BMC Bioinformatics

Table 11 Length similarity of large pairs of RNA structures in terms of component length and stem length

From: DCJ-RNA - double cut and join for RNA secondary structures

	I₁	I₂	I₃	I₄	I₅	I₆	I₇	I₈	I₉	I₁₀	I₁₁	I₁₂
H₁	0.35	0.63	0.83	0.13	0.11	0.2	0.15	0.23	0.38	0.39	0.67	0.62
H₂	0.44	0.59	1.0	0.13	0.15	0.2	0.14	0.21	0.41	0.38	0.65	0.66
H₃	0.26	0.24	0.13	1.0	0.37	0.7	0.77	0.26	0.04	0.44	0.24	0.07
H₄	0.42	0.11	0.15	0.37	1.0	0.56	0.31	0.09	0.1	0.23	0.2	0.12
H₅	0.41	0.21	0.2	0.7	0.56	1.0	0.64	0.21	0.06	0.45	0.37	0.11
H₆	0.27	0.27	0.14	0.77	0.31	0.64	1.0	0.37	0.04	0.48	0.26	0.08
H₇	0.27	0.41	0.21	0.26	0.09	0.21	0.37	1.0	0.06	0.52	0.36	0.11
H₈	0.21	0.21	0.41	0.04	0.1	0.06	0.04	0.06	1.0	0.12	0.23	0.66
H₉	0.6	0.57	0.38	0.44	0.23	0.45	0.48	0.52	0.12	1.0	0.63	0.21
H₁₀	0.57	0.64	0.65	0.24	0.2	0.37	0.26	0.36	0.23	0.63	1.0	0.39
H₁₁	0.36	0.36	0.66	0.07	0.12	0.11	0.08	0.11	0.66	0.21	0.39	1.0

Back to article page

ISSN: 1471-2105

Contact us

General enquiries: journalsubmissions@springernature.com