Table 1 Optimal and suboptimal structures of the artificial RNA sequence after filtering
From: IndelsRNAmute: predicting deleterious multiple point substitutions and indels mutations
Structure | Dot-bracket representation | Distance |
|---|---|---|
opt | (((((((.((((((...((((((....))))))....))))))...(((((.(((((....))))).)))))..((((...)))).))))))) | 0 |
sub1 | .........(((.....)))..((((...(((((.((..(((....(((((.(((((....))))).)))))..)))..))))))).)))).. | 43 |
sub2 | (((((((.((((((((((((((((.....(((((((..........))).))))))))...)))).)))))...........))).))))))) | 39 |
sub3 | (((((((.(((.((......(((...((..(((.......)))..))...)))((((.(((((.....))))).)))).)).))).))))))) | 39 |
sub4 | (((((..((.(((.(((((((((....))))))......((......))....((((.(((((.....))))).)))).)))))).))))))) | 36 |
sub5 | .((((((.(((.((...((((((....))))))...((.(((((...((.....))...))))).))((((...)))).)).))).)))))). | 35 |
sub6 | ........((((((...((((((....))))))....))))))..((((....((((.(((((.....))))).)))).....))))...... | 34 |