Skip to main content

Table 3 The empirical type I errors of KW, Z R , Z A , MAX3, and TPP when the error term follows tGEV(0,0,5,0)

From: A two-phase procedure for non-normal quantitative trait genetic association study

  α=0.05   α=0.001
MAF KW Z R Z A MAX3 TPP   KW Z R Z A MAX3 TPP
0.05 0.049 0.031 0.057 0.032 0.043   0.00064 0.00035 0.00114 0.00078 0.00082
0.10 0.051 0.055 0.047 0.045 0.047   0.00076 0.00040 0.00092 0.00062 0.00060
0.15 0.049 0.055 0.051 0.057 0.050   0.00098 0.00062 0.00092 0.00070 0.00080
0.20 0.046 0.048 0.051 0.045 0.041   0.00098 0.00088 0.00094 0.00102 0.00092
0.25 0.058 0.049 0.052 0.058 0.050   0.00090 0.00074 0.00076 0.00088 0.00068
0.30 0.057 0.054 0.049 0.058 0.044   0.00112 0.00084 0.00088 0.00114 0.00086
0.35 0.056 0.052 0.051 0.055 0.047   0.00090 0.00086 0.00098 0.00090 0.00080
0.40 0.052 0.048 0.045 0.050 0.038   0.00114 0.00100 0.00082 0.00106 0.00070
0.45 0.048 0.049 0.054 0.057 0.043   0.00090 0.00086 0.00090 0.00108 0.00074
0.50 0.052 0.050 0.044 0.044 0.034   0.00078 0.00080 0.00068 0.00090 0.00064
  1. The sample size is 1,500. The left panel is for the significant level α=0.05 and the right panel is for the significant level α=0.001