Table 4 The structure of DEEPSEN-4L
From: DEEPSEN: a convolutional neural network based method for super-enhancer prediction
Layer | Size | Output Shape |
|---|---|---|
Input | Â | 36 Ă—1 |
Convo1 | 32 Ă—3Ă—1 | 32 Ă—36Ă—1 |
Pool1 | 1 Ă—3 | 32 Ă—12Ă—1 |
Convo2 | 64 Ă—3Ă—1Ă—32 | 64 Ă—12Ă—1 |
Pool2 | 1 Ă—3 | 64 Ă—4Ă—1 |
Convo3 | 128 Ă—3Ă—1Ă—64 | 128 Ă—4Ă—1 |
Pool3 | 1 Ă—2 | 128 Ă—2Ă—1 |
Convo4 | 256 Ă—3Ă—1Ă—128 | 256 Ă—2Ă—1 |
Pool4 | 1 Ă—2 | 256 Ă—1Ă—1 |
Full-connected | 256 | 64 |
softmax | 64 | 2 |