Table 3 Counts of the homologs of 4 genes from Brassicaceae species in each homology group
From: Efficient inference of homologs in large eukaryotic pan-proteomes
| Â | AP3 | AG | FLC | UBQ1 | ||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
(AT3G54340) | (AT4G18960) | (AT5G10140) | (AT3G52590) | |||||||||||||||||||||||||||||
d1 | d2 | d3 | d4 | d5 | d6 | d7 | d8 | d1 | d2 | d3 | d4 | d5 | d6 | d7 | d8 | d1 | d2 | d3 | d4 | d5 | d6 | d7 | d8 | d1 | d2 | d3 | d4 | d5 | d6 | d7 | d8 | |
A. thaliana | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 3 | 4 | 8 | 27 | 1 | 1 | 1 | 2 | 4 | 6 | 8 | 36 | 2 | 2 | 2 | 2 | 15 | 16 | 17 | 17 |
A. lyrata | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 4 | 7 | 24 | 0 | 1 | 1 | 1 | 4 | 5 | 5 | 32 | 0 | 0 | 0 | 0 | 19 | 20 | 21 | 22 |
C. rubella | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 3 | 4 | 8 | 24 | 0 | 1 | 1 | 1 | 2 | 3 | 4 | 33 | 2 | 2 | 2 | 2 | 15 | 15 | 18 | 19 |
M. maritima | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 4 | 7 | 24 | 0 | 1 | 1 | 1 | 4 | 4 | 6 | 34 | 2 | 2 | 2 | 2 | 12 | 12 | 16 | 18 |
D. sophiades | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 4 | 9 | 26 | 0 | 1 | 1 | 1 | 7 | 9 | 12 | 42 | 2 | 2 | 2 | 2 | 11 | 12 | 12 | 12 |
S. irio | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 3 | 6 | 0 | 0 | 2 | 3 | 8 | 8 | 10 | 26 | 0 | 0 | 0 | 2 | 4 | 4 | 11 | 36 | 3 | 3 | 3 | 3 | 13 | 14 | 17 | 20 |
M. perfoliatum | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 4 | 8 | 28 | 0 | 1 | 1 | 1 | 3 | 5 | 8 | 35 | 3 | 3 | 3 | 3 | 13 | 13 | 18 | 21 |
T. salsuginea | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 4 | 8 | 27 | 0 | 1 | 1 | 1 | 5 | 5 | 7 | 33 | 2 | 2 | 2 | 2 | 12 | 13 | 13 | 13 |
T. halophila | 0 | 0 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 0 | 0 | 0 | 4 | 6 | 9 | 13 | 41 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 4 | 4 | 48 | 4 | 4 | 4 | 4 | 15 | 15 | 15 | 15 |
A. alpina | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 3 | 0 | 1 | 2 | 2 | 5 | 7 | 9 | 21 | 0 | 0 | 1 | 3 | 6 | 7 | 11 | 30 | 5 | 6 | 6 | 7 | 17 | 17 | 21 | 23 |
E. syriacum | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 3 | 7 | 21 | 0 | 0 | 1 | 1 | 3 | 5 | 9 | 31 | 3 | 3 | 3 | 3 | 18 | 20 | 21 | 22 |
A. arabicum | 0 | 1 | 1 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 0 | 1 | 2 | 2 | 8 | 11 | 13 | 24 | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 7 | 25 | 3 | 3 | 3 | 3 | 12 | 12 | 12 | 13 |
V. vinifera | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 4 | 0 | 0 | 1 | 1 | 4 | 4 | 8 | 26 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 34 | 2 | 2 | 3 | 3 | 7 | 9 | 9 | 10 |