Chrom Position | Types of Mutations | Genotype at SRX007711 | Genotype at FPR3757 | Alignment with Orthologous Proteins | Gene and Function | ||
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 |  |  |  | gi 87161249 ref | 423 | EKDATIEKSNTG |  |
 |  |  |  |  |  | E DATIEKSNTG |  |
 |  |  |  |  |  | ENDATIEKSNTG |  |
 |  |  |  | SRR022865_26088 | 1 | gaggaagataag |  |
778416 | NONSYN | T:6 G:140 | G:37 | Â | Â | aaacctaacacg | Â |
 |  |  |  |  |  | attattgaacat | sulfatase family protein lipoate-protein ligase A family protein |
1021087 | Â | Â | Â | Query: 36 VKLAMEEYVLKN | 1 | Â | Â |
 | NONSYN | T:5 G:151 | G:37 | + LAMEEYVLKN |  |  |  |
 |  |  |  | Sbjct: 14 LNLAMEEYVLKN | 25 |  |  |
 |  |  |  | gi 87162345 ref | 143 | AGIGRYLLNRVD |  |
 |  |  |  |  |  | AGIGRYLLNR+D |  |
 |  |  |  |  |  | AGIGRYLLNRLD |  |
 |  |  |  | SRR022865_32431 | -37 | Ggagattcaatg | lantibiotic epidermin biosynthesis protein EpiC |
 |  |  |  |  |  | Cgtggattagta |  |
1950547 | NONSYN | A:5 C:164 | C:37 | Â | Â | Tgagatgataat | Â |
 |  |  |  | gi 87160275 ref | 122 | NCLPVYKILLEK |  |
 |  |  |  |  |  | NCLPVYKILL+K |  |
 |  |  |  |  |  | NCLPVYKILLKK |  |
 |  |  |  | SRR022865_59666 | -36 | attcgtaattaa | Lactose phosphotransferase system repressor phosphotransferase system, glucose-specific IIABC component |
 |  |  |  |  |  | agtctaatttaa |  |
2333470 | NONSYN | T:5 C:164 | C:37 | Â | Â | ttgggtatgaaa | Â |
 |  |  |  | Query: 36 LV*IAPWLKNDI | 1 |  |  |
 |  |  |  | LV IAPWLKNDI |  |  |  |
2674216 | TRUNC | A:5 C:170 | C:37 | Sbjct: 41 LVEIAPWLKNDI | 52 | Â | Â |
 |  |  |  | gi 87161394 ref | 71 | KKVLLTGLGIVI |  |
 |  |  |  |  |  | KK+LLTGLGIVI |  |
 |  |  |  |  |  | KKLLLTGLGIVI |  |
 |  |  |  | SRR022865_30969 | 1 | aatctagtgaga |  |
2648343 | NONSYN | A:5 C:192 | C:37 | Â | Â | aatttcgtgttt | drug transporter |
 |  |  |  |  |  | aaatagagaaac |  |
 |  |  |  | gi 87160343 ref | 120 | EVQSKEMLIISI |  |
 |  |  |  |  |  | EVQSKEMLI+SI |  |
 |  |  |  |  |  | EVQSKEMLIVSI |  |
 |  |  |  | SRR022865_47009 | 2 | ggctagatagaa |  |
2262790 | NONSYN | A:153 G:6 | A:37 | Â | Â | atacaattttgt | cation efflux family protein |
 |  |  |  |  |  | ataaaagacttt |  |
 |  |  |  | gi 87160156 ref | 825 | SDSDSDSDSDSD |  |
 |  |  |  |  |  | SDSDSDSDSDSD |  |
 |  |  |  |  |  | SDSDSDSDSDSD |  |
 |  |  |  | SRR022865_28556 | -37 | agtgtgagtgtg |  |
861340 | SYN | A:9 C:136 | C:49 | Â | Â | gacacagacaca | clumping factor A |
 |  |  |  |  |  | ctatatctatac |  |
 |  |  |  | gi 87160605 ref | 4 | FTQLSDRIKKAI |  |
 |  |  |  |  |  | FTQLSDRIKK I |  |
 |  |  |  |  |  | FTQLSDRIKKDI |  |
 |  |  |  | SRR022865_49291 | -36 | tactagaaaaga |  |
1542366 | NONSYN | A:14 G:85 | G:37 | Â | Â | tcatgagtaaat | hypothetical protein |
 |  |  |  |  |  | ttagttacaacc |  |
 |  |  |  | gi 87160966 ref | 476 | RNDMVEFFGEKL | 5- |
 |  |  |  |  |  | RN+MVEFFGEKL |  |
 |  |  |  |  |  | RNEMVEFFGEKL | Methyltetrahydropteroyltriglut amate--homocysteine S- Methyltransferase |
 |  |  |  | SRR022865_53088 | 1 | cagaggttggat |  |
 |  |  |  |  |  | gaattattgaat |  |
408863 | NONSYN | T:6 G:160 | G:37 | Â | Â | ttagtaccaaaa | Â |
 |  |  |  | gi 87161941 ref | 177 | VDVLDVYSDAY |  |
 |  |  |  |  |  | VD+LDVYSDAY |  |
 |  |  |  |  |  | VDLLDVYSDAY |  |
 |  |  |  | SRR022865_54601 | 3 | ggttggttggt |  |
1180638 | NONSYN | T:5 G:97 | G:37 | Â | Â | tattatacaca | cell division protein ftsA |
 |  |  |  |  |  | ttaattcttat |  |
 |  |  |  | gi 87160920 ref | 104 | KGDIIGYVEAMK |  |
 |  |  |  |  |  | KGDIIGYVEA+K |  |
 |  |  |  |  |  | KGDIIGYVEAIK |  |
 |  |  |  | SRR022865_82913 | -37 | aggaagtgggaa | acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein |
 |  |  |  |  |  | agattgatacta |  |
1714319 | NONSYN | T:6 C:95 | C:37 | Â | Â | gattaattagaa | Â |
 |  |  |  | gi 87162179 ref | 415 | AKSEVWRQMMSD |  |
 |  |  |  |  |  | AKSEVWRQM+SD |  |
 |  |  |  |  |  | AKSEVWRQMISD |  |
 |  |  |  | SRR022865_51952 | -36 | gaaggtccaatg |  |
 |  |  |  |  |  | cagatggattca |  |
2638027 | NONSYN | A:5 C:112 | C:36 | Â | Â | gataagtagtat | gluconate kinase |
 |  |  |  | gi 87161981 ref | 47 | DIAVVDIMMDGM |  |
 |  |  |  |  |  | DIAVVDIMMD M |  |
 |  |  |  |  |  | DIAVVDIMMDVM |  |
 |  |  |  | SRR022865_55616 | -36 | gaggggaaagga |  |
 |  |  |  |  |  | atcttatttatt |  |
2481059 | NONSYN | T:5 G:148 | G:37 | Â | Â | ttagattggttg | response regulator protein |
 |  |  |  | gi 87161886 ref | 196 | KSENIEKTVNRF |  |
 |  |  |  |  |  | K ENIEKTVNRF |  |
 |  |  |  |  |  | KIENIEKTVNRF |  |
 |  |  |  | SRR022865_56405 | 1 | aagaagaagact |  |
 |  |  |  |  |  | ataataactagt | thiamine-phosphate pyrophosphorylase |
2212436 | NONSYN | A:5 C:107 | C:37 | Â | Â | atattagtttac | Â |
 |  |  |  | gi 87161325 ref | 64 | PVVKELKKHAK |  |
 |  |  |  |  |  | P VKELKKHAK |  |
 |  |  |  |  |  | PFVKELKKHAK |  |
 |  |  |  | SRR022865_71442 | 3 | ctgagtaacga |  |
 |  |  |  |  |  | cttaataaaca |  |
1252956 | NONSYN | T:9 G:125 | G:37 | Â | Â | ttaaagaataa | DNA topoisomerase I |
 |  |  |  | gi 87162241 ref | 319 | SMDNVVTVGSTD |  |
 |  |  |  |  |  | SM NVVTVGSTD |  |
 |  |  |  |  |  | SMYNVVTVGSTD | lantibiotic epidermin leader |
 |  |  |  | SRR022865_97728 | 2 | tataggaggtag |  |
1948255 | NONSYN | A:5 C:169 | C:37 | Â | Â | ctaattctgcca | peptide processing serine |
 |  |  |  |  |  | tgctctaaatat | protease EpiP |
1309034 | TRUNC | C:115 G:5 | C:37 | Query: 35 ASAGKKSSI*N | 3 b | Â | DNA mismatch repair protein MutS |
 |  |  |  | Sbjct: 754 ASAGKKSSISN | 764 |  |  |
 |  |  |  | gi 87161934 ref | 619 | QQANVELSPTSD |  |
 |  |  |  |  |  | Q+ANVELSPTSD |  |
 |  |  |  |  |  | QKANVELSPTSD |  |
 |  |  |  | SRR022865_10478 | 2 | cagaggtacatg |  |
950365 | NONSYN | A:5 C:113 | C:37 | Â | Â | aacatatgccca | Â |
 |  |  |  |  |  | ggttcgataaat | exonuclease RexB |
 |  |  |  | Query: 1 FK*YFKQFEENY | 36 |  |  |
 |  |  |  | FK YFKQFEENY |  |  |  |
 |  |  |  | Sbjct: 223 FKSYFKQFEENY | 234 |  |  |
2512836 | TRUNC | C:7 G:115 | G:37 | Â | Â | Â | sensor histidine kinase |
 |  |  |  | Query: 3 Q*IINDEVDIG | 35 |  |  |
 |  |  |  | Q IINDEVDIG |  |  | LysR family transcriptional regulator |
2678195 | TRUNC | A:5 G:92 | G:37 | Sbjct: 137 QQIINDEVDIG | 147 | Â | Â |