NmSEER V2.0: a prediction tool for 2′-O-methylation sites based on random forest and multi-encoding combination

BMC Bioinformatics

Table 2 AUPRC comparison among seven algorithms based on multi-encodings by independent test

Algorithm\Encoding	One-hot	PSNSP	PSDSP	KNF	KSNPF
RF	0.191	0.177	0.240	0.102	0.095
LR	0.073	0.077	0.153	0.066	0.067
GaussianNB	0.071	0.075	0.150	0.052	0.032
Adaboost	0.070	0.075	0.192	0.058	0.056
SVM	0.178	0.113	0.178	0.041	0.095
MLP	0.159	0.087	0.226	0.064	0.085
CNN	0.145	0.090	0.189	0.064	0.033
RF (1:1 training set)	0.155	0.149	0.211	0.089	0.096

ISSN: 1471-2105