Skip to main content

Table 1 Scores for the 178 signature amino acids of avian influenza viruses

From: Scoring amino acid mutation to predict pandemic risk of avian influenza virus

Num Proa Posb Score Num Pro Pos Score Num Pro Pos Score
1 PB2 44 12.13 61 HA 124 12.51 121 NP 430 10.74
2 PB2 61 14.04 62 HA 137 10.16 122 NP 442 18.71
3 PB2 81 11.32 63 HA 141 10.61 123 NP 444 12.48
4 PB2 105 13.20 64 HA 144 10.61 124 NP 455 10.90
5 PB2 199 12.53 65 HA 155 10.56 125 NP 456 10.54
6 PB2 225 10.72 66 HA 158 10.36 126 NP 473 10.14
7 PB2 271 21.13 67 HA 160 16.89 127 NA 105 10.92
8 PB2 323 20.77 68 HA 163 11.46 128 NA 200 10.32
9 PB2 368 10.29 69 HA 164 10.57 129 NA 247 17.48
10 PB2 391 13.25 70 HA 169 10.33 130 NA 347 10.16
11 PB2 475 16.03 71 HA 171 10.35 131 NA 372 10.85
12 PB2 526 11.05 72 HA 172 10.15 132 NA 399 12.30
13 PB2 559 10.52 73 HA 189 13.15 133 M1 15 10.57
14 PB2 567 12.55 74 HA 190 19.80 134 M1 30 16.61
15 PB2 588 14.51 75 HA 193 13.31 135 M1 37 10.92
16 PB2 591 10.79 76 HA 203 12.47 136 M1 115 16.49
17 PB2 627 11.12 77 HA 224 16.94 137 M1 116 19.25
18 PB2 645 11.76 78 HA 225 14.94 138 M1 137 11.12
19 PB2 674 11.02 79 HA 226 15.14 139 M1 142 11.79
20 PB1 99 16.40 80 HA 228 15.09 140 M1 207 12.04
21 PB1 287 11.47 81 HA 246 10.95 141 M1 209 14.74
22 PB1 336 14.27 82 HA 272 12.19 142 M1 214 16.99
23 PB1 339 11.25 83 HA 276 12.12 143 M2 13 11.26
24 PB1 361 13.80 84 HA 285 10.01 144 M2 14 12.88
25 PB1 368 12.23 85 HA 299 10.21 145 M2 18 12.14
26 PB1 375 13.66 86 HA 327 12.71 146 M2 20 10.14
27 PB1 486 11.37 87 HA 367 11.62 147 M2 27 14.13
28 PB1 581 19.70 88 HA 393 13.32 148 M2 28 10.01
29 PB1 584 11.53 89 HA 406 11.53 149 M2 31 11.00
30 PB1 741 14.47 90 HA 413 10.90 150 M2 43 13.76
31 PB1_f2 11 11.53 91 HA 462 11.17 151 M2 50 10.52
32 PB1_f2 27 13.74 92 HA 490 10.82 152 M2 54 12.38
33 PB1_f2 59 10.05 93 HA 493 11.39 153 M2 57 11.57
34 PB1_f2 60 14.89 94 HA 530 10.65 154 M2 65 11.31
35 PB1_f2 73 11.33 95 HA 531 12.94 155 M2 66 13.29
36 PB1_f2 78 13.81 96 NP 16 11.77 156 M2 77 10.00
37 PB1_f2 83 14.22 97 NP 21 10.30 157 M2 78 17.00
38 PA 28 16.42 98 NP 33 15.12 158 M2 79 12.74
39 PA 55 13.03 99 NP 61 12.44 159 M2 86 15.40
40 PA 57 11.25 100 NP 99 22.49 160 M2 93 18.45
41 PA 65 10.78 101 NP 100 18.84 161 M2 95 11.66
42 PA 66 10.42 102 NP 119 10.82 162 NS1 7 10.23
43 PA 94 13.02 103 NP 136 13.19 163 NS1 22 11.57
44 PA 163 11.54 104 NP 189 11.58 164 NS1 53 10.59
45 PA 225 12.94 105 NP 190 13.23 165 NS1 60 13.19
46 PA 268 12.08 106 NP 283 17.10 166 NS1 74 10.03
47 PA 277 14.17 107 NP 289 11.37 167 NS1 81 14.88
48 PA 337 13.50 108 NP 293 12.50 168 NS1 114 13.45
49 PA 391 10.69 109 NP 305 20.80 169 NS1 125 11.55
50 PA 400 11.18 110 NP 313 16.72 170 NS1 171 10.83
51 PA 421 12.85 111 NP 345 13.40 171 NS1 189 13.00
52 PA 520 11.20 112 NP 351 10.14 172 NS1 205 11.00
53 PA 552 16.33 113 NP 353 10.09 173 NS1 215 11.37
54 PA 669 11.64 114 NP 357 21.26 174 NS1 227 12.45
55 HA 12 14.87 115 NP 372 12.50 175 NEP 32 12.43
56 HA 94 10.48 116 NP 375 12.09 176 NEP 70 18.26
57 HA 101 11.00 117 NP 400 10.68 177 NEP 89 11.59
58 HA 110 17.94 118 NP 422 14.84 178 NEP 107 14.74
59 HA 111 11.00 119 NP 425 12.20     
60 HA 117 11.34 120 NP 426 10.69     
  1. aViral protein; bPosition of amino acid residue as H3 subtype numbering