Multiple phenotype association tests based on sliced inverse regression

Sun, Wenyuan; Jon, Kyongson; Zhu, Wensheng

doi:10.1186/s12859-024-05731-8

BMC Bioinformatics

Table 2 Empirical type I errors based on 100,000 replicates in Scenario 1

From: Multiple phenotype association tests based on sliced inverse regression

n	k	q	\(\rho \)	SIR	SIR-S	PCA1	PCFisher	PCMinp	PCLC	Wald	WI	\(\textrm{VC}\)	\(\textrm{PCAQ}\)
1000	5	5	0	0.05133	0.05156	0.04981	0.04669	0.05011	0.04989	0.04890	0.04766	0.04887	0.04709
			0.2	0.05284	0.05011	0.04824	0.04807	0.04078	0.04882	0.04800	0.04888	0.04740	0.04902
			0.5	0.05367	0.04898	0.04856	0.04818	0.04219	0.04923	0.04891	0.04954	0.04788	0.04980
			0.7	0.05105	0.04920	0.05109	0.04854	0.04679	0.04997	0.04967	0.05144	0.04962	0.05066
	5	10	0	0.05518	0.04927	0.04860	0.04966	0.05478	0.04841	0.04978	0.04988	0.04982	0.04974
			0.2	0.05372	0.05145	0.04908	0.05701	0.04920	0.04908	0.04962	0.04935	0.05015	0.05016
			0.5	0.04887	0.05219	0.05491	0.05031	0.04958	0.05088	0.04895	0.05011	0.05055	0.05067
			0.7	0.05250	0.05296	0.04897	0.05028	0.04835	0.05013	0.04882	0.04984	0.04975	0.04578
	10	5	0	0.05197	0.05709	0.05043	0.04851	0.04846	0.04835	0.04965	0.04906	0.04904	0.05030
			0.2	0.05065	0.05202	0.04998	0.05056	0.04889	0.05468	0.05103	0.04923	0.05020	0.05156
			0.5	0.05091	0.05305	0.04991	0.05024	0.04856	0.04963	0.05203	0.04785	0.04912	0.04947
			0.7	0.05026	0.05296	0.05016	0.04975	0.04383	0.04882	0.04816	0.04983	0.04237	0.04637
	10	10	0	0.05463	0.05097	0.49231	0.04812	0.04976	0.04975	0.04943	0.04841	0.04458	0.04947
			0.2	0.04974	0.04869	0.05021	0.04854	0.05004	0.05002	0.04955	0.04685	0.04857	0.04857
			0.5	0.05122	0.05124	0.05225	0.04874	0.04954	0.04966	0.04715	0.04793	0.04886	0.04789
			0.7	0.05098	0.05014	0.04847	0.04994	0.04759	0.05207	0.04864	0.05305	0.04980	0.04262
2000	5	5	0	0.05035	0.05193	0.05109	0.04988	0.04927	0.05023	0.04987	0.04699	0.04788	0.04998
			0.2	0.05254	0.05025	0.05024	0.04932	0.04366	0.04982	0.04769	0.04708	0.04903	0.04078
			0.5	0.05173	0.05097	0.05204	0.04872	0.04018	0.04897	0.04829	0.04908	0.04874	0.05003
			0.7	0.05018	0.05164	0.05208	0.04996	0.04579	0.04760	0.04887	0.05035	0.04878	0.04978
	5	10	0	0.05087	0.05597	0.04845	0.05701	0.04920	0.04877	0.04950	0.04981	0.04978	0.04788
			0.2	0.04975	0.05348	0.04831	0.05136	0.04798	0.05004	0.04698	0.04983	0.04827	0.04516
			0.5	0.05429	0.05607	0.04985	0.04879	0.04876	0.05190	0.04623	0.04637	0.04983	0.04792
			0.7	0.05052	0.05375	0.04812	0.04941	0.04791	0.05033	0.04682	0.04784	0.04813	0.04507
	10	5	0	0.05308	0.05469	0.05039	0.04793	0.04985	0.04955	0.04957	0.04875	0.04775	0.04778
			0.2	0.05246	0.05325	0.04831	0.04839	0.04947	0.04976	0.05012	0.04975	0.04337	0.04642
			0.5	0.05108	0.05198	0.05017	0.04884	0.04761	0.04383	0.04858	0.04953	0.04435	0.04936
			0.7	0.05073	0.05206	0.04994	0.04965	0.04879	0.04898	0.04838	0.04962	0.04332	0.04642
	10	10	0	0.05180	0.05249	0.04972	0.05089	0.05018	0.04886	0.04954	0.04874	0.04648	0.05260
			0.2	0.05455	0.05167	0.04886	0.04787	0.04956	0.04632	0.04989	0.04847	0.04887	0.05105
			0.5	0.05223	0.05228	0.04975	0.04897	0.04587	0.04958	0.05003	0.04996	0.04989	0.04988
			0.7	0.05042	0.05175	0.04847	0.04434	0.04989	0.05411	0.04885	0.05305	0.04880	0.05062

Back to article page

ISSN: 1471-2105

Contact us

General enquiries: journalsubmissions@springernature.com