VL - 486 UR - https://doi.org/10.1038/nature11380 DO - 10.1038/nature11380 ID - Geschwind2012 ER - TY - JOUR AU - Love, M. I. AU - Huber, W. AU - Anders, S. PY - 2014 DA - 2014// TI - Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2 JO - Genome Biol VL - 15 UR - https://doi.org/10.1186/s13059-014-0550-8 DO - 10.1186/s13059-014-0550-8 ID - Love2014 ER - TY - JOUR AU - Huang, D. W. AU - Sherman, B. T. AU - Lempicki, R. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVID bioinformatics resources JO - Nat Protoc VL - 4 UR - https://doi.org/10.1038/nprot.2008.211 DO - 10.1038/nprot.2008.211 ID - Huang2009 ER - TY - JOUR AU - Boison, D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Adenosine kinase, epilepsy and stroke: mechanisms and therapies JO - Trends Pharmacol Sci VL - 27 UR - https://doi.org/10.1016/j.tips.2006.10.008 DO - 10.1016/j.tips.2006.10.008 ID - Boison2006 ER - TY - JOUR AU - Sakurai, T. AU - Dorr, N. P. AU - Takahashi, N. AU - McInnes, L. A. AU - Elder, G. A. AU - Buxbaum, J. D. PY - 2011 DA - 2011// TI - Haploinsufficiency of Gtf2i, a gene deleted in Williams Syndrome, leads to increases in social interactions JO - Autism Res VL - 4 UR - https://doi.org/10.1002/aur.169 DO - 10.1002/aur.169 ID - Sakurai2011 ER - TY - JOUR AU - Liu, X. Y. AU - Li, H. L. AU - Su, J. B. AU - Ding, F. H. AU - Zhao, J. J. AU - Chai, F. AU - Li, Y. X. AU - Cui, S. C. AU - Sun, F. Y. AU - Wu, Z. Y. AU - Xu, P. AU - Chen, X. H. PY - 2015 DA - 2015// TI - Regulation of RAGE splicing by hnRNP A1 and Tra2 β-1 and its potential role in AD pathogenesis JO - J Neurochem VL - 133 UR - https://doi.org/10.1111/jnc.13069 DO - 10.1111/jnc.13069 ID - Liu2015 ER - TY - JOUR AU - Patterson, V. L. AU - Zullo, A. J. AU - Koenig, C. AU - Stoessel, S. AU - Jo, H. AU - Liu, X. AU - Han, J. AU - Choi, M. AU - DeWan, A. T. AU - Thomas, J. L. AU - Kuan, C. Y. AU - Hoh, J. PY - 2014 DA - 2014// TI - Neural-Specific Deletion of Htra2 Causes Cerebellar Neurodegeneration and Defective Processing of Mitochondrial OPA1 JO - PLOS ONE VL - 9 ID - Patterson2014 ER - TY - JOUR AU - Wodarczyk, C. AU - Rowe, I. AU - Chiaravalli, M. AU - Pema, M. AU - Qian, F. AU - Boletta, A. PY - 2009 DA - 2009// TI - A Novel Mouse Model Reveals that Polycystin-1 Deficiency in Ependyma and Choroid Plexus Results in Dysfunctional Cilia and Hydrocephalus JO - PLOS ONE VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0007137 DO - 10.1371/journal.pone.0007137 ID - Wodarczyk2009 ER - TY - JOUR AU - Fregeau, B. AU - Kim, B. AU - Hernández-García, A. AU - Jordan, V. AU - Cho, M. AU - Schnur, R. AU - Monaghan, K. AU - Juusola, J. AU - Rosenfeld, J. AU - Bhoj, E. AU - Zackai, E. AU - Sacharow, S. AU - Barañano, K. AU - Bosch, D. M. AU - de Vries, B. A. AU - Lindstrom, K. AU - Schroeder, A. AU - James, P. AU - Kulch, P. AU - Lalani, S. AU - van Haelst, M. AU - van Gassen, K. I. AU - van Binsbergen, E. AU - Barkovich, A. J. AU - Scott, D. AU - Sherr, E. PY - 2017 DA - 2017// TI - De Novo Mutations of RERE Cause a Genetic Syndrome with Features that Overlap Those Associated with Proximal 1p36 Deletions JO - Trends Pharmacol Sci VL - 98 ID - Fregeau2017 ER - TY - JOUR AU - Barrett, T. AU - Wilhite, S. AU - Ledoux, P. AU - Evangelista, C. AU - Kim, I. AU - Tomashevsky, M. AU - Marshall, K. AU - Phillippy, K. AU - Sherman, P. AU - Holko, M. AU - Yefanov, A. AU - Lee, H. AU - Zhang, N. AU - Robertson, C. AU - Serova, N. AU - Davis, S. AU - Soboleva, A. PY - 2013 DA - 2013// TI - NCBI GEO: archive for functional genomics data sets–update JO - Nucleic Acids Res VL - 41 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gks1193 DO - 10.1093/nar/gks1193 ID - Barrett2013 ER - TY - JOUR AU - Dobin, A. AU - Davis, C. A. AU - Schlesinger, F. AU - Drenkow, J. AU - Zaleski, C. AU - Jha, S. AU - Batut, P. AU - Chaisson, M. AU - Gingeras, T. R. PY - 2013 DA - 2013// TI - STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner JO - Bionformatics VL - 29 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts635 DO - 10.1093/bioinformatics/bts635 ID - Dobin2013 ER - TY - JOUR AU - Hateleya, S. AU - Hosamanib, R. AU - Bhardwajb, S. R. AU - Pachtera, L. AU - Bhattacharyab, S. PY - 2016 DA - 2016// TI - Transcriptomic response of Drosophila melanogaster pupae developed in hypergravity JO - Genomics VL - 108 UR - https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2016.09.002 DO - 10.1016/j.ygeno.2016.09.002 ID - Hateleya2016 ER - TY - JOUR AU - Liu, X. AU - Zhang, Y. AU - Ni, M. AU - Cao, H. AU - Signer, R. A. J. AU - Li, D. AU - Li, M. AU - Gu, Z. AU - Hu, Z. AU - Dickerson, K. E. AU - Weinberg, S. E. AU - Chandel, N. S. AU - DeBerardinis, R. J. AU - Zhou, F. AU - Shao, Z. AU - Xu, J. PY - 2017 DA - 2017// TI - Regulation of mitochondrial biogenesis in erythropoiesis by mTORC1-mediated protein translation JO - Nat Cell Biol VL - 19 UR - https://doi.org/10.1038/ncb3527 DO - 10.1038/ncb3527 ID - Liu2017 ER - TY - JOUR AU - Tang, Y. AU - Liu, X. AU - Liu, X. AU - Li, Y. AU - Wu, K. PY - 2017 DA - 2017// TI - Arabidopsis NF-YCs Mediate the Light-Controlled Hypocotyl Elongation via Modulating Histone Acetylation JO - Mol Plant VL - 10 UR - https://doi.org/10.1016/j.molp.2016.11.007 DO - 10.1016/j.molp.2016.11.007 ID - Tang2017 ER - TY - JOUR AU - Losh, J. S. AU - King, A. K. AU - Bakelar, J. AU - Taylor, L. AU - Loomis, J. AU - Rosenzweig, J. A. AU - Johnson, S. J. AU - van Hoof, A. PY - 2015 DA - 2015// TI - Interaction between the RNA-dependent ATPase and poly(A) polymerase subunits of the TRAMP complex is mediated by short peptides and important for snoRNA processing JO - Nucleic Acids Res VL - 43 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkv005 DO - 10.1093/nar/gkv005 ID - Losh2015 ER -