TY - JOUR AU - Frankish, A. AU - Diekhans, M. AU - Ferreira, A. M. AU - Johnson, R. AU - Jungreis, I. AU - Loveland, J. AU - Mudge, J. M. AU - Sisu, C. AU - Wright, J. AU - Armstrong, J. PY - 2019 DA - 2019// TI - GENCODE reference annotation for the human and mouse genomes JO - Nucleic Acids Res VL - 47 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gky955 DO - 10.1093/nar/gky955 ID - Frankish2019 ER - TY - JOUR AU - Hon, C. C. AU - Ramilowski, J. A. AU - Harshbarger, J. AU - Bertin, N. AU - Rackham, O. J. AU - Gough, J. AU - Denisenko, E. AU - Schmeier, S. AU - Poulsen, T. M. AU - Severin, J. PY - 2017 DA - 2017// TI - An atlas of human long non-coding RNAs with accurate 5' ends JO - Nature VL - 543 UR - https://doi.org/10.1038/nature21374 DO - 10.1038/nature21374 ID - Hon2017 ER - TY - JOUR AU - Ezkurdia, I. AU - Juan, D. AU - Rodriguez, J. M. AU - Frankish, A. AU - Diekhans, M. AU - Harrow, J. AU - Vazquez, J. AU - Valencia, A. AU - Tress, M. L. PY - 2014 DA - 2014// TI - Multiple evidence strands suggest that there may be as few as 19,000 human protein-coding genes JO - Hum Mol Genet VL - 23 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddu309 DO - 10.1093/hmg/ddu309 ID - Ezkurdia2014 ER - TY - JOUR AU - Couso, J. P. AU - Patraquim, P. PY - 2017 DA - 2017// TI - Classification and function of small open reading frames JO - Nat Rev Mol Cell Biol VL - 18 UR - https://doi.org/10.1038/nrm.2017.58 DO - 10.1038/nrm.2017.58 ID - Couso2017 ER - TY - JOUR AU - Saghatelian, A. AU - Couso, J. P. PY - 2015 DA - 2015// TI - Discovery and characterization of smORF-encoded bioactive polypeptides JO - Nat Chem Biol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1038/nchembio.1964 DO - 10.1038/nchembio.1964 ID - Saghatelian2015 ER - TY - JOUR AU - Aspden, J. L. AU - Eyre-Walker, Y. C. AU - Phillips, R. J. AU - Amin, U. AU - Mumtaz, M. A. AU - Brocard, M. AU - Couso, J. P. PY - 2014 DA - 2014// TI - Extensive translation of small Open Reading Frames revealed by Poly-Ribo-Seq JO - Elife VL - 3 UR - https://doi.org/10.7554/eLife.03528 DO - 10.7554/eLife.03528 ID - Aspden2014 ER - TY - JOUR AU - Olexiouk, V. AU - Criekinge, W. AU - Menschaert, G. PY - 2018 DA - 2018// TI - An update on sORFs.org: a repository of small ORFs identified by ribosome profiling JO - Nucleic Acids Res VL - 46 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkx1130 DO - 10.1093/nar/gkx1130 ID - Olexiouk2018 ER - TY - JOUR AU - Hao, Y. AU - Zhang, L. AU - Niu, Y. AU - Cai, T. AU - Luo, J. AU - He, S. AU - Zhang, B. AU - Zhang, D. AU - Qin, Y. AU - Yang, F. PY - 2018 DA - 2018// TI - SmProt: a database of small proteins encoded by annotated coding and non-coding RNA loci JO - Brief Bioinform VL - 19 ID - Hao2018 ER - TY - JOUR AU - Martinez, T. F. AU - Chu, Q. AU - Donaldson, C. AU - Tan, D. AU - Shokhirev, M. N. AU - Saghatelian, A. PY - 2020 DA - 2020// TI - Accurate annotation of human protein-coding small open reading frames JO - Nat Chem Biol VL - 16 UR - https://doi.org/10.1038/s41589-019-0425-0 DO - 10.1038/s41589-019-0425-0 ID - Martinez2020 ER - TY - JOUR AU - Slavoff, S. A. AU - Mitchell, A. J. AU - Schwaid, A. G. AU - Cabili, M. N. AU - Ma, J. AU - Levin, J. Z. AU - Karger, A. D. AU - Budnik, B. A. AU - Rinn, J. L. AU - Saghatelian, A. PY - 2013 DA - 2013// TI - Peptidomic discovery of short open reading frame-encoded peptides in human cells JO - Nat Chem Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1038/nchembio.1120 DO - 10.1038/nchembio.1120 ID - Slavoff2013 ER - TY - JOUR AU - Nelson, B. R. AU - Makarewich, C. A. AU - Anderson, D. M. AU - Winders, B. R. AU - Troupes, C. D. AU - Wu, F. AU - Reese, A. L. AU - McAnally, J. R. AU - Chen, X. AU - Kavalali, E. T. PY - 2016 DA - 2016// TI - A peptide encoded by a transcript annotated as long noncoding RNA enhances SERCA activity in muscle JO - Science VL - 351 UR - https://doi.org/10.1126/science.aad4076 DO - 10.1126/science.aad4076 ID - Nelson2016 ER - TY - JOUR AU - Zhang, Q. AU - Vashisht, A. A. AU - O'Rourke, J. AU - Corbel, S. Y. AU - Moran, R. AU - Romero, A. AU - Miraglia, L. AU - Zhang, J. AU - Durrant, E. AU - Schmedt, C. PY - 2017 DA - 2017// TI - The microprotein Minion controls cell fusion and muscle formation JO - Nat Commun VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/ncomms15664 DO - 10.1038/ncomms15664 ID - Zhang2017 ER - TY - JOUR AU - Polycarpou-Schwarz, M. AU - Gross, M. AU - Mestdagh, P. AU - Schott, J. AU - Grund, S. E. AU - Hildenbrand, C. AU - Rom, J. AU - Aulmann, S. AU - Sinn, H. P. AU - Vandesompele, J. PY - 2018 DA - 2018// TI - The cancer-associated microprotein CASIMO1 controls cell proliferation and interacts with squalene epoxidase modulating lipid droplet formation JO - Oncogene VL - 37 UR - https://doi.org/10.1038/s41388-018-0281-5 DO - 10.1038/s41388-018-0281-5 ID - Polycarpou-Schwarz2018 ER - TY - JOUR AU - Xu, W. AU - Deng, B. AU - Lin, P. AU - Liu, C. AU - Li, B. AU - Huang, Q. AU - Zhou, H. AU - Yang, J. AU - Qu, L. PY - 2020 DA - 2020// TI - Ribosome profiling analysis identified a KRAS-interacting microprotein that represses oncogenic signaling in hepatocellular carcinoma cells JO - Sci China Life Sci VL - 63 UR - https://doi.org/10.1007/s11427-019-9580-5 DO - 10.1007/s11427-019-9580-5 ID - Xu2020 ER - TY - JOUR AU - Makarewich, C. A. AU - Baskin, K. K. AU - Munir, A. Z. AU - Bezprozvannaya, S. AU - Sharma, G. AU - Khemtong, C. AU - Shah, A. M. AU - McAnally, J. R. AU - Malloy, C. R. AU - Szweda, L. I. PY - 2018 DA - 2018// TI - MOXI is a mitochondrial micropeptide that enhances fatty acid beta-oxidation JO - Cell Rep VL - 23 UR - https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.05.058 DO - 10.1016/j.celrep.2018.05.058 ID - Makarewich2018 ER - TY - JOUR AU - Stein, C. S. AU - Jadiya, P. AU - Zhang, X. AU - McLendon, J. M. AU - Abouassaly, G. M. AU - Witmer, N. H. AU - Anderson, E. J. AU - Elrod, J. W. AU - Boudreau, R. L. PY - 2018 DA - 2018// TI - Mitoregulin: a lncRNA-encoded microprotein that supports mitochondrial supercomplexes and respiratory efficiency JO - Cell Rep VL - 23 UR - https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.06.002 DO - 10.1016/j.celrep.2018.06.002 ID - Stein2018 ER - TY - JOUR AU - Bhatta, A. AU - Atianand, M. AU - Jiang, Z. AU - Crabtree, J. AU - Blin, J. AU - Fitzgerald, K. A. PY - 2020 DA - 2020// TI - A Mitochondrial micropeptide is required for activation of the Nlrp3 inflammasome JO - J Immunol VL - 204 UR - https://doi.org/10.4049/jimmunol.1900791 DO - 10.4049/jimmunol.1900791 ID - Bhatta2020 ER - TY - JOUR AU - Kustatscher, G. AU - Grabowski, P. AU - Schrader, T. A. AU - Passmore, J. B. AU - Schrader, M. AU - Rappsilber, J. PY - 2019 DA - 2019// TI - Co-regulation map of the human proteome enables identification of protein functions JO - Nat Biotechnol VL - 37 UR - https://doi.org/10.1038/s41587-019-0298-5 DO - 10.1038/s41587-019-0298-5 ID - Kustatscher2019 ER - TY - JOUR AU - Li, H. AU - Xiao, L. AU - Zhang, L. AU - Wu, J. AU - Wei, B. AU - Sun, N. AU - Zhao, Y. PY - 2018 DA - 2018// TI - FSPP: a tool for genome-wide prediction of smORF-encoded peptides and their functions JO - Front Genet VL - 9 UR - https://doi.org/10.3389/fgene.2018.00096 DO - 10.3389/fgene.2018.00096 ID - Li2018 ER - TY - JOUR AU - Zhao, S. AU - Fung-Leung, W. P. AU - Bittner, A. AU - Ngo, K. AU - Liu, X. PY - 2014 DA - 2014// TI - Comparison of RNA-Seq and microarray in transcriptome profiling of activated T cells JO - PLoS ONE VL - 9 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0078644 DO - 10.1371/journal.pone.0078644 ID - Zhao2014 ER - TY - JOUR AU - Bottomly, D. AU - Walter, N. A. AU - Hunter, J. E. AU - Darakjian, P. AU - Kawane, S. AU - Buck, K. J. AU - Searles, R. P. AU - Mooney, M. AU - McWeeney, S. K. AU - Hitzemann, R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Evaluating gene expression in C57BL/6J and DBA/2J mouse striatum using RNA-Seq and microarrays JO - PLoS ONE VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0017820 DO - 10.1371/journal.pone.0017820 ID - Bottomly2011 ER - TY - JOUR AU - Lempiainen, H. AU - Muller, A. AU - Brasa, S. AU - Teo, S. S. AU - Roloff, T. C. AU - Morawiec, L. AU - Zamurovic, N. AU - Vicart, A. AU - Funhoff, E. AU - Couttet, P. PY - 2011 DA - 2011// TI - Phenobarbital mediates an epigenetic switch at the constitutive androstane receptor (CAR) target gene Cyp2b10 in the liver of B6C3F1 mice JO - PLoS ONE VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0018216 DO - 10.1371/journal.pone.0018216 ID - Lempiainen2011 ER - TY - JOUR AU - Kohlmann, A. AU - Kipps, T. J. AU - Rassenti, L. Z. AU - Downing, J. R. AU - Shurtleff, S. A. AU - Mills, K. I. AU - Gilkes, A. F. AU - Hofmann, W. K. AU - Basso, G. AU - Dell'orto, M. C. PY - 2008 DA - 2008// TI - An international standardization programme towards the application of gene expression profiling in routine leukaemia diagnostics: the Microarray Innovations in LEukemia study prephase JO - Br J Haematol VL - 142 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2141.2008.07261.x DO - 10.1111/j.1365-2141.2008.07261.x ID - Kohlmann2008 ER - TY - JOUR AU - Chu, Q. AU - Martinez, T. F. AU - Novak, S. W. AU - Donaldson, C. J. AU - Tan, D. AU - Vaughan, J. M. AU - Chang, T. AU - Diedrich, J. K. AU - Andrade, L. AU - Kim, A. PY - 2019 DA - 2019// TI - Regulation of the ER stress response by a mitochondrial microprotein JO - Nat Commun VL - 10 UR - https://doi.org/10.1038/s41467-019-12816-z DO - 10.1038/s41467-019-12816-z ID - Chu2019 ER - TY - JOUR AU - Rathore, A. AU - Chu, Q. AU - Tan, D. AU - Martinez, T. F. AU - Donaldson, C. J. AU - Diedrich, J. K. AU - Yates, J. R. AU - Saghatelian, A. PY - 2018 DA - 2018// TI - MIEF1 microprotein regulates mitochondrial translation JO - Biochemistry VL - 57 UR - https://doi.org/10.1021/acs.biochem.8b00726 DO - 10.1021/acs.biochem.8b00726 ID - Rathore2018 ER - TY - JOUR AU - D'Lima, N. G. AU - Ma, J. AU - Winkler, L. AU - Chu, Q. AU - Loh, K. H. AU - Corpuz, E. O. AU - Budnik, B. A. AU - Lykke-Andersen, J. AU - Saghatelian, A. AU - Slavoff, S. A. PY - 2017 DA - 2017// TI - A human microprotein that interacts with the mRNA decapping complex JO - Nat Chem Biol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1038/nchembio.2249 DO - 10.1038/nchembio.2249 ID - D'Lima2017 ER - TY - JOUR AU - Zhang, Z. AU - Schwartz, S. AU - Wagner, L. AU - Miller, W. PY - 2000 DA - 2000// TI - A greedy algorithm for aligning DNA sequences JO - J Comput Biol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1089/10665270050081478 DO - 10.1089/10665270050081478 ID - Zhang2000 ER - TY - JOUR AU - UniProt, C. PY - 2019 DA - 2019// TI - UniProt: a worldwide hub of protein knowledge JO - Nucleic Acids Res VL - 47 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gky1049 DO - 10.1093/nar/gky1049 ID - UniProt2019 ER - TY - JOUR AU - Szklarczyk, D. AU - Gable, A. L. AU - Lyon, D. AU - Junge, A. AU - Wyder, S. AU - Huerta-Cepas, J. AU - Simonovic, M. AU - Doncheva, N. T. AU - Morris, J. H. AU - Bork, P. PY - 2019 DA - 2019// TI - STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets JO - Nucleic Acids Res VL - 47 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gky1131 DO - 10.1093/nar/gky1131 ID - Szklarczyk2019 ER - TY - JOUR AU - Chen, X. AU - Sun, Y. Z. AU - Guan, N. N. AU - Qu, J. AU - Huang, Z. A. AU - Zhu, Z. X. AU - Li, J. Q. PY - 2019 DA - 2019// TI - Computational models for lncRNA function prediction and functional similarity calculation JO - Brief Funct Genom VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/bfgp/ely031 DO - 10.1093/bfgp/ely031 ID - Chen2019 ER - TY - JOUR AU - Hishigaki, H. AU - Nakai, K. AU - Ono, T. AU - Tanigami, A. AU - Takagi, T. PY - 2001 DA - 2001// TI - Assessment of prediction accuracy of protein function from protein–protein interaction data JO - Yeast VL - 18 UR - https://doi.org/10.1002/yea.706 DO - 10.1002/yea.706 ID - Hishigaki2001 ER - TY - JOUR AU - Saha, S. AU - Prasad, A. AU - Chatterjee, P. AU - Basu, S. AU - Nasipuri, M. PY - 2018 DA - 2018// TI - Protein function prediction from protein-protein interaction network using gene ontology based neighborhood analysis and physico-chemical features JO - J Bioinform Comput Biol VL - 16 UR - https://doi.org/10.1142/S0219720018500257 DO - 10.1142/S0219720018500257 ID - Saha2018 ER - TY - JOUR AU - Qiu, C. AU - Wang, D. AU - Wang, E. AU - Cui, Q. PY - 2012 DA - 2012// TI - An upstream interacting context based framework for the computational inference of microRNA functions JO - Mol Biosyst VL - 8 UR - https://doi.org/10.1039/c2mb05469h DO - 10.1039/c2mb05469h ID - Qiu2012 ER - TY - JOUR AU - Vlachos, I. S. AU - Zagganas, K. AU - Paraskevopoulou, M. D. AU - Georgakilas, G. AU - Karagkouni, D. AU - Vergoulis, T. AU - Dalamagas, T. AU - Hatzigeorgiou, A. G. PY - 2015 DA - 2015// TI - DIANA-miRPath v3.0: deciphering microRNA function with experimental support JO - Nucleic Acids Res VL - 43 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkv403 DO - 10.1093/nar/gkv403 ID - Vlachos2015 ER - TY - JOUR AU - Liao, Q. AU - Xiao, H. AU - Bu, D. AU - Xie, C. AU - Miao, R. AU - Luo, H. AU - Zhao, G. AU - Yu, K. AU - Zhao, H. AU - Skogerbo, G. PY - 2011 DA - 2011// TI - ncFANs: a web server for functional annotation of long non-coding RNAs JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr432 DO - 10.1093/nar/gkr432 ID - Liao2011 ER - TY - JOUR AU - Edfors, F. AU - Danielsson, F. AU - Hallstrom, B. M. AU - Kall, L. AU - Lundberg, E. AU - Ponten, F. AU - Forsstrom, B. AU - Uhlen, M. PY - 2016 DA - 2016// TI - Gene-specific correlation of RNA and protein levels in human cells and tissues JO - Mol Syst Biol VL - 12 UR - https://doi.org/10.15252/msb.20167144 DO - 10.15252/msb.20167144 ID - Edfors2016 ER - TY - JOUR AU - Nusinow, D. P. AU - Szpyt, J. AU - Ghandi, M. AU - Rose, C. M. AU - McDonald, E. R. AU - Kalocsay, M. AU - Jane-Valbuena, J. AU - Gelfand, E. AU - Schweppe, D. K. AU - Jedrychowski, M. PY - 2020 DA - 2020// TI - Quantitative proteomics of the cancer cell line encyclopedia JO - Cell VL - 180 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.12.023 DO - 10.1016/j.cell.2019.12.023 ID - Nusinow2020 ER - TY - JOUR AU - Sangar, V. AU - Blankenberg, D. J. AU - Altman, N. AU - Lesk, A. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Quantitative sequence-function relationships in proteins based on gene ontology JO - BMC Bioinform VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-8-294 DO - 10.1186/1471-2105-8-294 ID - Sangar2007 ER - TY - JOUR AU - Li, J. AU - Gao, C. AU - Wang, Y. AU - Ma, W. AU - Tu, J. AU - Wang, J. AU - Chen, Z. AU - Kong, W. AU - Cui, Q. PY - 2014 DA - 2014// TI - A bioinformatics method for predicting long noncoding RNAs associated with vascular disease JO - Sci China Life Sci VL - 57 UR - https://doi.org/10.1007/s11427-014-4692-4 DO - 10.1007/s11427-014-4692-4 ID - Li2014 ER - TY - JOUR AU - Zhao, H. AU - Sun, Z. AU - Wang, J. AU - Huang, H. AU - Kocher, J. P. AU - Wang, L. PY - 2014 DA - 2014// TI - CrossMap: a versatile tool for coordinate conversion between genome assemblies JO - Bioinformatics VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btt730 DO - 10.1093/bioinformatics/btt730 ID - Zhao2014 ER - TY - JOUR AU - Carvalho, B. S. AU - Irizarry, R. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - A framework for oligonucleotide microarray preprocessing JO - Bioinformatics VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq431 DO - 10.1093/bioinformatics/btq431 ID - Carvalho2010 ER - TY - JOUR AU - Chen, S. AU - Zhou, Y. AU - Chen, Y. AU - Gu, J. PY - 2018 DA - 2018// TI - fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor JO - Bioinformatics VL - 34 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty560 DO - 10.1093/bioinformatics/bty560 ID - Chen2018 ER - TY - JOUR AU - Kim, D. AU - Paggi, J. M. AU - Park, C. AU - Bennett, C. AU - Salzberg, S. L. PY - 2019 DA - 2019// TI - Graph-based genome alignment and genotyping with HISAT2 and HISAT-genotype JO - Nat Biotechnol VL - 37 UR - https://doi.org/10.1038/s41587-019-0201-4 DO - 10.1038/s41587-019-0201-4 ID - Kim2019 ER - TY - JOUR AU - Li, H. AU - Handsaker, B. AU - Wysoker, A. AU - Fennell, T. AU - Ruan, J. AU - Homer, N. AU - Marth, G. AU - Abecasis, G. AU - Durbin, R. PY - 2009 DA - 2009// TI - Genome project data processing S: the sequence alignment/map format and SAMtools JO - Bioinformatics VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp352 DO - 10.1093/bioinformatics/btp352 ID - Li2009 ER - TY - JOUR AU - Liao, Y. AU - Smyth, G. K. AU - Shi, W. PY - 2014 DA - 2014// TI - featureCounts: an efficient general purpose program for assigning sequence reads to genomic features JO - Bioinformatics VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btt656 DO - 10.1093/bioinformatics/btt656 ID - Liao2014 ER - TY - JOUR AU - Jiang, H. AU - Wong, W. H. PY - 2008 DA - 2008// TI - SeqMap: mapping massive amount of oligonucleotides to the genome JO - Bioinformatics VL - 24 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btn429 DO - 10.1093/bioinformatics/btn429 ID - Jiang2008 ER - TY - JOUR AU - Quinlan, A. R. AU - Hall, I. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - BEDTools: a flexible suite of utilities for comparing genomic features JO - Bioinformatics VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq033 DO - 10.1093/bioinformatics/btq033 ID - Quinlan2010 ER - TY - JOUR AU - Ashburner, M. AU - Ball, C. A. AU - Blake, J. A. AU - Botstein, D. AU - Butler, H. AU - Cherry, J. M. AU - Davis, A. P. AU - Dolinski, K. AU - Dwight, S. S. AU - Eppig, J. T. PY - 2000 DA - 2000// TI - Gene ontology: tool for the unification of biology JO - Nat Genet VL - 25 UR - https://doi.org/10.1038/75556 DO - 10.1038/75556 ID - Ashburner2000 ER - TY - JOUR PY - 2019 DA - 2019// TI - The gene ontology resource: 20 years and still going strong JO - Nucleic Acids Res VL - 47 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gky1055 DO - 10.1093/nar/gky1055 ID - ref49 ER - TY - JOUR AU - Kanehisa, M. AU - Goto, S. PY - 2000 DA - 2000// TI - KEGG: Kyoto encyclopedia of genes and genomes JO - Nucleic Acids Res VL - 28 UR - https://doi.org/10.1093/nar/28.1.27 DO - 10.1093/nar/28.1.27 ID - Kanehisa2000 ER - TY - JOUR AU - Fabregat, A. AU - Jupe, S. AU - Matthews, L. AU - Sidiropoulos, K. AU - Gillespie, M. AU - Garapati, P. AU - Haw, R. AU - Jassal, B. AU - Korninger, F. AU - May, B. PY - 2018 DA - 2018// TI - The reactome pathway knowledgebase JO - Nucleic Acids Res VL - 46 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkx1132 DO - 10.1093/nar/gkx1132 ID - Fabregat2018 ER - TY - JOUR AU - Subramanian, A. AU - Tamayo, P. AU - Mootha, V. K. AU - Mukherjee, S. AU - Ebert, B. L. AU - Gillette, M. A. AU - Paulovich, A. AU - Pomeroy, S. L. AU - Golub, T. R. AU - Lander, E. S. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 102 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0506580102 DO - 10.1073/pnas.0506580102 ID - Subramanian2005 ER -