From: Red: an intelligent, rapid, accurate tool for detecting repeats de-novo on the genomic scale
Location | Copy number | Length | Sequence |
---|---|---|---|
chr1:242110361–242110392 | 56058 | 31 | ACATTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCA |
chr2:119996761–119996800 | 51817 | 39 | TCAATTGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCA |
chr9:61982576–61982619 | 2292 | 43 | TTGGGATTTCAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCAGCATTGCT |
chrX:129964870–129964913 | 1344 | 43 | TGTGTGTGGGTCTGTGTGTGAGAGAGAGAAAGAGAGAAACATG |
chr16:55969556–55969604 | 1327 | 48 | GTACATATATATACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATAAATTA |
chr19:20397318–20397528 | 324 | 210 | GCTTTGTTACAGTATTGGTTTCTGTCCACTATGAATTCTCTTATGTTTAT |
 |  |  | TGAAGTCTGAGGACCAGTTAAAAGCTTTGCCACATTCTTCACATTTGCAA |
 |  |  | GGTTTCTCTCCAGTATGAATTGTCTTATATTCACTTAGAGTTGAGGATGC |
 |  |  | AGTAAAGGCTTTGCCACATTCTTCACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTAT |
 |  |  | GAGTTCTCCT |
chr10:38932814–38933047 | 73 | 233 | ACTAGGGTAGGTAATTTCATCTCAGTCTTATGCAGGTACCTTTTCTCAGG |
 |  |  | ATCTCAGGAATGCAGACTTCTCACACTTCTGTTCTTTTCCTGGCTGTGTT |
 |  |  | GGTGAGCTCAGTGATATTCCTCCATCACCTTCAAGAGCAGTTTTGTTTTG |
 |  |  | TTTTTCCTGTTTTCATACTCCCAGCATCAGGAGTGTTCTAGGTGTGTCAG |
 |  |  | TTTTTGTTACCTTCCCCTACATATTAAGTGGAA |
chr18:79830653–79831758 | 15a | 1105 | TTCCCTGCGGACAGAGCCTTTGTCAGGAGGGTTCCCTGCAGACAGAGCCT |
 |  |  | TCGTCAGGAGGGTTCCCTGCAGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTG |
 |  |  | CGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAG |
 |  |  | GAGGGTTCCCTGCATACAGAGCCTTCGTCAGGAGCGTTCTCTGCGGACAG |
 |  |  | AGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCATACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTT |
 |  |  | CCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTC |
 |  |  | GTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCG |
 |  |  | GACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGA |
 |  |  | GGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAG |
 |  |  | CCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCC |
 |  |  | CTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGT |
 |  |  | CAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGA |
 |  |  | CAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGG |
 |  |  | GTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCC |
 |  |  | TTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCT |
 |  |  | GCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCA |
 |  |  | GGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACA |
 |  |  | GAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGGAGCGT |
 |  |  | GCCCTGCGTACAGAGCCTTCGTCAGGAGCGTGCCCTGCGTACAGAGCCTT |
 |  |  | CGTCAGGAGCGTGCCCTGCGTACAGAGCCTTCGTCAGGAGCGTGCCCTGC |
 |  |  | GGACAGAGCCTTCGTCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCGTCAGG |
 |  |  | AGGGTTCCCTGCGGACAGAGCCTTCATCAGGAGGGTTCCCTGCGGACAGA |
 |  |  | GCCTT |