Table 3 Average AUCs scores of gene prioritization on test set and validation set

AUC20

AUC50

AUC100

AUC20

AUC50

AUC100

CIPHER_SP

0.0029^*

0.0046^*

0.0066^*

0

0

0

CIPHER_DN

0.0015^*

0.0027^*

0.0042^*

0

0

0

RWR

0.0075^*

0.0178^*

0.0283^*

0.0233

0.0358

0.0475

DK

0.0192^*

0.0255^*

0.0294^*

0.0211

0.0306

0.0399

RWRH

0.0916^*

0.1250^*

0.1664^*

0.2009

0.2724

0.3288

MINProp

0.0771^*

0.1266^*

0.1799^*

0.1963

0.2625

0.3104

BiRW

0.0421^*

0.0780^*

0.1142^*

0.1544

0.2180

0.26672

PRINCE

0.1117

0.1468

0.2088

0.1433

0.2137

0.2715

IDLP-G

0.0040^*

0.0076^*

0.0166^*

0.0189

0.0348

0.0519

IDLP-P

0.1051^*

0.1457

0.1897

0.2003

0.2592

0.3010

IDLP

0.1123

0.1492

0.1909

0.2004

0.2572

0.2990