Table 8 TAD boundaries’ True Positive Rate and False Positive Rate called from the in silico dataset

Armatus

0.708

0.917

0.462

0.192

0.438

0.041

Arrowhead

0.218

0.35

0.141

0.586

0.703

0.444

CaTCH

0.194

0.471

0.044

0.052

0.375

0

CHAC

0.355

0.5

0.233

0.047

0.179

0

CHDF

0.965

1

0.81

0.381

0.517

0.237

ClusterTAD

0.354

0.453

0.244

0.153

0.375

0

deDoc

0.497

0.632

0.372

0.28

0.46

0.068

DI

0.113

0.198

0.041

0.864

0.95

0.754

EAST

0.26

0.343

0.014

0.539

0.636

0.417

GMAP

0.255

0.412

0.136

0.425

0.6

0.182

GRiNCH

0.341

0.504

0.217

0.327

0.562

0.113

HiCExplorer

0.877

0.949

0.709

0.002

0.036

0

HiCKey

0.316

0.429

0.215

0.018

0.089

0.012

HiCseg

0.275

0.406

0.181

0.006

0.071

0

IC-Finder

0.946

1

0.848

0.077

0.158

0.025

InsulationScore

0.09

0.203

0.024

0.636

0.875

0.333

Matryoshka

0.706

0.875

0.5

0.332

0.606

0.127

MrTADFinder

0.752

0.895

0.557

0.337

0.594

0.107

MSTD

0.264

0.383

0.174

0.053

0.211

0

OnTAD

0.429

0.487

0.367

0.014

0.094

0

Spectral

0.182

0.425

0.058

0.785

0.887

0.571

SpectralTAD

0.869

0.956

0.684

0.213

0.367

0.089

TADBD

0.482

0.5

0.38

0

0

0

TADbit

0.452

0.571

0.304

0.478

0.653

0.313

TADpole

0.431

0.522

0.345

0.216

0.521

0.128

TADtree

0.961

1

0.785

0.001

0.016

0

TopDom

0.708

0.917

0.462

0.192

0.438

0.041