From: Using Generalized Procrustes Analysis (GPA) for normalization of cDNA microarray data
Method | 5%(1) | 10%(1) | 30%(1) | |||
---|---|---|---|---|---|---|
 | ν (2) | β (2) | ν | β | ν | β |
Raw | 1.677 | 0.06525 | 1.678 | 0.08937 | 1.773 | 0.1615 |
Global | 0.6751 | 0.06319 | 0.4611 | 0.08158 | 0.5158 | 0.1697 |
Loess | 0.2089 | 0.05962 | 0.1863 | 0.07056 | 0.1891 | 0.1642 |
Scale | 1.273 | 0.06859 | 1.145 | 0.09515 | 1.368 | 0.1921 |
Quantile | 0.2546 | 0.06579 | 0.2085 | 0.07702 | 0.2167 | 0.1825 |
VSN | 0.2331 | 0.05441 | 0.177 | 0.06695 | 0.2014 | 0.1573 |
GPA | 0.08605 | 0.04569 | 0.09839 | 0.06639 | 0.1063 | 0.1328 |
Global+Scale | 0.5449 | 0.06481 | 0.3928 | 0.08096 | 0.4448 | 0.1851 |
Global+Quantile | 0.08674 | 0.04529 | 0.2085 | 0.07702 | 0.2167 | 0.1825 |
Global+GPA | 0.2546 | 0.06579 | 0.09967 | 0.06784 | 0.107 | 0.13 |
Loess+Scale | 0.1846 | 0.06 | 0.171 | 0.06968 | 0.1788 | 0.161 |
Loess+Quantile | 0.2055 | 0.06124 | 0.1852 | 0.07132 | 0.1895 | 0.1638 |
Loess+GPA | 0.1324 | 0.0536 | 0.1221 | 0.06078 | 0.1291 | 0.1468 |