BMC Bioinformatics

Table 3 The empirical type I errors of KW, Z _R, Z _A, MAX3, and TPP when the error term follows tGEV(0,0,5,0)

From: A two-phase procedure for non-normal quantitative trait genetic association study

	α=0.05						α=0.001
MAF	KW	Z _R	Z _A	MAX3	TPP		KW	Z _R	Z _A	MAX3	TPP
0.05	0.049	0.031	0.057	0.032	0.043		0.00064	0.00035	0.00114	0.00078	0.00082
0.10	0.051	0.055	0.047	0.045	0.047		0.00076	0.00040	0.00092	0.00062	0.00060
0.15	0.049	0.055	0.051	0.057	0.050		0.00098	0.00062	0.00092	0.00070	0.00080
0.20	0.046	0.048	0.051	0.045	0.041		0.00098	0.00088	0.00094	0.00102	0.00092
0.25	0.058	0.049	0.052	0.058	0.050		0.00090	0.00074	0.00076	0.00088	0.00068
0.30	0.057	0.054	0.049	0.058	0.044		0.00112	0.00084	0.00088	0.00114	0.00086
0.35	0.056	0.052	0.051	0.055	0.047		0.00090	0.00086	0.00098	0.00090	0.00080
0.40	0.052	0.048	0.045	0.050	0.038		0.00114	0.00100	0.00082	0.00106	0.00070
0.45	0.048	0.049	0.054	0.057	0.043		0.00090	0.00086	0.00090	0.00108	0.00074
0.50	0.052	0.050	0.044	0.044	0.034		0.00078	0.00080	0.00068	0.00090	0.00064

The sample size is 1,500. The left panel is for the significant level α=0.05 and the right panel is for the significant level α=0.001

Back to article page

ISSN: 1471-2105

Contact us

General enquiries: journalsubmissions@springernature.com