Efficient alignment-free DNA barcode analytics

BMC Bioinformatics

Table 7 Top-100 spectrum features for Hesperiidae data set

rank	feature	rank	feature	rank	feature	rank	feature
1	TTATTATTAT	26	ATTAATATAC	51	TTTTTATAGT	76	GGAGCCCCTG
2	ATTATTATTA	27	CTTTCCCCCG	52	TTTTTTATAG	77	TATTAATTTC
3	TATTACCCCC	28	GCTTTCCCCC	53	ATTAATTTCA	78	AATATTGCTC
4	CCCCCTCTTT	29	TTAATATACG	54	TAATATACGA	79	TTTTTGATCC
5	AATTTTATTA	30	TATTATAATT	55	GTTTATCCCC	80	TTTTTTGATC
6	AGGAGCTATT	31	AGCTTTCCCC	56	TTTTTTTATA	81	ATATTGCTCA
7	ATTGCCCATC	32	GCTCCTGATA	57	CCTTCTTTAA	82	GAGCCCCTGA
8	TTGCCCATCA	33	TAATTTTATT	58	TGGAGATGAT	83	ATTGCTCATC
9	TTAGGAGCTC	34	CTCCTGATAT	59	TTATTACCCC	84	TGCTCATCAA
10	TCAAATACCT	35	TCCTGATATA	60	TTTATCCCCC	85	TTGCTCATCA
11	ACCTTTATTT	36	CTAATATTGC	61	CCCCTCTTTC	86	ATTATTAATT
12	TAGGAGCTCC	37	TAGGAGCCCC	62	ATTTAGCAAT	87	CTCATCAAGG
13	ATTTTATTAC	38	TGATCAAATA	63	GATTTAGCAA	88	GCTCATCAAG
14	GGAGCTATTA	39	TTAATTTTAT	64	TATTATTATT	89	TACCCCCCTC
15	ATTAGGAGCT	40	TTTGATCAAA	65	AGGAGCTCCT	90	TAGCTTTCCC
16	TATTGCCCAT	41	TTGATCAAAT	66	AATATTGCCC	91	ATATTAGGAG
17	CAAATACCTT	42	CTTTATTTGT	67	ATATTGCCCA	92	TATTAGGAGC
18	TGCCCATCAA	43	CCTTTATTTG	68	ATTATTAATA	93	TACTATTGTT
19	AATACCTTTA	44	TATTAATATA	69	ATTATTACCC	94	ATAGCTTTCC
20	AAATACCTTT	45	ATTAATTTTA	70	TTATTAATAT	95	CAATTATTAA
21	CCCCTGATAT	46	TACCTTTATT	71	AGATGATCAA	96	ACAATTATTA
22	GCCCCTGATA	47	AATTTTTTCT	72	GAGATGATCA	97	TTTAGCAATT
23	CCCATCAAGG	48	TATAGCTTTC	73	GGAGATGATC	98	CCCCCGAATA
24	CCCTGATATA	49	AGCCCCTGAT	74	TTTTATAGTT	99	TCCCCCGAAT
25	GCCCATCAAG	50	ATACCTTTAT	75	TTACCCCCCT	100	TTCCCCCGAA

ISSN: 1471-2105