A constrained polynomial regression procedure for estimating the local False Discovery Rate

BMC Bioinformatics

Table 3 Estimated RMISE for the five estimators in each independent simulated case.

Case	m	π ₀	Configuration	polfdr	twilight	LocalFDR	pava.fdr	locfdr
1	500	0.6	(a)	0.071	0.093	0.194	0.136	0.208
2			(b)	0.157	0.155	0.235	0.121	0.340
3			(c)	0.118	0.122	0.221	0.090	0.279
4		0.8	(a)	0.067	0.085	0.187	0.122	0.144
5			(b)	0.095	0.094	0.201	0.087	0.193
6			(c)	0.083	0.089	0.194	0.091	0.157
7		0.9	(a)	0.089	0.085	0.180	0.112	0.076
8			(b)	0.080	0.081	0.178	0.090	0.110
9			(c)	0.075	0.088	0.183	0.106	0.078
10		0.98	(a)	0.093	0.106	0.172	0.089	0.043
11			(b)	0.078	0.100	0.170	0.077	0.045
12			(c)	0.081	0.098	0.170	0.079	0.044
13	5,000	0.6	(a)	0.036	0.040	0.061	0.191	0.234
14			(b)	0.149	0.153	0.152	0.133	0.343
15			(c)	0.101	0.113	0.117	0.037	0.278
16		0.8	(a)	0.029	0.047	0.060	0.088	0.119
17			(b)	0.069	0.077	0.087	0.056	0.185
18			(c)	0.052	0.071	0.074	0.032	0.143
19		0.9	(a)	0.048	0.056	0.060	0.054	0.056
20			(b)	0.041	0.050	0.065	0.037	0.099
21			(c)	0.039	0.063	0.063	0.035	0.064
22		0.98	(a)	0.042	0.069	0.062	0.027	0.021
23			(b)	0.035	0.031	0.056	0.023	0.029
24			(c)	0.039	0.052	0.060	0.025	0.023

ISSN: 1471-2105