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Table 1 Content of the three NUCOCOG databases

From: Extension of the COG and arCOG databases by amino acid and nucleotide sequences

  NUCOCOG arNUCOCOG NUCOCOG_2
domain sequences 144,320 81,616 204,890
Nucleotides 142,675,176 72,324,636 195,633,198
stop codons 94 62 115
a. a. a.: B 41 - 41
a. a. a.: U 24 27 42
a. a. a.: X 1,243 89 1,288
a. a. a.: Z 12 - 12
a. n.: b 9 - 9
a. n.: d 9 - 9
a. n.: h 4 - 4
a. n.: k 189 - 189
a. n.: m 163 3 164
a. n.: n 195 110 301
a. n.: r 328 1 328
a. n.: s 258 - 258
a. n.: v 7 - 7
a. n.: w 113 - 113
a. n.: y 660 3 660
  1. The abbreviations used are a. a. a. for ambiguous amino acids and a. n. for ambiguous nucleotides.
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