From: Analysis of oligonucleotide array experiments with repeated measures using mixed models
Gene | Â | Log2 based data | Overall P-value | Interaction P-value | Main effect of Disease | Main effect of Region | |||||||||
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 |  | OB | CER |  |  | P value | fold | dir | P value | fold | dir | ||||
 | Con | 12.68 | 12.73 | 12.83 | 12.37 | 12.34 | 12.53 |  |  |  |  |  |  |  |  |
 |  | 12.75 ± 0.08 | 12.41 ± 0.10 |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||
HMGN2 |  |  |  |  |  |  |  | 0.0003 | 0.6462 | 0.0009* | 0.63 | D | 0.011†| 1.24 | N |
 | AD | 12.01 | 11.94 | 12.16 | 11.53 | 12.04 | 11.81 |  |  |  |  |  |  |  |  |
 |  | 12.04 ± 0.11 | 11.79 ± 0.26 |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||
 | Con | 10.44 | 10.22 | 10.26 | 10.09 | 10.16 | 9.80 |  |  |  |  |  |  |  |  |
 |  | 10.31 ± 0.12 | 10.02 ± 0.19 |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||
TSG101 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 0.0002 | 0.0726 | 0.0021* | 1.51 | I | 0.056 | 1.42 | N |
 | AD | 11.20 | 11.01 | 10.96 | 10.30 | 10.59 | 10.34 |  |  |  |  |  |  |  |  |
 |  | 11.06 ± 0.13 | 10.41 ± 0.16 |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||
 | Con | 11.49 | 10.91 | 10.83 | 12.56 | 12.47 | 12.62 |  |  |  |  |  |  |  |  |
 |  | 11.08 ± 0.36 | 12.55 ± 0.08 |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||
RELN | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 0.0025 | 0.8328 | 0.5004 | 0.92 | N | 0.0005* | 0.37 | D |
 | AD | 11.33 | 11.00 | 10.66 | 12.45 | 12.35 | 12.41 |  |  |  |  |  |  |  |  |
 |  | 11.00 ± 0.34 | 12.41 ± 0.06 |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||
 | Con | 14.01 | 14.54 | 13.89 | 13.21 | 13.34 | 12.74 |  |  |  |  |  |  |  |  |
 |  | 14.15 ± 0.35 | 13.10 ± 0.32 |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||
B2M | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 0.0011 | 0.3767 | 0.5986 | 0.94 | N | 0.0002* | 2.20 | I |
 | AD | 14.03 | 13.84 | 14.47 | 12.70 | 12.88 | 13.06 |  |  |  |  |  |  |  |  |
 |  | 14.11 ± 0.32 | 12.88 ± 0.18 |  |  |  |  |  |  |  |  |