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Table 9 Order/Disorder-based Amino Acid Properties (Child Properties)

From: Protein disorder prediction by condensed PSSM considering propensity for order or disorder

Property

I

L

V

C

A

G

M

F

Y

W

H

K

R

E

Q

D

N

S

T

P

Hydrophobic O

Y

Y

Y

Y

   

Y

Y

Y

        

Y

 

Hydrophobic D

    

Y

Y

Y

   

Y

Y

        

Polar O

        

Y

Y

  

Y

   

Y

 

Y

 

Polar D

          

Y

Y

 

Y

Y

Y

 

Y

  

Small O

  

Y

Y

            

Y

 

Y

 

Small D

    

Y

Y

         

Y

 

Y

 

Y

Aliphatic O *

Y

Y

Y

                 

Aromatic O

       

Y

Y

Y

          

Aromatic D #

          

Y

         

Positive O #

            

Y

       

Positive D

          

Y

Y

        

Negative D *

             

Y

 

Y

    

Proline D * #

                   

Y

Charged O #

            

Y

       

Charged D

          

Y

Y

 

Y

 

Y

    

Tiny O #

   

Y

                

Tiny D

    

Y

Y

           

Y

  
  1. * Aliphatic O , Negative D , and Proline D are equivalent to Aliphatic, Negative, and Proline in Table 8, respectively.
  2. # Aromatic D , Positive O , Proline D , Charged O , and Tiny O each comprises only a single type of amino acid.
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BMC Bioinformatics

ISSN: 1471-2105

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