Table 14 BiLSTM-ELMo parameters and resulting tuning F1 scores
Ontology | Batch size | # Epochs | # Neurons | F1 score (macro) | F1 score (micro) |
|---|---|---|---|---|---|
ChEBI | 18 | 10 | 3 | 0.65 | >Â 0.99 |
CL | 18 | 10 | 12 | 0.72 | >Â 0.99 |
GO_BP | 18 | 10 | 12 | 0.66 | >Â 0.99 |
GO_CC | 18 | 10 | 3 | 0.65 | >Â 0.99 |
GO_MF | 18 | 100 | 3 | 0.66 | >Â 0.99 |
MOP | 18 | 100 | 12 | 0.61 | >Â 0.99 |
NCBITaxon | 18 | 100 | 12 | 0.96 | >Â 0.99 |
PR | 18 | 10 | 12 | 0.71 | >Â 0.99 |
SO | 18 | 100 | 12 | 0.65 | >Â 0.99 |
UBERON | 18 | 10 | 12 | 0.68 | >Â 0.99 |