Multiple phenotype association tests based on sliced inverse regression

BMC Bioinformatics

Table 6 Empirical type I errors based on 100,000 replicates in Scenario 3

k	q	\(\rho \)	SIR	SIR-S	PCA1	PCFisher	PCMinp	PCLC	Wald	WI	VC	PCAQ
40	50	0.0	0.04997	0.05142	0.05063	0.05189	0.04991	0.05029	0.04945	0.04879	0.04857	0.04997
		0.2	0.04895	0.05149	0.05157	0.04994	0.04845	0.04772	0.05022	0.05015	0.05107	0.05541
		0.5	0.05007	0.05057	0.05036	0.04734	0.05048	0.04951	0.05005	0.05302	0.05235	0.05326
		0.7	0.04989	0.05503	0.05091	0.05196	0.04980	0.04979	0.05076	0.04780	0.04993	0.04892
40	100	0.0	0.05167	0.05277	0.05494	0.04556	0.04956	0.04860	0.04956	0.04859	0.04877	0.05196
		0.2	0.04783	0.05167	0.04799	0.05147	0.05064	0.04958	0.04991	0.04703	0.04995	0.04986
		0.5	0.05105	0.05198	0.04875	0.04889	0.04962	0.04938	0.04855	0.04974	0.04978	0.04884
		0.7	0.05263	0.05135	0.04964	0.04879	0.05083	0.05045	0.04953	0.04820	0.04946	0.05278
100	50	0.0	0.05246	0.05205	0.04870	0.04569	0.04862	0.04974	0.04675	0.04687	0.04788	0.04967
		0.2	0.05076	0.05130	0.04886	0.04568	0.04787	0.04987	0.04873	0.05044	0.04656	0.04968
		0.5	0.05042	0.05178	0.04978	0.04467	0.04874	0.04956	0.04479	0.04870	0.04873	0.04994
		0.7	0.05201	0.05161	0.04874	0.04676	0.04979	0.05213	0.04678	0.04835	0.04658	0.05016
100	100	0.0	0.04982	0.05216	0.05033	0.04984	0.04989	0.05225	0.04863	0.04782	0.04659	0.04893
		0.2	0.04953	0.05573	0.05105	0.04882	0.04963	0.05195	0.04986	0.04983	0.04674	0.04942
		0.5	0.05014	0.05436	0.05073	0.04836	0.05127	0.05285	0.04983	0.04976	0.04734	0.04971
		0.7	0.04947	0.05174	0.04994	0.04903	0.04957	0.05316	0.05158	0.04994	0.04605	0.04996

ISSN: 1471-2105