Table 12 CRF tuning parameters and resulting tuning F1 scores
Ontology | L1 | L2 | Time (h) | F1 score (macro) | F1 score (micro) |
|---|---|---|---|---|---|
ChEBI | 0.0862 | 0.000186 | 3 | 0.61 | 0.99 |
CL | 0.00477 | 0.0473 | 3 | 0.73 | >Â 0.99 |
GO_BP | 0.0862 | 0.000186 | 3.17 | 0.63 | 0.99 |
GO_CC | 0.269 | 0.00892 | 3 | 0.55 | 0.99 |
GO_MF | 0.215 | 0.00392 | 3 | 0.66 | 0.99 |
MOP | 0.0862 | 0.000186 | 3 | 0.65 | >Â 0.99 |
NCBITaxon | 0.0862 | 0.000186 | 3 | 0.61 | >Â 0.99 |
PR | 0.00477 | 0.0473 | 3.25 | 0.54 | 0.97 |
SO | 0.315 | 0.00578 | 3.22 | 0.66 | >Â 0.99 |
UBERON | 0.221 | 0.003005 | 3.3 | 0.63 | 0.99 |